More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31740 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_31740  acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
637 aa  1286    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2726  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.63 
 
 
653 aa  675    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2239  hypothetical protein  65.88 
 
 
659 aa  772    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.823485  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3363  acyl-CoA oxidase domain protein  69.7 
 
 
628 aa  860    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.482845 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1022  acyl-CoA oxidase domain protein  52.34 
 
 
677 aa  644    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.899617  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3435  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  54.37 
 
 
645 aa  689    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78233  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21270  acyl-CoA dehydrogenase  54.52 
 
 
663 aa  649    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.577955  normal  0.0824021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3446  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.53 
 
 
645 aa  692    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10069  normal  0.195202 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0437  acyl-CoA oxidase domain-containing protein  54.95 
 
 
657 aa  649    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.266811  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3498  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.37 
 
 
645 aa  689    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.491542 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0304  acyl-CoA oxidase domain protein  63.4 
 
 
670 aa  759    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3808  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.73 
 
 
669 aa  677    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0851987  normal  0.621517 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3221  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  63.42 
 
 
656 aa  768    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4030  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  56.16 
 
 
660 aa  634  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0678  acyl-CoA oxidase domain protein  51.09 
 
 
654 aa  600  1e-170  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.546337  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2376  acyl-CoA oxidase domain protein  47.1 
 
 
690 aa  541  9.999999999999999e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0709206 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2935  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.38 
 
 
691 aa  533  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.386939 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1889  acyl-CoA oxidase domain protein  48.02 
 
 
701 aa  533  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000501892 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11700  acyl-CoA dehydrogenase  48.04 
 
 
707 aa  519  1e-146  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.20402  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3394  acyl-CoA oxidase domain-containing protein  42.38 
 
 
752 aa  521  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.943742  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3568  acyl-CoA oxidase domain protein  47.73 
 
 
694 aa  513  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307135  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3111  acyl-CoA oxidase domain protein  47.93 
 
 
713 aa  510  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322908  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2142  acyl-CoA oxidase domain-containing protein  46.87 
 
 
704 aa  510  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.315023  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34870  acyl-CoA dehydrogenase  47.15 
 
 
694 aa  491  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23500  acyl-CoA dehydrogenase  46.58 
 
 
713 aa  480  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165225  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00320  Acyl-coenzyme A oxidase I, putative  33.81 
 
 
702 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13743  predicted protein  32.65 
 
 
695 aa  233  7.000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06752  fatty-acyl coenzyme A oxidase (Pox1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06090)  31.55 
 
 
696 aa  220  6e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.327675 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39759  Acyl-coenzyme A oxidase (Acyl-CoA oxidase)  34.33 
 
 
725 aa  209  2e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.410007  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75424  Acyl-coenzyme A oxidase 4 (Acyl-CoA oxidase 4) (AOX 4)  28.75 
 
 
714 aa  202  1.9999999999999998e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.230455 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19979  precursor of oxidase acyl-coa oxidase  28.55 
 
 
706 aa  199  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.304645  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06765  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
695 aa  146  9e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2861  cytochrome P450n  28.41 
 
 
938 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6234  hypothetical protein  26.24 
 
 
582 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.27 
 
 
386 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.2 
 
 
402 aa  111  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.86 
 
 
379 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1804  butyryl-CoA dehydrogenase  30.46 
 
 
386 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  26.86 
 
 
379 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2187  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.38 
 
 
385 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4651  hypothetical protein  27.22 
 
 
565 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.102009  normal  0.0123492 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3506  butyryl-CoA dehydrogenase  27.94 
 
 
399 aa  108  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.428352  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4293  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.95 
 
 
383 aa  106  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7329  Acyl-CoA dehydrogenase  26.76 
 
 
383 aa  106  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3467  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.52 
 
 
385 aa  105  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0842785 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4539  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.52 
 
 
385 aa  105  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.452852  normal  0.739278 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3197  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.15 
 
 
381 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107231  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1359  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.5 
 
 
381 aa  103  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3185  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  27.15 
 
 
381 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3247  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.15 
 
 
381 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1570  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.6 
 
 
383 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  26.6 
 
 
379 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3613  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.27 
 
 
382 aa  101  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1172  acyl-CoA dehydrogenase  26.98 
 
 
384 aa  101  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.336122 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1233  acyl-CoA dehydrogenase-like  26.98 
 
 
384 aa  101  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.831269  normal  0.440096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4054  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.47 
 
 
384 aa  100  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2554  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.65 
 
 
386 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6410  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  28.5 
 
 
385 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603602 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2093  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.44 
 
 
398 aa  99  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0300334  normal  0.0497691 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30500  butyryl-CoA dehydrogenase  28.95 
 
 
385 aa  99  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.262375 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3683  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.79 
 
 
384 aa  99  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.685138 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12522  acyl-CoA dehydrogenase fadE19  28.76 
 
 
394 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3552  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  27.97 
 
 
396 aa  98.6  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4180  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.21 
 
 
383 aa  98.6  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.32 
 
 
380 aa  98.6  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0176  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.18 
 
 
385 aa  98.6  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142689  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01762  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  29.18 
 
 
385 aa  98.2  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.272038 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0081  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.62 
 
 
642 aa  97.4  7e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2632  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.34 
 
 
381 aa  97.4  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49444  normal  0.97315 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4753  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  28.12 
 
 
382 aa  97.4  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.231172  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3882  butyryl-CoA dehydrogenase  29.19 
 
 
395 aa  97.1  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.92 
 
 
380 aa  97.1  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2247  butyryl-CoA dehydrogenase  27.78 
 
 
383 aa  97.1  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.176219  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0148  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.76 
 
 
385 aa  96.7  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1224  acyl-CoA dehydrogenase-like  24.15 
 
 
394 aa  97.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0161366  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0697  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.01 
 
 
380 aa  96.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0130  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.76 
 
 
385 aa  96.7  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1158  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.59 
 
 
380 aa  96.3  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2500  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.08 
 
 
386 aa  96.3  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0453809  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6770  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.84 
 
 
390 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210456  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5908  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  28.31 
 
 
385 aa  95.9  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276142  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4587  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.38 
 
 
380 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24700  acyl-CoA dehydrogenase  28.08 
 
 
373 aa  95.5  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791758  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3266  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.7 
 
 
385 aa  95.5  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  0.605117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1109  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.3 
 
 
388 aa  95.5  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0034  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.27 
 
 
384 aa  95.1  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211865  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0274  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.15 
 
 
382 aa  95.5  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.630772  normal  0.481537 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1405  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.27 
 
 
391 aa  94.7  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000121185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0028  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.08 
 
 
384 aa  95.1  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1015  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.49 
 
 
381 aa  94.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3634  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.72 
 
 
386 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0647428  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1740  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.53 
 
 
397 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0177648  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1759  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  27.53 
 
 
397 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.37 
 
 
386 aa  94.7  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1806  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.53 
 
 
397 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4228  isovaleryl-CoA dehydrogenase  30.25 
 
 
385 aa  94.7  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.66405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4601  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.05 
 
 
381 aa  94.7  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5666  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.09 
 
 
381 aa  94  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.764925  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0463  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.89 
 
 
385 aa  94  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.547783  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0103  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.72 
 
 
384 aa  93.6  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.250582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>