40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2327 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2427  anti-sigma28 factor FlgM  100 
 
 		 100 aa  201  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.111558  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1996  anti-sigma28 factor FlgM  100 
 
 		 100 aa  201  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2327  anti-sigma28 factor FlgM  100 
 
 		 100 aa  201  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.41233  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1866  anti-sigma28 factor FlgM  64.29 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.625081  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2600  anti-sigma28 factor FlgM  66.32 
 
 		 98 aa  120  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275979  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1551  anti-sigma28 factor FlgM  62.24 
 
 		 99 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2972  anti-sigma28 factor FlgM  62.64 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.37231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2200  anti-sigma28 factor FlgM  58.59 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2016  anti-sigma28 factor FlgM  58.59 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1240  anti-sigma28 factor FlgM  58.59 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.813304  normal  0.140195 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1284  anti-sigma28 factor FlgM  58.59 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.281366  normal  0.146528 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1269  anti-sigma28 factor FlgM  58.59 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0199272 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2529  anti-sigma28 factor FlgM  57.14 
 
 		 97 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.491687  normal  0.0344383 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01075  hypothetical protein  57.14 
 
 		 97 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01067  anti-sigma factor for FliA (sigma 28)  57.14 
 
 		 97 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1194  anti-sigma28 factor FlgM  57.14 
 
 		 97 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1194  anti-sigma28 factor FlgM  57.14 
 
 		 97 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2575  anti-sigma-28 factor, FlgM  57.14 
 
 		 97 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.420972  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1585  anti-sigma28 factor FlgM  55.06 
 
 		 115 aa  95.9  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1450  anti-sigma28 factor FlgM  57.58 
 
 		 97 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147232 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2058  anti-sigma28 factor FlgM  57.14 
 
 		 97 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2255  anti-sigma28 factor FlgM  48.21 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1523  anti-sigma-28 factor, FlgM  50.55 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1980  anti-sigma-28 factor, FlgM  42 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3796  anti-sigma-28 factor, FlgM  45.33 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2946  anti-sigma-28 factor, FlgM  41.67 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3357  putative negative regulator of flagellin synthesis FlgM  47.83 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.456882  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0264  flagellar biosynthesis regulator protein FlgM  47.83 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3322  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  47.83 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0460  negative regulator of flagellin synthesis  47.83 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0276  flagellar biosynthesis regulator protein FlgM  47.83 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2991  putative negative regulator of flagellin synthesis FlgM  47.83 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2102  putative negative regulator of flagellin synthesis FlgM  47.83 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0138  anti-sigma-28 factor, FlgM  53.33 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.923498 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0238  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  43.4 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3716  anti-sigma-28 factor, FlgM  58.33 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.452554  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4793  anti-sigma-28 factor, FlgM  58.33 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.288122 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1952  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.62 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4598  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.37 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.713529  normal  0.15799 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2926  anti-sigma-28 factor, FlgM  30.77 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>