76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2782 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2782  Replication initiator protein A  100 
 
 		 370 aa  769    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4988  plasmid replication initiator protein-like protein  40.7 
 
 		 312 aa  209  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.862062  n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4401  plasmid replication initiator protein-like protein  40.73 
 
 		 347 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2789  hypothetical protein  38.73 
 
 		 350 aa  203  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0352  hypothetical protein  39.42 
 
 		 276 aa  200  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4241  hypothetical protein  40.8 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.779681 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3854  hypothetical protein  39.15 
 
 		 348 aa  196  6e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.677421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_6257  plasmid replication initiator protein RepA  36.33 
 
 		 320 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0332659  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3772  hypothetical protein  37.99 
 
 		 334 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0602576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4081  hypothetical protein  36.33 
 
 		 320 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.23652 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4266  hypothetical protein  39.52 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.932297  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2817  plasmid replication initiator protein-like  38.27 
 
 		 410 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.03841  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4219  hypothetical protein  36.8 
 
 		 311 aa  168  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7398  hypothetical protein  34.91 
 
 		 321 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2399  hypothetical protein  35.82 
 
 		 314 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6268  hypothetical protein  35 
 
 		 374 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0711171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3179  replication protein A  31.73 
 
 		 370 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3842  replication protein A  30.97 
 
 		 370 aa  123  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.198211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0523  replication protein A  30.8 
 
 		 353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2798  replication protein A  30.98 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1607  replication protein A  29.3 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.288709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3184  replication protein A  31.54 
 
 		 391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5338  plasmid replication initiator protein-like protein  29.33 
 
 		 321 aa  113  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3015  replication protein A  32.2 
 
 		 391 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3558  replication protein A  31.37 
 
 		 394 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3683  plasmid replication initiator-like protein  33.76 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3076  replication protein A  32.49 
 
 		 386 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3531  replication protein A  30.11 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0674076  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1204  replication protein A  30.11 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7431  putative replication protein A  31.28 
 
 		 351 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1512  replication protein A  28.62 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4015  replication protein A  31.32 
 
 		 384 aa  107  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0364  putative replication protein A  30.71 
 
 		 292 aa  106  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2624  putative replication protein A  31.75 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0846  replication protein A  31.62 
 
 		 287 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0122468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3817  putative plasmid replication protein A  28.73 
 
 		 294 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0710  replication protein A  28.46 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0581  replication protein A  31.85 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0547768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7731  putative plasmid replication protein A  29.15 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3347  putative replication protein A  28.24 
 
 		 293 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.632364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3589  plasmid replication initiator protein-like protein  26.33 
 
 		 401 aa  99.4  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1034  putative replication protein  28.68 
 
 		 351 aa  99.4  9e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1142  putative replication initiator and transcription repressor protein  29.08 
 
 		 270 aa  97.1  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3890  replication protein  31.18 
 
 		 415 aa  96.3  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.353043  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2606  putative replication initiator and transcription repressor protein  28.85 
 
 		 281 aa  95.9  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3908  putative replication protein A  28.28 
 
 		 293 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3731  replication protein A  28.85 
 
 		 285 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5168  plasmid replication initiator protein-like protein  27.68 
 
 		 322 aa  94  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.697276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0132  putative replication protein A  30.93 
 
 		 289 aa  92.8  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303306  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3370  putative replication protein A  30.93 
 
 		 289 aa  92.8  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0686  putative replication initiator and transcription repressor protein  28.85 
 
 		 281 aa  92.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6986  hypothetical protein  26.74 
 
 		 381 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3526  putative replication initiator and transcription repressor protein  28.17 
 
 		 285 aa  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528382  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1985  putative replication initiator and transcription repressor protein  28.46 
 
 		 277 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397497  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0458  putative replication initiator and transcription repressor protein  28.3 
 
 		 285 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.365909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31110  putative replication initiator and transcriptional repressor protein  28.08 
 
 		 442 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000673493  unclonable  2.75454e-22 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2329  putative replication initiator and transcription repressor protein  28.4 
 
 		 285 aa  90.5  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4166  putative replication initiator and transcription repressor protein  26.77 
 
 		 283 aa  90.5  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35980  conserved hypothetical replication initiator and transcription repressor protein  28.4 
 
 		 295 aa  90.1  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2933  putative replication initiator and transcription repressor protein  27.31 
 
 		 285 aa  89.7  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3024  putative replication initiator and transcription repressor protein  26.92 
 
 		 285 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2721  putative replication initiator and transcription repressor protein  26.92 
 
 		 285 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1878  conserved hypothetical replication initiator and transcription repressor protein  28.06 
 
 		 285 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1263  putative replication initiator and transcription repressor protein  27.9 
 
 		 285 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1485  putative replication initiator and transcription repressor protein  28.06 
 
 		 289 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2653  putative replication initiator and transcription repressor protein  28.17 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.585943  normal  0.150321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2620  conserved hypothetical replication initiator and transcription repressor protein  27.38 
 
 		 282 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0239154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1254  putative replication initiator and transcription repressor protein  28.17 
 
 		 285 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0838282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3469  replication protein  30.37 
 
 		 426 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235801  normal  0.588848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3681  replication protein  30.37 
 
 		 418 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1288  conserved hypothetical replication initiator and transcription repressor protein  27.78 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2086  Plasmid replication initiator protein-like protein  27.24 
 
 		 334 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6459  putative replication protein  26.73 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.34546 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0981  putative replication protein A  29.55 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.130933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0024  RepA-related protein  26.97 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0364  repA-related protein  26.09 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.667831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>