77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4241 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4241  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  682    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.779681 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4081  hypothetical protein  93.1 
 
 		 320 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.23652 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_6257  plasmid replication initiator protein RepA  93.1 
 
 		 320 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0332659  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3854  hypothetical protein  70.81 
 
 		 348 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.677421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4266  hypothetical protein  69.81 
 
 		 332 aa  462  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.932297  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3772  hypothetical protein  69.25 
 
 		 334 aa  463  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0602576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2789  hypothetical protein  52.19 
 
 		 350 aa  351  8.999999999999999e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4401  plasmid replication initiator protein-like protein  49.08 
 
 		 347 aa  319  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4988  plasmid replication initiator protein-like protein  51.46 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.862062  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0352  hypothetical protein  47.57 
 
 		 276 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2817  plasmid replication initiator protein-like  46.83 
 
 		 410 aa  222  8e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.03841  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4219  hypothetical protein  39.7 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2399  hypothetical protein  39.79 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2782  Replication initiator protein A  40.8 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7398  hypothetical protein  37.91 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5338  plasmid replication initiator protein-like protein  37.8 
 
 		 321 aa  156  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6268  hypothetical protein  33.21 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0711171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5168  plasmid replication initiator protein-like protein  36.55 
 
 		 322 aa  149  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.697276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1512  replication protein A  37.7 
 
 		 390 aa  146  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3589  plasmid replication initiator protein-like protein  30.34 
 
 		 401 aa  146  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1607  replication protein A  37.7 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.288709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0710  replication protein A  37.55 
 
 		 386 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3531  replication protein A  36.54 
 
 		 386 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0674076  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1204  replication protein A  36.54 
 
 		 386 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0523  replication protein A  38.06 
 
 		 353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3184  replication protein A  37.3 
 
 		 391 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3842  replication protein A  36.33 
 
 		 370 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.198211  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7731  putative plasmid replication protein A  35.79 
 
 		 292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3347  putative replication protein A  36.51 
 
 		 293 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.632364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3179  replication protein A  38.75 
 
 		 370 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2624  putative replication protein A  36.63 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1034  putative replication protein  36.4 
 
 		 351 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0364  putative replication protein A  33.98 
 
 		 292 aa  138  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3817  putative plasmid replication protein A  36.51 
 
 		 294 aa  135  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7431  putative replication protein A  35.29 
 
 		 351 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1263  putative replication initiator and transcription repressor protein  35.43 
 
 		 285 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4015  replication protein A  35.25 
 
 		 384 aa  133  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3076  replication protein A  36.07 
 
 		 386 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2798  replication protein A  35.8 
 
 		 371 aa  132  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3015  replication protein A  35.16 
 
 		 391 aa  132  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35980  conserved hypothetical replication initiator and transcription repressor protein  34.8 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2329  putative replication initiator and transcription repressor protein  34.8 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2606  putative replication initiator and transcription repressor protein  34.8 
 
 		 281 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4166  putative replication initiator and transcription repressor protein  34.9 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3683  plasmid replication initiator-like protein  35.29 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3731  replication protein A  34.21 
 
 		 285 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0581  replication protein A  35.17 
 
 		 379 aa  129  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0547768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2933  putative replication initiator and transcription repressor protein  34.8 
 
 		 285 aa  129  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0458  putative replication initiator and transcription repressor protein  34.4 
 
 		 285 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.365909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0846  replication protein A  35.32 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0122468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0686  putative replication initiator and transcription repressor protein  34 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3526  putative replication initiator and transcription repressor protein  34 
 
 		 285 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528382  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3024  putative replication initiator and transcription repressor protein  35.2 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3908  putative replication protein A  34.44 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6986  hypothetical protein  28.61 
 
 		 381 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2721  putative replication initiator and transcription repressor protein  35.2 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1142  putative replication initiator and transcription repressor protein  34.54 
 
 		 270 aa  126  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1985  putative replication initiator and transcription repressor protein  34.12 
 
 		 277 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397497  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3681  replication protein  31.68 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3558  replication protein A  34.73 
 
 		 394 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2653  putative replication initiator and transcription repressor protein  33.2 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.585943  normal  0.150321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2620  conserved hypothetical replication initiator and transcription repressor protein  34 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0239154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31110  putative replication initiator and transcriptional repressor protein  33.98 
 
 		 442 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000673493  unclonable  2.75454e-22 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0132  putative replication protein A  34.45 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303306  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3370  putative replication protein A  34.45 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1254  putative replication initiator and transcription repressor protein  33.6 
 
 		 285 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0838282 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2086  Plasmid replication initiator protein-like protein  35.57 
 
 		 334 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0981  putative replication protein A  34.96 
 
 		 357 aa  122  9e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.130933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1485  putative replication initiator and transcription repressor protein  33.2 
 
 		 289 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1878  conserved hypothetical replication initiator and transcription repressor protein  33.2 
 
 		 285 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3469  replication protein  31.86 
 
 		 426 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235801  normal  0.588848 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1288  conserved hypothetical replication initiator and transcription repressor protein  33.2 
 
 		 285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3890  replication protein  32.06 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.353043  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0364  repA-related protein  29.32 
 
 		 352 aa  105  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.667831  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6459  putative replication protein  28.29 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.34546 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0024  RepA-related protein  28.52 
 
 		 310 aa  95.1  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3863  hypothetical protein  22.01 
 
 		 393 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>