78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1142 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1142  putative replication initiator and transcription repressor protein  100 
 
 		 270 aa  540  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4166  putative replication initiator and transcription repressor protein  79.7 
 
 		 283 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3526  putative replication initiator and transcription repressor protein  79.1 
 
 		 285 aa  427  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528382  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0458  putative replication initiator and transcription repressor protein  79.48 
 
 		 285 aa  427  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.365909  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2606  putative replication initiator and transcription repressor protein  79.85 
 
 		 281 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2620  conserved hypothetical replication initiator and transcription repressor protein  79.63 
 
 		 282 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0239154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1288  conserved hypothetical replication initiator and transcription repressor protein  79.48 
 
 		 285 aa  427  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31110  putative replication initiator and transcriptional repressor protein  78.65 
 
 		 442 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000673493  unclonable  2.75454e-22 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1985  putative replication initiator and transcription repressor protein  80.6 
 
 		 277 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397497  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1878  conserved hypothetical replication initiator and transcription repressor protein  78.36 
 
 		 285 aa  423  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3731  replication protein A  79.1 
 
 		 285 aa  421  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35980  conserved hypothetical replication initiator and transcription repressor protein  80.6 
 
 		 295 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2653  putative replication initiator and transcription repressor protein  78.73 
 
 		 285 aa  423  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.585943  normal  0.150321 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1485  putative replication initiator and transcription repressor protein  78.73 
 
 		 289 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1254  putative replication initiator and transcription repressor protein  78.73 
 
 		 285 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0838282 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2329  putative replication initiator and transcription repressor protein  80.22 
 
 		 285 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2933  putative replication initiator and transcription repressor protein  78.36 
 
 		 285 aa  417  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2721  putative replication initiator and transcription repressor protein  78.36 
 
 		 285 aa  418  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0686  putative replication initiator and transcription repressor protein  79.48 
 
 		 281 aa  420  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3024  putative replication initiator and transcription repressor protein  78.36 
 
 		 285 aa  418  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1263  putative replication initiator and transcription repressor protein  78.36 
 
 		 285 aa  414  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3531  replication protein A  68.16 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0674076  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1204  replication protein A  68.16 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1512  replication protein A  66.29 
 
 		 390 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3817  putative plasmid replication protein A  68.7 
 
 		 294 aa  364  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3076  replication protein A  67.91 
 
 		 386 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7731  putative plasmid replication protein A  69.06 
 
 		 292 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3015  replication protein A  68.16 
 
 		 391 aa  363  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0710  replication protein A  66.67 
 
 		 386 aa  363  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3184  replication protein A  66.67 
 
 		 391 aa  362  3e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3908  putative replication protein A  68.58 
 
 		 293 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4015  replication protein A  68.2 
 
 		 384 aa  359  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7431  putative replication protein A  67.16 
 
 		 351 aa  358  4e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0581  replication protein A  66.79 
 
 		 379 aa  358  5e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0547768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3347  putative replication protein A  67.82 
 
 		 293 aa  349  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.632364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2624  putative replication protein A  66.92 
 
 		 294 aa  333  2e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3370  putative replication protein A  65.25 
 
 		 289 aa  333  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0132  putative replication protein A  65.25 
 
 		 289 aa  333  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303306  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0846  replication protein A  64.64 
 
 		 287 aa  332  4e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0122468 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2086  Plasmid replication initiator protein-like protein  64.79 
 
 		 334 aa  328  6e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1034  putative replication protein  63.46 
 
 		 351 aa  327  9e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3683  plasmid replication initiator-like protein  65.02 
 
 		 297 aa  323  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0364  putative replication protein A  64.9 
 
 		 292 aa  308  5.9999999999999995e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1607  replication protein A  60.15 
 
 		 372 aa  305  4.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.288709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3842  replication protein A  61.15 
 
 		 370 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.198211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0523  replication protein A  59.39 
 
 		 353 aa  302  4.0000000000000003e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2798  replication protein A  59.46 
 
 		 371 aa  299  3e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3179  replication protein A  58.75 
 
 		 370 aa  296  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3558  replication protein A  58.46 
 
 		 394 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0981  putative replication protein A  42.37 
 
 		 357 aa  206  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.130933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6986  hypothetical protein  43.89 
 
 		 381 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3589  plasmid replication initiator protein-like protein  42.11 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5168  plasmid replication initiator protein-like protein  39.54 
 
 		 322 aa  184  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.697276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5338  plasmid replication initiator protein-like protein  42.34 
 
 		 321 aa  182  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4241  hypothetical protein  34.54 
 
 		 335 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.779681 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_6257  plasmid replication initiator protein RepA  34.84 
 
 		 320 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0332659  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4081  hypothetical protein  34.84 
 
 		 320 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.23652 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2817  plasmid replication initiator protein-like  34.75 
 
 		 410 aa  125  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.03841  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2789  hypothetical protein  31.3 
 
 		 350 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3772  hypothetical protein  33.2 
 
 		 334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0602576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4988  plasmid replication initiator protein-like protein  33.87 
 
 		 312 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.862062  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4266  hypothetical protein  34.43 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.932297  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3854  hypothetical protein  33.2 
 
 		 348 aa  116  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.677421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7398  hypothetical protein  31.15 
 
 		 321 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0352  hypothetical protein  36.12 
 
 		 276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2399  hypothetical protein  30.83 
 
 		 314 aa  112  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4219  hypothetical protein  30.8 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4401  plasmid replication initiator protein-like protein  31.23 
 
 		 347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6459  putative replication protein  30.8 
 
 		 414 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.34546 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6268  hypothetical protein  32.82 
 
 		 374 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0711171  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0364  repA-related protein  34.01 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.667831  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2782  Replication initiator protein A  29.08 
 
 		 370 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0024  RepA-related protein  31.4 
 
 		 310 aa  96.3  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3890  replication protein  31.27 
 
 		 415 aa  91.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.353043  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3681  replication protein  30.52 
 
 		 418 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3469  replication protein  30.52 
 
 		 426 aa  89  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235801  normal  0.588848 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3469  hypothetical protein  34.09 
 
 		 139 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3863  hypothetical protein  24.9 
 
 		 393 aa  46.2  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>