78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1878 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1878  conserved hypothetical replication initiator and transcription repressor protein  100 
 
 		 285 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1288  conserved hypothetical replication initiator and transcription repressor protein  98.25 
 
 		 285 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1485  putative replication initiator and transcription repressor protein  97.54 
 
 		 289 aa  567  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2653  putative replication initiator and transcription repressor protein  96.84 
 
 		 285 aa  563  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.585943  normal  0.150321 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31110  putative replication initiator and transcriptional repressor protein  96.14 
 
 		 442 aa  564  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000673493  unclonable  2.75454e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1254  putative replication initiator and transcription repressor protein  97.19 
 
 		 285 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0838282 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3526  putative replication initiator and transcription repressor protein  87.72 
 
 		 285 aa  512  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528382  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0458  putative replication initiator and transcription repressor protein  87.02 
 
 		 285 aa  503  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.365909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2721  putative replication initiator and transcription repressor protein  85.26 
 
 		 285 aa  495  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0686  putative replication initiator and transcription repressor protein  88.64 
 
 		 281 aa  494  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3024  putative replication initiator and transcription repressor protein  85.26 
 
 		 285 aa  495  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2606  putative replication initiator and transcription repressor protein  87.55 
 
 		 281 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2933  putative replication initiator and transcription repressor protein  85.26 
 
 		 285 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2620  conserved hypothetical replication initiator and transcription repressor protein  88.36 
 
 		 282 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0239154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3731  replication protein A  87.18 
 
 		 285 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2329  putative replication initiator and transcription repressor protein  84.62 
 
 		 285 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35980  conserved hypothetical replication initiator and transcription repressor protein  84.62 
 
 		 295 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1985  putative replication initiator and transcription repressor protein  85.4 
 
 		 277 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397497  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1263  putative replication initiator and transcription repressor protein  82.52 
 
 		 285 aa  476  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4166  putative replication initiator and transcription repressor protein  80 
 
 		 283 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1142  putative replication initiator and transcription repressor protein  78.36 
 
 		 270 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3817  putative plasmid replication protein A  74.09 
 
 		 294 aa  408  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7731  putative plasmid replication protein A  74.81 
 
 		 292 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3908  putative replication protein A  73.31 
 
 		 293 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3184  replication protein A  70.11 
 
 		 391 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3076  replication protein A  69.74 
 
 		 386 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0710  replication protein A  68.86 
 
 		 386 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3347  putative replication protein A  72.18 
 
 		 293 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.632364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1512  replication protein A  69.26 
 
 		 390 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4015  replication protein A  68 
 
 		 384 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3015  replication protein A  68.98 
 
 		 391 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3531  replication protein A  69 
 
 		 386 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0674076  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1204  replication protein A  69 
 
 		 386 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0581  replication protein A  68.13 
 
 		 379 aa  374  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0547768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7431  putative replication protein A  68.7 
 
 		 351 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0846  replication protein A  67.65 
 
 		 287 aa  357  9e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0122468 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3370  putative replication protein A  68.08 
 
 		 289 aa  350  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0132  putative replication protein A  68.08 
 
 		 289 aa  350  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303306  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2086  Plasmid replication initiator protein-like protein  66.55 
 
 		 334 aa  349  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2624  putative replication protein A  67.92 
 
 		 294 aa  344  8e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1034  putative replication protein  64.07 
 
 		 351 aa  341  9e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3683  plasmid replication initiator-like protein  66.79 
 
 		 297 aa  335  5e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0364  putative replication protein A  66.02 
 
 		 292 aa  324  1e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3842  replication protein A  57.51 
 
 		 370 aa  309  4e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.198211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0523  replication protein A  55.8 
 
 		 353 aa  305  5.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1607  replication protein A  58.11 
 
 		 372 aa  305  7e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.288709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2798  replication protein A  56.77 
 
 		 371 aa  300  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3179  replication protein A  55.04 
 
 		 370 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3558  replication protein A  57.66 
 
 		 394 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0981  putative replication protein A  46.03 
 
 		 357 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.130933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6986  hypothetical protein  43.35 
 
 		 381 aa  203  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5168  plasmid replication initiator protein-like protein  41.67 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.697276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3589  plasmid replication initiator protein-like protein  43.13 
 
 		 401 aa  200  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5338  plasmid replication initiator protein-like protein  38.83 
 
 		 321 aa  189  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4988  plasmid replication initiator protein-like protein  35.34 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.862062  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4241  hypothetical protein  33.2 
 
 		 335 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.779681 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_6257  plasmid replication initiator protein RepA  33.6 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0332659  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4081  hypothetical protein  33.6 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.23652 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2817  plasmid replication initiator protein-like  32.81 
 
 		 410 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.03841  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7398  hypothetical protein  30.58 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0352  hypothetical protein  35.12 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2789  hypothetical protein  30.8 
 
 		 350 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3772  hypothetical protein  33.2 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0602576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6459  putative replication protein  31.8 
 
 		 414 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.34546 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2399  hypothetical protein  30.88 
 
 		 314 aa  116  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4266  hypothetical protein  31.71 
 
 		 332 aa  112  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.932297  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4401  plasmid replication initiator protein-like protein  29.78 
 
 		 347 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3854  hypothetical protein  32.79 
 
 		 348 aa  112  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.677421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0024  RepA-related protein  33.33 
 
 		 310 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3890  replication protein  31.36 
 
 		 415 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.353043  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4219  hypothetical protein  29.72 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0364  repA-related protein  29.47 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.667831  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3681  replication protein  29.79 
 
 		 418 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3469  replication protein  30.47 
 
 		 426 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235801  normal  0.588848 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6268  hypothetical protein  29.71 
 
 		 374 aa  97.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0711171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2782  Replication initiator protein A  28.06 
 
 		 370 aa  89.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3863  hypothetical protein  26.72 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3469  hypothetical protein  34.09 
 
 		 139 aa  52.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>