77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6268 on replicon NC_010070
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010070  Bmul_6268  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  765    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0711171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4219  hypothetical protein  47.27 
 
 		 311 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2399  hypothetical protein  40.37 
 
 		 314 aa  226  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7398  hypothetical protein  41.28 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2789  hypothetical protein  34.6 
 
 		 350 aa  169  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4988  plasmid replication initiator protein-like protein  38.2 
 
 		 312 aa  169  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.862062  n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4401  plasmid replication initiator protein-like protein  37.08 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2782  Replication initiator protein A  35.06 
 
 		 370 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0352  hypothetical protein  37.86 
 
 		 276 aa  155  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4266  hypothetical protein  35.71 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.932297  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4241  hypothetical protein  33.21 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.779681 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2817  plasmid replication initiator protein-like  33.46 
 
 		 410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.03841  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4081  hypothetical protein  34.31 
 
 		 320 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.23652 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_6257  plasmid replication initiator protein RepA  34.31 
 
 		 320 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0332659  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3854  hypothetical protein  35.71 
 
 		 348 aa  152  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.677421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3772  hypothetical protein  34.98 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0602576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3683  plasmid replication initiator-like protein  32.31 
 
 		 297 aa  111  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2606  putative replication initiator and transcription repressor protein  31.92 
 
 		 281 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0846  replication protein A  32.83 
 
 		 287 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0122468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1263  putative replication initiator and transcription repressor protein  31.68 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0364  putative replication protein A  30.89 
 
 		 292 aa  106  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1142  putative replication initiator and transcription repressor protein  32.82 
 
 		 270 aa  105  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3731  replication protein A  32.12 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3908  putative replication protein A  32.44 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1985  putative replication initiator and transcription repressor protein  31.42 
 
 		 277 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397497  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5338  plasmid replication initiator protein-like protein  29.93 
 
 		 321 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1034  putative replication protein  30.8 
 
 		 351 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6986  hypothetical protein  30.74 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3347  putative replication protein A  31.03 
 
 		 293 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.632364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4166  putative replication initiator and transcription repressor protein  31.03 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0686  putative replication initiator and transcription repressor protein  31.52 
 
 		 281 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3526  putative replication initiator and transcription repressor protein  30.43 
 
 		 285 aa  103  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528382  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0523  replication protein A  31.71 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35980  conserved hypothetical replication initiator and transcription repressor protein  31.03 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3817  putative plasmid replication protein A  30.27 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31110  putative replication initiator and transcriptional repressor protein  29.45 
 
 		 442 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000673493  unclonable  2.75454e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3024  putative replication initiator and transcription repressor protein  30.8 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2329  putative replication initiator and transcription repressor protein  30.65 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2721  putative replication initiator and transcription repressor protein  30.8 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1485  putative replication initiator and transcription repressor protein  30.04 
 
 		 289 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1254  putative replication initiator and transcription repressor protein  29.71 
 
 		 285 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0838282 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0458  putative replication initiator and transcription repressor protein  30.07 
 
 		 285 aa  99.8  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.365909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2798  replication protein A  31.73 
 
 		 371 aa  99.4  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3842  replication protein A  29.55 
 
 		 370 aa  99.4  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.198211  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1288  conserved hypothetical replication initiator and transcription repressor protein  29.71 
 
 		 285 aa  99.4  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2933  putative replication initiator and transcription repressor protein  30.42 
 
 		 285 aa  99  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2653  putative replication initiator and transcription repressor protein  29.56 
 
 		 285 aa  99  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.585943  normal  0.150321 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5168  plasmid replication initiator protein-like protein  29.77 
 
 		 322 aa  99  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.697276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2624  putative replication protein A  29.21 
 
 		 294 aa  99.4  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1607  replication protein A  32.79 
 
 		 372 aa  98.6  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.288709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7431  putative replication protein A  30.04 
 
 		 351 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3558  replication protein A  30.36 
 
 		 394 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2620  conserved hypothetical replication initiator and transcription repressor protein  30.32 
 
 		 282 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0239154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1878  conserved hypothetical replication initiator and transcription repressor protein  29.71 
 
 		 285 aa  97.1  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7731  putative plasmid replication protein A  29.12 
 
 		 292 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3531  replication protein A  29.62 
 
 		 386 aa  95.5  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0674076  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1204  replication protein A  29.62 
 
 		 386 aa  95.5  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3184  replication protein A  29.55 
 
 		 391 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3179  replication protein A  30.77 
 
 		 370 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0710  replication protein A  30.62 
 
 		 386 aa  92  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1512  replication protein A  28.74 
 
 		 390 aa  90.9  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6459  putative replication protein  28.12 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.34546 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3076  replication protein A  28.52 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0581  replication protein A  28.29 
 
 		 379 aa  87  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0547768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2086  Plasmid replication initiator protein-like protein  27.68 
 
 		 334 aa  87.4  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0132  putative replication protein A  28.68 
 
 		 289 aa  87  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303306  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3370  putative replication protein A  28.68 
 
 		 289 aa  87  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4015  replication protein A  27.76 
 
 		 384 aa  87  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3589  plasmid replication initiator protein-like protein  25.45 
 
 		 401 aa  86.3  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3015  replication protein A  28.08 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0024  RepA-related protein  26.69 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0364  repA-related protein  27.72 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.667831  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3890  replication protein  26.69 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.353043  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0981  putative replication protein A  29.11 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.130933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3681  replication protein  23.42 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3469  replication protein  23.05 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235801  normal  0.588848 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3863  hypothetical protein  25.59 
 
 		 393 aa  53.9  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>