38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1909 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1909  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 101 aa  202  9e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555559  normal  0.158939 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06150  flagellar protein  52.83 
 
 		 103 aa  96.7  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000341477  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01016  flagellar protein  52.83 
 
 		 103 aa  96.7  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1174  anti-sigma-28 factor, FlgM  33.33 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353424  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004177  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  29.03 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01280  hypothetical protein  29.03 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1796  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  27.42 
 
 		 107 aa  50.8  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2322  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  30.65 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.485828  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3488  anti-sigma-28 factor, FlgM  30.95 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.840831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1658  anti-sigma-28 factor, FlgM  28.57 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3956  anti-sigma-28 factor, FlgM  28.57 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1779  hypothetical protein  28.57 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1459  anti-sigma-28 factor, FlgM  28.57 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4395  anti-sigma-28 factor, FlgM  28.57 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20730  hypothetical protein  27.27 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2854  anti-sigma-28 factor, FlgM  29.49 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.530474  normal  0.232099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4255  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.26 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1593  anti-sigma-28 factor, FlgM  31.15 
 
 		 109 aa  47.4  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.776768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1336  anti-sigma-28 factor, FlgM  27.54 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.156466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3841  Anti-sigma-28 factor FlgM family protein  28.72 
 
 		 100 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00326583 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3736  anti-sigma-28 factor, FlgM  28.57 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02934  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  29.85 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663161  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0889  anti-sigma-28 factor, FlgM  38 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0850823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1213  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  26.58 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1925  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  30.51 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.434044  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3254  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  27.87 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3470  hypothetical protein  32.91 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.536588  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2736  anti-sigma-28 factor, FlgM  47.37 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000266451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3091  anti-sigma-28 factor, FlgM  27.87 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3973  hypothetical protein  31.94 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1472  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  26.67 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0922  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.88 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2238  hypothetical protein  32.73 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0348656 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3757  negative regulator of flagellin synthesis  25.26 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0395  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  32.39 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.578718  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1066  anti-sigma-28 factor, FlgM  28.81 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0281674  normal  0.0736729 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1541  anti-sigma-28 factor, FlgM  28.79 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0635  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  38.89 
 
 		 106 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>