56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3091 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3091  anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 111 aa  220  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1593  anti-sigma-28 factor, FlgM  72.32 
 
 		 109 aa  155  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.776768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1336  anti-sigma-28 factor, FlgM  59.65 
 
 		 105 aa  124  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.156466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1412  anti-sigma-28 factor, FlgM  61.95 
 
 		 107 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3104  anti-sigma-28 factor, FlgM  61.95 
 
 		 107 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2966  anti-sigma-28 factor, FlgM  61.95 
 
 		 107 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.968675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2951  anti-sigma-28 factor, FlgM  61.95 
 
 		 107 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232172  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3254  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  55.86 
 
 		 106 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2322  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  76.47 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.485828  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1341  anti-sigma-28 factor, FlgM  65.77 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1317  anti-sigma-28 factor, FlgM  58.56 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293254 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1255  anti-sigma-28 factor, FlgM  58.56 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1299  anti-sigma-28 factor, FlgM  60.91 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1325  anti-sigma-28 factor, FlgM  57.66 
 
 		 108 aa  100  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2601  anti-sigma-28 factor, FlgM  58.77 
 
 		 107 aa  100  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1157  anti-sigma-28 factor, FlgM  59.46 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.908831  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1472  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  43.93 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4255  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.14 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1796  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  36.89 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01280  hypothetical protein  43.53 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004177  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  45.33 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1066  anti-sigma-28 factor, FlgM  42.35 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0281674  normal  0.0736729 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3488  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.71 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.840831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20730  hypothetical protein  32.71 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1213  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  32.71 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3104  anti-sigma-28 factor, FlgM  46.38 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534727  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2854  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.43 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.530474  normal  0.232099 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02934  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  49.21 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663161  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1779  hypothetical protein  33.64 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1174  anti-sigma-28 factor, FlgM  31.19 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353424  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1925  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  32.71 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.434044  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3736  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.26 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3956  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.69 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2684  anti-sigma-28 factor, FlgM  50 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.41781  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1541  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.48 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1639  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  37.18 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.220328  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4395  anti-sigma-28 factor, FlgM  30.77 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1459  anti-sigma-28 factor, FlgM  30.77 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0889  anti-sigma-28 factor, FlgM  27.78 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0850823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5623  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.95 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01016  flagellar protein  32.89 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06150  flagellar protein  32.89 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000341477  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0939  hypothetical protein  37.25 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0969  hypothetical protein  37.25 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2342  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, anti-sigma28 factor  44.44 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.449707  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1909  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  27.87 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555559  normal  0.158939 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0524  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.78 
 
 		 103 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1790  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.48 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0303  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.84 
 
 		 90 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1952  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.99 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0747  hypothetical protein  31.46 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2926  anti-sigma-28 factor, FlgM  30.49 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2246  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.47 
 
 		 97 aa  41.2  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.725172  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0674  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.1 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.054608 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3796  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.72 
 
 		 117 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0245  anti-sigma-28 factor, FlgM  30.51 
 
 		 99 aa  40  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>