More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2376 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_11700  acyl-CoA dehydrogenase  57.43 
 
 
707 aa  760    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.20402  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3568  acyl-CoA oxidase domain protein  61.91 
 
 
694 aa  810    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307135  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1889  acyl-CoA oxidase domain protein  61.21 
 
 
701 aa  831    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000501892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34870  acyl-CoA dehydrogenase  71.82 
 
 
694 aa  954    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2376  acyl-CoA oxidase domain protein  100 
 
 
690 aa  1407    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0709206 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23500  acyl-CoA dehydrogenase  58.17 
 
 
713 aa  752    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165225  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3111  acyl-CoA oxidase domain protein  57.35 
 
 
713 aa  756    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322908  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2142  acyl-CoA oxidase domain-containing protein  63.05 
 
 
704 aa  833    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.315023  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2935  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  65.71 
 
 
691 aa  882    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.386939 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2239  hypothetical protein  50 
 
 
659 aa  558  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.823485  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31740  acyl-CoA dehydrogenase  46.79 
 
 
637 aa  525  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3221  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.79 
 
 
656 aa  509  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0304  acyl-CoA oxidase domain protein  43.59 
 
 
670 aa  507  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3363  acyl-CoA oxidase domain protein  44.76 
 
 
628 aa  498  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.482845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3446  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.61 
 
 
645 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10069  normal  0.195202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3435  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  42.46 
 
 
645 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3498  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.46 
 
 
645 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.491542 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1022  acyl-CoA oxidase domain protein  42.5 
 
 
677 aa  485  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.899617  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0437  acyl-CoA oxidase domain-containing protein  42.11 
 
 
657 aa  483  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.266811  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3808  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.38 
 
 
669 aa  483  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0851987  normal  0.621517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2726  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.98 
 
 
653 aa  478  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0678  acyl-CoA oxidase domain protein  42.25 
 
 
654 aa  474  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.546337  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4030  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.36 
 
 
660 aa  458  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21270  acyl-CoA dehydrogenase  40.55 
 
 
663 aa  449  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.577955  normal  0.0824021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3394  acyl-CoA oxidase domain-containing protein  38.27 
 
 
752 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.943742  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00320  Acyl-coenzyme A oxidase I, putative  30.57 
 
 
702 aa  259  9e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13743  predicted protein  29.87 
 
 
695 aa  200  6e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39759  Acyl-coenzyme A oxidase (Acyl-CoA oxidase)  28.19 
 
 
725 aa  194  4e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.410007  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75424  Acyl-coenzyme A oxidase 4 (Acyl-CoA oxidase 4) (AOX 4)  27.98 
 
 
714 aa  192  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.230455 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19979  precursor of oxidase acyl-coa oxidase  28.15 
 
 
706 aa  181  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.304645  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06752  fatty-acyl coenzyme A oxidase (Pox1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06090)  28.7 
 
 
696 aa  171  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.327675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2861  cytochrome P450n  30.45 
 
 
938 aa  164  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06765  conserved hypothetical protein  27.21 
 
 
695 aa  126  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6234  hypothetical protein  26.59 
 
 
582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4651  hypothetical protein  26.33 
 
 
565 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.102009  normal  0.0123492 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2382  Glutaryl-CoA dehydrogenase  28.47 
 
 
407 aa  95.1  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3505  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.41 
 
 
393 aa  92.8  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147907  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3043  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.38 
 
 
402 aa  90.1  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.942472  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26886  predicted protein  33.65 
 
 
492 aa  87  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.772551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.53 
 
 
383 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3470  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.78 
 
 
395 aa  84.7  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.131363  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.51 
 
 
383 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.72 
 
 
379 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0871  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.35 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19560  acyl-CoA dehydrogenase  28.73 
 
 
400 aa  82  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  25.28 
 
 
379 aa  82  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.51 
 
 
402 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3827  bytyryl-CoA dehydrogenase (short-chain-acyl-CoA dehydrogenase)  26.7 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4293  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.86 
 
 
383 aa  80.1  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.68 
 
 
382 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  24.72 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3931  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.11 
 
 
400 aa  78.6  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.543045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1804  butyryl-CoA dehydrogenase  28.13 
 
 
386 aa  78.2  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5908  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  27.01 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276142  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7329  Acyl-CoA dehydrogenase  24.44 
 
 
383 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0898  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.78 
 
 
379 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.592416  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4391  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.42 
 
 
386 aa  76.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.64 
 
 
375 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0292697  normal  0.208883 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0031  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.21 
 
 
399 aa  76.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2061  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  26.65 
 
 
404 aa  76.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0148  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.24 
 
 
385 aa  76.3  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.48 
 
 
388 aa  76.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0119178  unclonable  0.00000752707 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0130  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.24 
 
 
385 aa  76.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5319  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  27.01 
 
 
385 aa  75.5  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.398534  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2318  acyl-CoA dehydrogenase  24.17 
 
 
569 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.25 
 
 
396 aa  75.1  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0441  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.07 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1596  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.27 
 
 
593 aa  74.3  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0612446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3006  acyl-CoA dehydrogenase  24.54 
 
 
569 aa  74.3  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.659019 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1327  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.06 
 
 
399 aa  73.9  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.46 
 
 
375 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01550  acyl-CoA oxidase, putative  25.54 
 
 
429 aa  73.9  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2093  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.33 
 
 
398 aa  73.9  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0300334  normal  0.0497691 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33630  acyl-CoA dehydrogenase  24.09 
 
 
386 aa  72.8  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.7 
 
 
375 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4539  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.86 
 
 
385 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.452852  normal  0.739278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2510  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.73 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0195405  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1109  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.97 
 
 
388 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3467  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.86 
 
 
385 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0842785 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2380  acyl-CoA dehydrogenase  24.42 
 
 
569 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0460378  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2128  acyl-CoA dehydrogenase  24.42 
 
 
569 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.422532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2114  acyl-CoA dehydrogenase  24.42 
 
 
569 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.575523  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  24.93 
 
 
379 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1809  Glutaryl-CoA dehydrogenase  27.09 
 
 
395 aa  72  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.141566  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.05 
 
 
396 aa  72  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.480554  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0098  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.39 
 
 
442 aa  72.4  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0434945  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2453  acyl-CoA dehydrogenase  24.42 
 
 
569 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.31 
 
 
379 aa  72.4  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  25.62 
 
 
380 aa  72  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23170  acyl-CoA dehydrogenase  25.83 
 
 
408 aa  71.6  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2191  acyl-CoA dehydrogenase  24.42 
 
 
569 aa  72  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3683  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.42 
 
 
384 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.685138 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.87 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2352  acyl-CoA dehydrogenase  24.42 
 
 
569 aa  72  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4169  butyryl-CoA dehydrogenase  26.15 
 
 
383 aa  72  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0614852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4181  butyryl-CoA dehydrogenase  26.15 
 
 
383 aa  72  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181503  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2159  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.12 
 
 
569 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.235512  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24700  acyl-CoA dehydrogenase  25 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791758  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5007  acyl-CoA dehydrogenase  23.95 
 
 
378 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0081  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.56 
 
 
642 aa  71.6  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>