15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0190 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0190  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  100 
 
 		 97 aa  190  5e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2246  anti-sigma-28 factor, FlgM  38.55 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.725172  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3095  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.56 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1677  anti-sigma-28 factor, FlgM  31.25 
 
 		 95 aa  48.1  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2185  flgM family protein  42.31 
 
 		 102 aa  47.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2418  anti-sigma-28 factor, FlgM  39.06 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0245  anti-sigma-28 factor, FlgM  29.7 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0092  Anti-sigma-28 factor FlgM family protein  30.59 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0303  anti-sigma-28 factor, FlgM  34.25 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2238  hypothetical protein  36.9 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0348656 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0674  anti-sigma-28 factor, FlgM  32.61 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.054608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0767  anti-sigma-28 factor, FlgM  51.35 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0784  anti-sigma-28 factor, FlgM  48.65 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0638  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  26.09 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2438  putative anti-sigma-28 factor, FlgM  28.41 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>