34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6234 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6234  hypothetical protein  100 
 
 		 582 aa  1173    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4651  hypothetical protein  28.11 
 
 		 565 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.102009  normal  0.0123492 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31740  acyl-CoA dehydrogenase  26.97 
 
 		 637 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2239  hypothetical protein  32.39 
 
 		 659 aa  127  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.823485  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3394  acyl-CoA oxidase domain-containing protein  23.05 
 
 		 752 aa  127  8.000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.943742  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2376  acyl-CoA oxidase domain protein  26.76 
 
 		 690 aa  121  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0709206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3221  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.97 
 
 		 656 aa  118  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3363  acyl-CoA oxidase domain protein  26.64 
 
 		 628 aa  117  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.482845 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3111  acyl-CoA oxidase domain protein  27.15 
 
 		 713 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322908  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4030  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.7 
 
 		 660 aa  116  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3808  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.76 
 
 		 669 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0851987  normal  0.621517 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11700  acyl-CoA dehydrogenase  25.59 
 
 		 707 aa  114  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.20402  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2935  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.26 
 
 		 691 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.386939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2142  acyl-CoA oxidase domain-containing protein  26.65 
 
 		 704 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.315023  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2726  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.47 
 
 		 653 aa  109  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21270  acyl-CoA dehydrogenase  27.77 
 
 		 663 aa  108  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.577955  normal  0.0824021 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0437  acyl-CoA oxidase domain-containing protein  26.51 
 
 		 657 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.266811  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1889  acyl-CoA oxidase domain protein  26.23 
 
 		 701 aa  107  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000501892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34870  acyl-CoA dehydrogenase  26.61 
 
 		 694 aa  98.6  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0304  acyl-CoA oxidase domain protein  26.91 
 
 		 670 aa  95.1  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3446  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.94 
 
 		 645 aa  94.7  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10069  normal  0.195202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3435  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  22.65 
 
 		 645 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3498  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.65 
 
 		 645 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.491542 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23500  acyl-CoA dehydrogenase  26.07 
 
 		 713 aa  84  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165225  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00320  Acyl-coenzyme A oxidase I, putative  24.54 
 
 		 702 aa  83.6  0.000000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1022  acyl-CoA oxidase domain protein  22.9 
 
 		 677 aa  84  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.899617  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0678  acyl-CoA oxidase domain protein  23.79 
 
 		 654 aa  79.3  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.546337  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2861  cytochrome P450n  23.67 
 
 		 938 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13743  predicted protein  23.93 
 
 		 695 aa  76.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06752  fatty-acyl coenzyme A oxidase (Pox1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06090)  23.68 
 
 		 696 aa  75.1  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.327675 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3568  acyl-CoA oxidase domain protein  24.57 
 
 		 694 aa  75.1  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39759  Acyl-coenzyme A oxidase (Acyl-CoA oxidase)  23.91 
 
 		 725 aa  66.6  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.410007  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75424  Acyl-coenzyme A oxidase 4 (Acyl-CoA oxidase 4) (AOX 4)  24.09 
 
 		 714 aa  61.6  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.230455 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19979  precursor of oxidase acyl-coa oxidase  24.04 
 
 		 706 aa  61.6  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.304645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>