More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2239 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3221  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  71.18 
 
 
656 aa  885    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0304  acyl-CoA oxidase domain protein  63.14 
 
 
670 aa  781    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2239  hypothetical protein  100 
 
 
659 aa  1324    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.823485  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3446  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.77 
 
 
645 aa  653    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10069  normal  0.195202 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3363  acyl-CoA oxidase domain protein  62.54 
 
 
628 aa  757    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.482845 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3435  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  53.61 
 
 
645 aa  651    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78233  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31740  acyl-CoA dehydrogenase  64.44 
 
 
637 aa  764    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21270  acyl-CoA dehydrogenase  54.24 
 
 
663 aa  639    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.577955  normal  0.0824021 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0437  acyl-CoA oxidase domain-containing protein  55.92 
 
 
657 aa  654    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.266811  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3498  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.61 
 
 
645 aa  651    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.491542 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4030  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  56.62 
 
 
660 aa  655    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3808  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.68 
 
 
669 aa  655    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0851987  normal  0.621517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2726  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.29 
 
 
653 aa  655    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1022  acyl-CoA oxidase domain protein  50.79 
 
 
677 aa  619  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.899617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1889  acyl-CoA oxidase domain protein  52.1 
 
 
701 aa  614  9.999999999999999e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000501892 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0678  acyl-CoA oxidase domain protein  50.47 
 
 
654 aa  587  1e-166  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.546337  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3568  acyl-CoA oxidase domain protein  50.54 
 
 
694 aa  582  1.0000000000000001e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307135  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2142  acyl-CoA oxidase domain-containing protein  49.46 
 
 
704 aa  579  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.315023  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3111  acyl-CoA oxidase domain protein  50.85 
 
 
713 aa  582  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322908  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2935  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.66 
 
 
691 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.386939 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2376  acyl-CoA oxidase domain protein  48.55 
 
 
690 aa  570  1e-161  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0709206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34870  acyl-CoA dehydrogenase  50 
 
 
694 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11700  acyl-CoA dehydrogenase  47.94 
 
 
707 aa  553  1e-156  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.20402  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23500  acyl-CoA dehydrogenase  48.86 
 
 
713 aa  546  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3394  acyl-CoA oxidase domain-containing protein  42.59 
 
 
752 aa  531  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.943742  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00320  Acyl-coenzyme A oxidase I, putative  34.91 
 
 
702 aa  302  1e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13743  predicted protein  32.13 
 
 
695 aa  228  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39759  Acyl-coenzyme A oxidase (Acyl-CoA oxidase)  35.22 
 
 
725 aa  215  1.9999999999999998e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.410007  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19979  precursor of oxidase acyl-coa oxidase  29.07 
 
 
706 aa  212  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.304645  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06752  fatty-acyl coenzyme A oxidase (Pox1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06090)  32.39 
 
 
696 aa  205  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.327675 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75424  Acyl-coenzyme A oxidase 4 (Acyl-CoA oxidase 4) (AOX 4)  28.6 
 
 
714 aa  194  5e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.230455 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2861  cytochrome P450n  30.99 
 
 
938 aa  170  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06765  conserved hypothetical protein  29.32 
 
 
695 aa  162  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6234  hypothetical protein  32.39 
 
 
582 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4651  hypothetical protein  28.41 
 
 
565 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.102009  normal  0.0123492 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1804  butyryl-CoA dehydrogenase  30.97 
 
 
386 aa  106  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.52 
 
 
380 aa  96.3  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.8 
 
 
386 aa  90.1  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3185  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  25.96 
 
 
381 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3197  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.96 
 
 
381 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107231  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3247  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.96 
 
 
381 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1187  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.01 
 
 
381 aa  88.6  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4293  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.57 
 
 
383 aa  89  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2093  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.61 
 
 
398 aa  88.6  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0300334  normal  0.0497691 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6291  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.03 
 
 
379 aa  88.2  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4117  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.85 
 
 
386 aa  87.8  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3467  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.72 
 
 
385 aa  87.4  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0842785 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4539  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.72 
 
 
385 aa  87.4  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.452852  normal  0.739278 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0463  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.81 
 
 
385 aa  87.4  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.547783  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0182  butyryl-CoA dehydrogenase  30.58 
 
 
385 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0191  butyryl-CoA dehydrogenase  30.58 
 
 
385 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297032  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0171  butyryl-CoA dehydrogenase  30.58 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260341 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1224  acyl-CoA dehydrogenase-like  26.93 
 
 
394 aa  85.5  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0161366  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3470  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.9 
 
 
395 aa  85.1  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.131363  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  26.49 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2187  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.65 
 
 
385 aa  84  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6410  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  28.33 
 
 
385 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1974  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.84 
 
 
673 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3043  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.9 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.942472  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4054  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.79 
 
 
384 aa  82.8  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3923  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.47 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01762  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  27.46 
 
 
385 aa  82  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.272038 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0838  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.73 
 
 
382 aa  82  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.541206 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5908  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  27.27 
 
 
385 aa  82  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276142  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1570  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.49 
 
 
383 aa  82  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2632  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.99 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49444  normal  0.97315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2510  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.39 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0195405  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2001  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.13 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1359  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.67 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4169  butyryl-CoA dehydrogenase  26.11 
 
 
383 aa  81.6  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0614852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4181  butyryl-CoA dehydrogenase  26.11 
 
 
383 aa  81.6  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181503  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1221  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  26.91 
 
 
466 aa  81.3  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.395809  normal  0.664246 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3323  Glutaryl-CoA dehydrogenase  27.27 
 
 
454 aa  80.9  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000794594 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0871  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.49 
 
 
409 aa  80.9  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1209  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.13 
 
 
453 aa  80.9  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26886  predicted protein  33.5 
 
 
492 aa  80.5  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.772551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3266  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.37 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  0.605117 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.68 
 
 
402 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6770  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.88 
 
 
390 aa  80.1  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210456  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3652  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.86 
 
 
584 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0446  butyryl-CoA dehydrogenase  29.97 
 
 
385 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0148  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.65 
 
 
385 aa  79.3  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5685  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.43 
 
 
452 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0130  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.65 
 
 
385 aa  79.7  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4074  Acyl-CoA dehydrogenase-like  25 
 
 
381 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0132  long-chain acyl-CoA dehydrogenase  26.13 
 
 
384 aa  79.7  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3002  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25 
 
 
388 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0264  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.31 
 
 
394 aa  79.7  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0644181  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30500  butyryl-CoA dehydrogenase  25.76 
 
 
385 aa  79.7  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.262375 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2118  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.38 
 
 
382 aa  79.3  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0463825  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0176  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.65 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142689  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1172  acyl-CoA dehydrogenase  25.26 
 
 
384 aa  79  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.336122 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3552  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  25.88 
 
 
396 aa  79  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01490  Acyl-CoA dehydrogenase  25.63 
 
 
453 aa  79  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1233  acyl-CoA dehydrogenase-like  25.26 
 
 
384 aa  79  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.831269  normal  0.440096 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0539  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.2 
 
 
405 aa  79  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00283131 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0898  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.22 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.592416  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4180  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.57 
 
 
383 aa  78.2  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3810  acyl-CoA dehydrogenase-like  24.46 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409064  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4927  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.54 
 
 
380 aa  78.2  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.905693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>