46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2529 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2575  anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 97 aa  192  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.420972  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01067  anti-sigma factor for FliA (sigma 28)  100 
 
 		 97 aa  192  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01075  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  192  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2529  anti-sigma28 factor FlgM  100 
 
 		 97 aa  192  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.491687  normal  0.0344383 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1194  anti-sigma28 factor FlgM  100 
 
 		 97 aa  192  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1194  anti-sigma28 factor FlgM  100 
 
 		 97 aa  192  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1450  anti-sigma28 factor FlgM  98.97 
 
 		 97 aa  191  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147232 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2200  anti-sigma28 factor FlgM  80.41 
 
 		 97 aa  154  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2016  anti-sigma28 factor FlgM  80.41 
 
 		 97 aa  154  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1240  anti-sigma28 factor FlgM  80.41 
 
 		 97 aa  154  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.813304  normal  0.140195 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1284  anti-sigma28 factor FlgM  80.41 
 
 		 97 aa  154  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.281366  normal  0.146528 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1269  anti-sigma28 factor FlgM  80.41 
 
 		 97 aa  154  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0199272 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2058  anti-sigma28 factor FlgM  96.91 
 
 		 97 aa  154  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2255  anti-sigma28 factor FlgM  79.65 
 
 		 113 aa  153  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1585  anti-sigma28 factor FlgM  73.47 
 
 		 115 aa  134  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1866  anti-sigma28 factor FlgM  59.18 
 
 		 98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.625081  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2600  anti-sigma28 factor FlgM  60.87 
 
 		 98 aa  107  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275979  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2972  anti-sigma28 factor FlgM  59 
 
 		 108 aa  107  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.37231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2327  anti-sigma28 factor FlgM  60.2 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.41233  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1996  anti-sigma28 factor FlgM  60.2 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2427  anti-sigma28 factor FlgM  60.2 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.111558  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1551  anti-sigma28 factor FlgM  58.06 
 
 		 99 aa  103  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1523  anti-sigma-28 factor, FlgM  48 
 
 		 97 aa  90.1  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3796  anti-sigma-28 factor, FlgM  44.78 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0138  anti-sigma-28 factor, FlgM  51.06 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.923498 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3716  anti-sigma-28 factor, FlgM  42.86 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.452554  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4793  anti-sigma-28 factor, FlgM  42.86 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.288122 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2946  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.85 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0340  negative regulator of flagellin synthesis (anti-sigma-28 factor) protein  50 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.284409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0238  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  45.65 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0460  negative regulator of flagellin synthesis  45.24 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3357  putative negative regulator of flagellin synthesis FlgM  45.24 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.456882  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0276  flagellar biosynthesis regulator protein FlgM  45.24 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0264  flagellar biosynthesis regulator protein FlgM  45.24 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3322  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  45.24 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2102  putative negative regulator of flagellin synthesis FlgM  45.24 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3022  anti-sigma-28 factor, FlgM  31.43 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2991  putative negative regulator of flagellin synthesis FlgM  45.24 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1980  anti-sigma-28 factor, FlgM  52.94 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4598  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.16 
 
 		 100 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.713529  normal  0.15799 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2926  anti-sigma-28 factor, FlgM  45.95 
 
 		 99 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6373  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  35.92 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3046  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  34.31 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15834 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5623  anti-sigma-28 factor, FlgM  30 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3027  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  34.31 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.290986  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2413  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  34.31 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>