38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3072 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_3072  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 110 aa  209  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2937  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  94.55 
 
 		 109 aa  170  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.345651  normal  0.266234 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3022  anti-sigma-28 factor, FlgM  79.46 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2413  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  87.16 
 
 		 109 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3027  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  87.16 
 
 		 109 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.290986  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3046  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  87.74 
 
 		 108 aa  154  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15834 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6373  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  87.74 
 
 		 109 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2946  anti-sigma-28 factor, FlgM  53.78 
 
 		 113 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3796  anti-sigma-28 factor, FlgM  51.75 
 
 		 117 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3322  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  53.98 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3357  putative negative regulator of flagellin synthesis FlgM  53.98 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.456882  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0276  flagellar biosynthesis regulator protein FlgM  53.98 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0264  flagellar biosynthesis regulator protein FlgM  53.98 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2102  putative negative regulator of flagellin synthesis FlgM  53.98 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2991  putative negative regulator of flagellin synthesis FlgM  53.98 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0138  anti-sigma-28 factor, FlgM  51.75 
 
 		 117 aa  89.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.923498 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0460  negative regulator of flagellin synthesis  53.98 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0238  negative regulator of flagellin synthesis FlgM, putative  64.79 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4598  anti-sigma-28 factor, FlgM  54.84 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.713529  normal  0.15799 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3716  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.1 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.452554  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4793  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.1 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.288122 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1952  anti-sigma-28 factor, FlgM  42.19 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1866  anti-sigma28 factor FlgM  33.33 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.625081  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2600  anti-sigma28 factor FlgM  33.33 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275979  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0340  negative regulator of flagellin synthesis (anti-sigma-28 factor) protein  32.69 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.284409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1639  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  34.91 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.220328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1523  anti-sigma-28 factor, FlgM  42.16 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5623  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.04 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1980  anti-sigma-28 factor, FlgM  46.81 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1317  anti-sigma-28 factor, FlgM  41.94 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.386062  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1551  anti-sigma28 factor FlgM  40.68 
 
 		 99 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0747  hypothetical protein  40.35 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4201  anti-sigma-28 factor, FlgM  37.74 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1269  anti-sigma28 factor FlgM  32.38 
 
 		 97 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0199272 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1284  anti-sigma28 factor FlgM  32.38 
 
 		 97 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.281366  normal  0.146528 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1240  anti-sigma28 factor FlgM  32.38 
 
 		 97 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.813304  normal  0.140195 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2016  anti-sigma28 factor FlgM  32.38 
 
 		 97 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2200  anti-sigma28 factor FlgM  32.38 
 
 		 97 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142064 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>