127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4651 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4651  hypothetical protein  100 
 
 
565 aa  1165    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.102009  normal  0.0123492 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3394  acyl-CoA oxidase domain-containing protein  31.18 
 
 
752 aa  140  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.943742  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6234  hypothetical protein  28.11 
 
 
582 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0437  acyl-CoA oxidase domain-containing protein  26.91 
 
 
657 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.266811  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3808  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.82 
 
 
669 aa  115  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0851987  normal  0.621517 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21270  acyl-CoA dehydrogenase  28.22 
 
 
663 aa  113  7.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.577955  normal  0.0824021 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23500  acyl-CoA dehydrogenase  27.07 
 
 
713 aa  113  8.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165225  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3111  acyl-CoA oxidase domain protein  27.87 
 
 
713 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322908  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2239  hypothetical protein  28.41 
 
 
659 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.823485  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4030  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.22 
 
 
660 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3363  acyl-CoA oxidase domain protein  28.36 
 
 
628 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.482845 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2726  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.08 
 
 
653 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31740  acyl-CoA dehydrogenase  27.22 
 
 
637 aa  108  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2376  acyl-CoA oxidase domain protein  26.33 
 
 
690 aa  105  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0709206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3221  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.78 
 
 
656 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2142  acyl-CoA oxidase domain-containing protein  25.86 
 
 
704 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.315023  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3446  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.02 
 
 
645 aa  101  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10069  normal  0.195202 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2861  cytochrome P450n  26.13 
 
 
938 aa  100  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3435  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  27.2 
 
 
645 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3498  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.2 
 
 
645 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.491542 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0304  acyl-CoA oxidase domain protein  25.72 
 
 
670 aa  96.3  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11700  acyl-CoA dehydrogenase  25.07 
 
 
707 aa  96.7  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.20402  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1889  acyl-CoA oxidase domain protein  27.06 
 
 
701 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000501892 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2935  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.94 
 
 
691 aa  94.7  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.386939 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13743  predicted protein  26.72 
 
 
695 aa  93.2  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3568  acyl-CoA oxidase domain protein  28.21 
 
 
694 aa  91.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307135  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00320  Acyl-coenzyme A oxidase I, putative  25.21 
 
 
702 aa  85.5  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39759  Acyl-coenzyme A oxidase (Acyl-CoA oxidase)  25 
 
 
725 aa  85.1  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.410007  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0678  acyl-CoA oxidase domain protein  26.4 
 
 
654 aa  85.1  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.546337  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1022  acyl-CoA oxidase domain protein  24.78 
 
 
677 aa  84.7  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.899617  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34870  acyl-CoA dehydrogenase  23.28 
 
 
694 aa  83.6  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19979  precursor of oxidase acyl-coa oxidase  24.86 
 
 
706 aa  79.7  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.304645  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06752  fatty-acyl coenzyme A oxidase (Pox1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06090)  23.88 
 
 
696 aa  78.6  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.327675 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75424  Acyl-coenzyme A oxidase 4 (Acyl-CoA oxidase 4) (AOX 4)  23.87 
 
 
714 aa  75.1  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.230455 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06765  conserved hypothetical protein  25 
 
 
695 aa  67  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0264  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.64 
 
 
394 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0644181  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10766  acyl-CoA dehydrogenase fadE9  28.63 
 
 
390 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000022778  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0067  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.71 
 
 
394 aa  61.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1361  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.69 
 
 
387 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.237176  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.82 
 
 
377 aa  58.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2867  Acyl-CoA dehydrogenase-like  25.88 
 
 
375 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.967944  normal  0.115681 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1555  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.51 
 
 
383 aa  57  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5011  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.2 
 
 
387 aa  57  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117513  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.56 
 
 
375 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0362  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.48 
 
 
406 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2500  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.58 
 
 
386 aa  56.6  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0453809  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3069  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.94 
 
 
387 aa  55.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.117634  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2906  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24 
 
 
375 aa  55.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.56 
 
 
375 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.22 
 
 
375 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0292697  normal  0.208883 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01704  acyl-CoA dehydrogenase family member 8  26.64 
 
 
393 aa  54.7  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.791292  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0096  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  25.75 
 
 
378 aa  54.7  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0160842  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01905  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  25.91 
 
 
397 aa  54.7  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2382  Glutaryl-CoA dehydrogenase  28.28 
 
 
407 aa  53.9  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.24 
 
 
379 aa  53.9  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0447  acyl-CoA dehydrogenase  23.68 
 
 
375 aa  53.5  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0658  acyl-CoA dehydrogenase  26.36 
 
 
388 aa  53.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31540  putative acyl-CoA dehydrogenase  23.25 
 
 
375 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.430124  hitchhiker  0.000095284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2684  putative acyl-CoA dehydrogenase  23.25 
 
 
375 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.126402  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4408  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.45 
 
 
394 aa  53.5  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3106  acyl-CoA dehydrogenase-like  24.12 
 
 
375 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0391  acyl-CoA dehydrogenase  23.68 
 
 
375 aa  52.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.31925  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3936  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.62 
 
 
376 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.132156  decreased coverage  0.00760667 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.22 
 
 
379 aa  52.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4730  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.18 
 
 
376 aa  52  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2865  Acyl-CoA dehydrogenase-like  24.67 
 
 
383 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0509295  normal  0.212771 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.22 
 
 
402 aa  51.2  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1804  butyryl-CoA dehydrogenase  23.83 
 
 
386 aa  50.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  24.57 
 
 
380 aa  50.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  25.78 
 
 
379 aa  50.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3838  acyl-CoA dehydrogenase-like  24.46 
 
 
376 aa  50.4  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2602  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.48 
 
 
388 aa  50.4  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000586554  normal  0.488782 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.92 
 
 
376 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05570  acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  29.56 
 
 
377 aa  50.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.213032 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1516  butyryl-CoA dehydrogenase  25.44 
 
 
386 aa  50.1  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10680  acyl-CoA dehydrogenase  29.17 
 
 
383 aa  49.7  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270304  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0901  putative acyl-CoA dehydrogenase  25.87 
 
 
386 aa  49.7  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2037  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.25 
 
 
375 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  26.22 
 
 
379 aa  48.5  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4666  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.97 
 
 
375 aa  48.5  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.815528  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1288  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.11 
 
 
379 aa  48.5  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.751821 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2118  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.11 
 
 
382 aa  48.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0463825  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2132  butyryl-CoA dehydrogenase  26.3 
 
 
388 aa  48.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.627987  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0459  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.61 
 
 
376 aa  48.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5850  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  24.88 
 
 
380 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23170  acyl-CoA dehydrogenase  27.95 
 
 
408 aa  48.1  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3603  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.84 
 
 
375 aa  48.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.323372 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3255  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.38 
 
 
384 aa  47.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001547  branched-chain acyl-CoA dehydrogenase  25 
 
 
384 aa  47.4  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3106  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.43 
 
 
375 aa  47.8  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.332334  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1366  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.17 
 
 
395 aa  47.8  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66758  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1804  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.14 
 
 
390 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392184  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2632  hypothetical protein  23.05 
 
 
385 aa  47  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2502  hypothetical protein  23.05 
 
 
385 aa  47  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2897  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  25.39 
 
 
527 aa  47  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54630  acyl-CoA dehydrogenase  28.7 
 
 
387 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169112 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26886  predicted protein  25.24 
 
 
492 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.772551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1375  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.63 
 
 
387 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.178062  normal  0.0980928 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1871  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.89 
 
 
385 aa  46.6  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2548  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.25 
 
 
375 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>