More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21270 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3363  acyl-CoA oxidase domain protein  53.44 
 
 
628 aa  638    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.482845 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21270  acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
663 aa  1347    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.577955  normal  0.0824021 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31740  acyl-CoA dehydrogenase  54.36 
 
 
637 aa  637    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3221  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  54.89 
 
 
656 aa  656    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0304  acyl-CoA oxidase domain protein  52.88 
 
 
670 aa  632  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2239  hypothetical protein  55.36 
 
 
659 aa  629  1e-179  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.823485  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3808  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.52 
 
 
669 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0851987  normal  0.621517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2726  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.16 
 
 
653 aa  609  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3446  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.08 
 
 
645 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10069  normal  0.195202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3435  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  49.92 
 
 
645 aa  601  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3498  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.92 
 
 
645 aa  601  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.491542 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1022  acyl-CoA oxidase domain protein  46.9 
 
 
677 aa  585  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.899617  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0678  acyl-CoA oxidase domain protein  47.3 
 
 
654 aa  555  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.546337  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4030  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.17 
 
 
660 aa  550  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0437  acyl-CoA oxidase domain-containing protein  47.07 
 
 
657 aa  543  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.266811  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3394  acyl-CoA oxidase domain-containing protein  41.34 
 
 
752 aa  492  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.943742  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2142  acyl-CoA oxidase domain-containing protein  41.31 
 
 
704 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.315023  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2376  acyl-CoA oxidase domain protein  40.55 
 
 
690 aa  449  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0709206 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1889  acyl-CoA oxidase domain protein  40.85 
 
 
701 aa  451  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000501892 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2935  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.85 
 
 
691 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.386939 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11700  acyl-CoA dehydrogenase  43.06 
 
 
707 aa  446  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.20402  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3568  acyl-CoA oxidase domain protein  43.38 
 
 
694 aa  442  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307135  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34870  acyl-CoA dehydrogenase  42.42 
 
 
694 aa  431  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3111  acyl-CoA oxidase domain protein  40.45 
 
 
713 aa  431  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322908  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23500  acyl-CoA dehydrogenase  41.01 
 
 
713 aa  425  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165225  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00320  Acyl-coenzyme A oxidase I, putative  32.18 
 
 
702 aa  278  2e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06752  fatty-acyl coenzyme A oxidase (Pox1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06090)  31.69 
 
 
696 aa  218  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.327675 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13743  predicted protein  30.43 
 
 
695 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19979  precursor of oxidase acyl-coa oxidase  31.22 
 
 
706 aa  215  2.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.304645  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39759  Acyl-coenzyme A oxidase (Acyl-CoA oxidase)  30.15 
 
 
725 aa  212  2e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.410007  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75424  Acyl-coenzyme A oxidase 4 (Acyl-CoA oxidase 4) (AOX 4)  28.86 
 
 
714 aa  205  2e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.230455 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06765  conserved hypothetical protein  28.64 
 
 
695 aa  167  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2861  cytochrome P450n  29.28 
 
 
938 aa  135  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4651  hypothetical protein  28.22 
 
 
565 aa  113  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.102009  normal  0.0123492 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1224  acyl-CoA dehydrogenase-like  26.71 
 
 
394 aa  113  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0161366  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1804  butyryl-CoA dehydrogenase  29.4 
 
 
386 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3923  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.42 
 
 
381 aa  110  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2885  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.64 
 
 
383 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0176  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.05 
 
 
385 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142689  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0130  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27 
 
 
385 aa  108  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2106  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.18 
 
 
381 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2436  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.4 
 
 
383 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0148  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.76 
 
 
385 aa  107  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7329  Acyl-CoA dehydrogenase  28.53 
 
 
383 aa  107  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.64 
 
 
377 aa  107  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3492  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.16 
 
 
383 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3467  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.57 
 
 
385 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0842785 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2247  butyryl-CoA dehydrogenase  25.96 
 
 
383 aa  106  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.176219  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4539  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.57 
 
 
385 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.452852  normal  0.739278 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1226  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.25 
 
 
381 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.44 
 
 
402 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2279  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.16 
 
 
383 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6234  hypothetical protein  27.79 
 
 
582 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.4 
 
 
377 aa  105  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351154  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4904  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.16 
 
 
377 aa  104  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316996  normal  0.149852 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1078  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.01 
 
 
383 aa  103  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  26.22 
 
 
379 aa  103  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.85 
 
 
379 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5323  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.32 
 
 
377 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00118834  normal  0.0149252 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0714  Acyl-CoA dehydrogenase  27.34 
 
 
377 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3404  acyl-CoA dehydrogenase-like  27.07 
 
 
377 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4963  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.07 
 
 
377 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5319  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  27.1 
 
 
385 aa  101  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.398534  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2187  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.06 
 
 
385 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.1 
 
 
382 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1158  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.03 
 
 
380 aa  100  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  26.37 
 
 
379 aa  100  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5908  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  26.87 
 
 
385 aa  100  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276142  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25932  short chain acyl-coenzyme A dehydrogenase  28.21 
 
 
436 aa  99.8  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01762  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  27.57 
 
 
385 aa  99.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.272038 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1559  acyl-CoA dehydrogenase-like  27.75 
 
 
387 aa  99.4  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.456319 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3613  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.53 
 
 
382 aa  99.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4293  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.08 
 
 
383 aa  99  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2826  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.67 
 
 
385 aa  97.4  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1555  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.17 
 
 
383 aa  97.4  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0264  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.15 
 
 
394 aa  97.4  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0644181  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.14 
 
 
386 aa  97.1  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30500  butyryl-CoA dehydrogenase  26.02 
 
 
385 aa  95.9  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.262375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2865  Acyl-CoA dehydrogenase-like  25.69 
 
 
383 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0509295  normal  0.212771 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4050  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.6 
 
 
383 aa  95.9  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.795074  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1191  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.6 
 
 
386 aa  95.9  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43420  putative acyl-CoA dehydrogenase  27.75 
 
 
384 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0779209  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0198  butyryl-CoA dehydrogenase  28.3 
 
 
386 aa  96.3  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.286709  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3683  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.08 
 
 
384 aa  95.1  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.685138 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1596  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.8 
 
 
593 aa  95.5  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0612446  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0838  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.03 
 
 
382 aa  94.7  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.541206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0274  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.86 
 
 
382 aa  94.7  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.630772  normal  0.481537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3642  putative acyl-CoA dehydrogenase  27.69 
 
 
384 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1172  acyl-CoA dehydrogenase  28.86 
 
 
384 aa  94  8e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.336122 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2082  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.09 
 
 
376 aa  94  9e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1233  acyl-CoA dehydrogenase-like  28.86 
 
 
384 aa  94  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.831269  normal  0.440096 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1556  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.9 
 
 
386 aa  94  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01550  acyl-CoA oxidase, putative  23.94 
 
 
429 aa  93.6  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4169  butyryl-CoA dehydrogenase  28.53 
 
 
383 aa  93.2  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0614852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4181  butyryl-CoA dehydrogenase  28.53 
 
 
383 aa  93.2  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181503  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1816  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  26.39 
 
 
429 aa  93.2  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0196409  hitchhiker  0.006326 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08210  butyryl-CoA dehydrogenase  24.88 
 
 
394 aa  93.2  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.249284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0906  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.17 
 
 
380 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6770  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.9 
 
 
390 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210456  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3197  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.37 
 
 
381 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107231  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>