44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4598 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4598  anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 100 aa  197  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.713529  normal  0.15799 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2946  anti-sigma-28 factor, FlgM  42.2 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3796  anti-sigma-28 factor, FlgM  46.43 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0138  anti-sigma-28 factor, FlgM  56 
 
 		 117 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.923498 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2937  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  54.84 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.345651  normal  0.266234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3072  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  54.84 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3046  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  51.61 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15834 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3027  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  51.61 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.290986  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2413  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  51.61 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0238  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  50.88 
 
 		 114 aa  57  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2991  putative negative regulator of flagellin synthesis FlgM  49.18 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3322  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  49.18 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2102  putative negative regulator of flagellin synthesis FlgM  49.18 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0264  flagellar biosynthesis regulator protein FlgM  49.18 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0276  flagellar biosynthesis regulator protein FlgM  49.18 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3357  putative negative regulator of flagellin synthesis FlgM  49.18 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.456882  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3022  anti-sigma-28 factor, FlgM  50 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0460  negative regulator of flagellin synthesis  49.18 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6373  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  51.02 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222883  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0340  negative regulator of flagellin synthesis (anti-sigma-28 factor) protein  53.49 
 
 		 106 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.284409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3075  negative regulator of flagellin synthesis (anti-s28 factor)  40 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.461461 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1980  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.23 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3825  anti-sigma-28 factor, FlgM  48.84 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.252415 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4201  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.74 
 
 		 61 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3098  anti-sigma-28 factor, FlgM  48.84 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.378515  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5623  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.57 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1866  anti-sigma28 factor FlgM  47.37 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.625081  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1551  anti-sigma28 factor FlgM  36.25 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4418  anti-sigma-28 factor, FlgM  46.15 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2600  anti-sigma28 factor FlgM  37.5 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275979  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2736  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.07 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000266451 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1639  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  29.25 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.220328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1585  anti-sigma28 factor FlgM  45 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2427  anti-sigma28 factor FlgM  35.37 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.111558  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1996  anti-sigma28 factor FlgM  35.37 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2327  anti-sigma28 factor FlgM  35.37 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.41233  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4793  anti-sigma-28 factor, FlgM  46.51 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.288122 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1952  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.69 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3716  anti-sigma-28 factor, FlgM  46.51 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.452554  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3732  anti-sigma-28 factor FlgM  41.3 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1523  anti-sigma-28 factor, FlgM  45.45 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1317  anti-sigma-28 factor, FlgM  42.11 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.386062  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1796  negative regulator of flagellin synthesis FlgM  33.72 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23980  Anti-sigma-28 factor  31 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>