60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3469 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3469  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  286  6e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0024  RepA-related protein  62.96 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0364  repA-related protein  57.65 
 
 		 352 aa  106  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.667831  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3890  replication protein  46.08 
 
 		 415 aa  87.8  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.353043  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3681  replication protein  48.89 
 
 		 418 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3469  replication protein  48.89 
 
 		 426 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235801  normal  0.588848 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6459  putative replication protein  43.96 
 
 		 414 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.34546 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1034  putative replication protein  37.21 
 
 		 351 aa  58.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0846  replication protein A  37.5 
 
 		 287 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0122468 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0132  putative replication protein A  35.63 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303306  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3370  putative replication protein A  35.63 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31110  putative replication initiator and transcriptional repressor protein  34.09 
 
 		 442 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000673493  unclonable  2.75454e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1485  putative replication initiator and transcription repressor protein  34.09 
 
 		 289 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1254  putative replication initiator and transcription repressor protein  34.09 
 
 		 285 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0838282 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1878  conserved hypothetical replication initiator and transcription repressor protein  34.09 
 
 		 285 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1288  conserved hypothetical replication initiator and transcription repressor protein  34.09 
 
 		 285 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2721  putative replication initiator and transcription repressor protein  34.09 
 
 		 285 aa  51.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3683  plasmid replication initiator-like protein  40.54 
 
 		 297 aa  51.2  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3024  putative replication initiator and transcription repressor protein  34.09 
 
 		 285 aa  51.2  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2653  putative replication initiator and transcription repressor protein  32.22 
 
 		 285 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.585943  normal  0.150321 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3526  putative replication initiator and transcription repressor protein  32.95 
 
 		 285 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528382  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2933  putative replication initiator and transcription repressor protein  32.95 
 
 		 285 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2620  conserved hypothetical replication initiator and transcription repressor protein  32.95 
 
 		 282 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0239154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7431  putative replication protein A  36.36 
 
 		 351 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5168  plasmid replication initiator protein-like protein  37.21 
 
 		 322 aa  50.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.697276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3908  putative replication protein A  33.68 
 
 		 293 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3863  hypothetical protein  35 
 
 		 393 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2606  putative replication initiator and transcription repressor protein  32.22 
 
 		 281 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7731  putative plasmid replication protein A  36.49 
 
 		 292 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2798  replication protein A  36.49 
 
 		 371 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2624  putative replication protein A  37.84 
 
 		 294 aa  48.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0686  putative replication initiator and transcription repressor protein  34.09 
 
 		 281 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0458  putative replication initiator and transcription repressor protein  31.82 
 
 		 285 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.365909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0523  replication protein A  36.49 
 
 		 353 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1142  putative replication initiator and transcription repressor protein  34.09 
 
 		 270 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5338  plasmid replication initiator protein-like protein  32.88 
 
 		 321 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3347  putative replication protein A  32.94 
 
 		 293 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.632364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3179  replication protein A  35.14 
 
 		 370 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1263  putative replication initiator and transcription repressor protein  32.22 
 
 		 285 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0364  putative replication protein A  33.77 
 
 		 292 aa  47.8  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3817  putative plasmid replication protein A  34.09 
 
 		 294 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35980  conserved hypothetical replication initiator and transcription repressor protein  31.11 
 
 		 295 aa  47  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2329  putative replication initiator and transcription repressor protein  31.11 
 
 		 285 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3731  replication protein A  31.11 
 
 		 285 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1985  putative replication initiator and transcription repressor protein  32.22 
 
 		 277 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397497  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3076  replication protein A  33.72 
 
 		 386 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3015  replication protein A  33.33 
 
 		 391 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3184  replication protein A  33.78 
 
 		 391 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2086  Plasmid replication initiator protein-like protein  35.14 
 
 		 334 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4015  replication protein A  33.72 
 
 		 384 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0581  replication protein A  35.14 
 
 		 379 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0547768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4401  plasmid replication initiator protein-like protein  34 
 
 		 347 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1607  replication protein A  32.43 
 
 		 372 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.288709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0710  replication protein A  32.56 
 
 		 386 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1204  replication protein A  31.4 
 
 		 386 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3531  replication protein A  31.4 
 
 		 386 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0674076  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4166  putative replication initiator and transcription repressor protein  31.11 
 
 		 283 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1512  replication protein A  30.23 
 
 		 390 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3842  replication protein A  32.43 
 
 		 370 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.198211  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2817  plasmid replication initiator protein-like  30.34 
 
 		 410 aa  40  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.03841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>