More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_39759 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_75424  Acyl-coenzyme A oxidase 4 (Acyl-CoA oxidase 4) (AOX 4)  54.07 
 
 
714 aa  782    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.230455 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39759  Acyl-coenzyme A oxidase (Acyl-CoA oxidase)  100 
 
 
725 aa  1515    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.410007  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00320  Acyl-coenzyme A oxidase I, putative  37.54 
 
 
702 aa  441  9.999999999999999e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13743  predicted protein  28.45 
 
 
695 aa  280  6e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06752  fatty-acyl coenzyme A oxidase (Pox1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06090)  32.47 
 
 
696 aa  270  5e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.327675 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3394  acyl-CoA oxidase domain-containing protein  29.66 
 
 
752 aa  242  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.943742  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1022  acyl-CoA oxidase domain protein  29.52 
 
 
677 aa  230  9e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.899617  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19979  precursor of oxidase acyl-coa oxidase  27.45 
 
 
706 aa  221  3e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.304645  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23500  acyl-CoA dehydrogenase  33.13 
 
 
713 aa  220  6e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165225  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2726  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.77 
 
 
653 aa  216  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2239  hypothetical protein  35.22 
 
 
659 aa  215  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.823485  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3221  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.26 
 
 
656 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21270  acyl-CoA dehydrogenase  30.15 
 
 
663 aa  212  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.577955  normal  0.0824021 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4030  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.58 
 
 
660 aa  211  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3446  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.46 
 
 
645 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10069  normal  0.195202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3435  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  29.46 
 
 
645 aa  211  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3498  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.46 
 
 
645 aa  211  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.491542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3808  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.11 
 
 
669 aa  210  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0851987  normal  0.621517 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31740  acyl-CoA dehydrogenase  34.33 
 
 
637 aa  208  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3111  acyl-CoA oxidase domain protein  28.69 
 
 
713 aa  206  9e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322908  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3568  acyl-CoA oxidase domain protein  34.27 
 
 
694 aa  204  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307135  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11700  acyl-CoA dehydrogenase  34.51 
 
 
707 aa  204  6e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.20402  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0437  acyl-CoA oxidase domain-containing protein  30.04 
 
 
657 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.266811  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3363  acyl-CoA oxidase domain protein  28.42 
 
 
628 aa  200  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.482845 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2142  acyl-CoA oxidase domain-containing protein  28.11 
 
 
704 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.315023  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0678  acyl-CoA oxidase domain protein  35.93 
 
 
654 aa  196  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.546337  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2376  acyl-CoA oxidase domain protein  28.19 
 
 
690 aa  194  4e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0709206 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1889  acyl-CoA oxidase domain protein  27.59 
 
 
701 aa  192  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000501892 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0304  acyl-CoA oxidase domain protein  33.33 
 
 
670 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2935  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.51 
 
 
691 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.386939 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34870  acyl-CoA dehydrogenase  32.63 
 
 
694 aa  171  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06765  conserved hypothetical protein  26.83 
 
 
695 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2861  cytochrome P450n  26.51 
 
 
938 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4651  hypothetical protein  25 
 
 
565 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.102009  normal  0.0123492 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26886  predicted protein  29.61 
 
 
492 aa  80.5  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.772551 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2318  acyl-CoA dehydrogenase  23.63 
 
 
569 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3006  acyl-CoA dehydrogenase  23.63 
 
 
569 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.659019 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2935  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.64 
 
 
594 aa  72  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.631694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2380  acyl-CoA dehydrogenase  22.57 
 
 
569 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0460378  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1727  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.26 
 
 
569 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2159  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.75 
 
 
569 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.235512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2128  acyl-CoA dehydrogenase  23.75 
 
 
569 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.422532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2453  acyl-CoA dehydrogenase  23.44 
 
 
569 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2114  acyl-CoA dehydrogenase  23.75 
 
 
569 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.575523  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2371  acyl-CoA dehydrogenase  23.12 
 
 
569 aa  67.4  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2191  acyl-CoA dehydrogenase  23.75 
 
 
569 aa  67  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2352  acyl-CoA dehydrogenase  23.75 
 
 
569 aa  67  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6234  hypothetical protein  23.91 
 
 
582 aa  67  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.17 
 
 
381 aa  65.9  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3086  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.75 
 
 
594 aa  65.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1172  acyl-CoA dehydrogenase  22.76 
 
 
384 aa  64.3  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.336122 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1233  acyl-CoA dehydrogenase-like  22.76 
 
 
384 aa  64.3  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.831269  normal  0.440096 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1078  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.41 
 
 
383 aa  63.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3470  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.14 
 
 
395 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.131363  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1804  butyryl-CoA dehydrogenase  22.93 
 
 
386 aa  63.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4456  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.77 
 
 
403 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0148  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.82 
 
 
385 aa  62  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3740  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  23.32 
 
 
382 aa  62  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421985  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5685  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.21 
 
 
452 aa  62  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3813  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.32 
 
 
382 aa  62  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.285243 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0130  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.71 
 
 
385 aa  62  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2307  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.35 
 
 
381 aa  61.6  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3752  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.32 
 
 
382 aa  61.6  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1807  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.4 
 
 
578 aa  61.6  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9558  normal  0.985453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3683  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.93 
 
 
384 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.685138 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1573  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.12 
 
 
404 aa  61.2  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25932  short chain acyl-coenzyme A dehydrogenase  26.38 
 
 
436 aa  61.2  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1603  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  33.12 
 
 
404 aa  61.2  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.936409  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1627  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.12 
 
 
404 aa  61.2  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1850  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.2 
 
 
385 aa  60.8  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.090649  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1038  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.25 
 
 
597 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7329  Acyl-CoA dehydrogenase  22.25 
 
 
383 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4272  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.63 
 
 
390 aa  60.1  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0196507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0906  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.44 
 
 
380 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.96 
 
 
380 aa  59.3  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3467  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.43 
 
 
385 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0842785 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4539  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.43 
 
 
385 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.452852  normal  0.739278 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1224  acyl-CoA dehydrogenase-like  22.49 
 
 
394 aa  58.9  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0161366  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2382  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  21.98 
 
 
389 aa  58.9  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3589  acyl-CoA dehydrogenase  21.52 
 
 
597 aa  58.9  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.239864  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0434  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.71 
 
 
404 aa  58.9  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3043  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.26 
 
 
402 aa  58.9  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.942472  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1596  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.76 
 
 
593 aa  58.5  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0612446  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13161  acyl-CoA dehydrogenase fadE23  33.87 
 
 
401 aa  58.2  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5112  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  19.8 
 
 
599 aa  57.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0274  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.37 
 
 
382 aa  57.8  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.630772  normal  0.481537 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3053  Acyl-CoA dehydrogenase  22.86 
 
 
381 aa  57.8  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.75901 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1906  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.52 
 
 
408 aa  57.4  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1109  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.46 
 
 
388 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2500  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.88 
 
 
386 aa  57  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0453809  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4391  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.57 
 
 
386 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1386  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.57 
 
 
385 aa  57  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06170  acetyl-CoA dehydrogenase  22.96 
 
 
602 aa  57.4  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0096  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  25.22 
 
 
378 aa  56.2  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0160842  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.05 
 
 
377 aa  56.2  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0217  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.8 
 
 
403 aa  56.2  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2826  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.26 
 
 
385 aa  56.6  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0223  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.8 
 
 
403 aa  56.2  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5007  acyl-CoA dehydrogenase  24.35 
 
 
378 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1179  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  26.61 
 
 
392 aa  55.8  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>