13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0436 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0436  anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 97 aa  192  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3045  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  46.07 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2854  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.36 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.530474  normal  0.232099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4101  hypothetical protein  40.85 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.797416  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3757  negative regulator of flagellin synthesis  43.08 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3841  Anti-sigma-28 factor FlgM family protein  36.84 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00326583 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3488  anti-sigma-28 factor, FlgM  39.13 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.840831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1151  putative anti-sigma-28 factor FlgM  36.67 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4255  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.67 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20730  hypothetical protein  36.47 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2286  anti-sigma-28 factor, FlgM  43.86 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00124858  normal  0.217258 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3956  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.64 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0498  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.18 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000267132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>