45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3027 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_2413  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 109 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3027  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 109 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.290986  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3046  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 108 aa  204  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15834 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3022  anti-sigma-28 factor, FlgM  80.36 
 
 		 112 aa  163  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6373  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  85.98 
 
 		 109 aa  159  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2937  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  87.04 
 
 		 109 aa  158  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.345651  normal  0.266234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3072  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  81.82 
 
 		 110 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3796  anti-sigma-28 factor, FlgM  49.55 
 
 		 117 aa  88.6  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2946  anti-sigma-28 factor, FlgM  50.93 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0138  anti-sigma-28 factor, FlgM  51.79 
 
 		 117 aa  87  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.923498 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3322  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  51.4 
 
 		 114 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3357  putative negative regulator of flagellin synthesis FlgM  51.4 
 
 		 114 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.456882  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0276  flagellar biosynthesis regulator protein FlgM  51.4 
 
 		 114 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0264  flagellar biosynthesis regulator protein FlgM  51.4 
 
 		 114 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2102  putative negative regulator of flagellin synthesis FlgM  51.4 
 
 		 114 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2991  putative negative regulator of flagellin synthesis FlgM  51.4 
 
 		 114 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0460  negative regulator of flagellin synthesis  51.4 
 
 		 114 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0238  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  50.94 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4598  anti-sigma-28 factor, FlgM  39.81 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.713529  normal  0.15799 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1952  anti-sigma-28 factor, FlgM  40.62 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5623  anti-sigma-28 factor, FlgM  35.51 
 
 		 102 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4793  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.19 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.288122 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3716  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.19 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.452554  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2600  anti-sigma28 factor FlgM  33.66 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275979  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1866  anti-sigma28 factor FlgM  32.67 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.625081  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1658  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.74 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1317  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.98 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.386062  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0340  negative regulator of flagellin synthesis (anti-sigma-28 factor) protein  51.06 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.284409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1639  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  34.31 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.220328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2926  anti-sigma-28 factor, FlgM  46.34 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0635  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  33.73 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1996  anti-sigma28 factor FlgM  34 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2327  anti-sigma28 factor FlgM  34 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.41233  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2427  anti-sigma28 factor FlgM  34 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.111558  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3732  anti-sigma-28 factor FlgM  37.5 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1269  anti-sigma28 factor FlgM  33.98 
 
 		 97 aa  43.9  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0199272 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1284  anti-sigma28 factor FlgM  33.98 
 
 		 97 aa  43.9  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.281366  normal  0.146528 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1240  anti-sigma28 factor FlgM  33.98 
 
 		 97 aa  43.9  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.813304  normal  0.140195 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2016  anti-sigma28 factor FlgM  33.98 
 
 		 97 aa  43.9  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2200  anti-sigma28 factor FlgM  33.98 
 
 		 97 aa  43.9  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142064 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1980  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.14 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3825  anti-sigma-28 factor, FlgM  42.11 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.252415 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3098  anti-sigma-28 factor, FlgM  42.11 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.378515  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1523  anti-sigma-28 factor, FlgM  36.73 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2972  anti-sigma28 factor FlgM  36.17 
 
 		 108 aa  42  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.37231  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>