More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3221 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_21270  acyl-CoA dehydrogenase  54.89 
 
 
663 aa  672    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.577955  normal  0.0824021 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2239  hypothetical protein  71.18 
 
 
659 aa  889    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.823485  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4030  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  56.11 
 
 
660 aa  650    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3446  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.39 
 
 
645 aa  674    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10069  normal  0.195202 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3221  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 
656 aa  1330    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0304  acyl-CoA oxidase domain protein  62.36 
 
 
670 aa  772    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2726  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.16 
 
 
653 aa  678    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3435  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  54.23 
 
 
645 aa  671    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78233  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1022  acyl-CoA oxidase domain protein  51.39 
 
 
677 aa  644    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.899617  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31740  acyl-CoA dehydrogenase  63.27 
 
 
637 aa  766    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0437  acyl-CoA oxidase domain-containing protein  53.64 
 
 
657 aa  636    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.266811  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3363  acyl-CoA oxidase domain protein  62.46 
 
 
628 aa  759    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.482845 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3498  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.23 
 
 
645 aa  671    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.491542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3808  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.04 
 
 
669 aa  679    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0851987  normal  0.621517 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0678  acyl-CoA oxidase domain protein  49.76 
 
 
654 aa  581  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.546337  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1889  acyl-CoA oxidase domain protein  48.22 
 
 
701 aa  558  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000501892 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2142  acyl-CoA oxidase domain-containing protein  46.86 
 
 
704 aa  544  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.315023  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3568  acyl-CoA oxidase domain protein  48.86 
 
 
694 aa  540  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307135  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2935  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.01 
 
 
691 aa  540  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.386939 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3111  acyl-CoA oxidase domain protein  47.54 
 
 
713 aa  536  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322908  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34870  acyl-CoA dehydrogenase  47.63 
 
 
694 aa  534  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2376  acyl-CoA oxidase domain protein  46.79 
 
 
690 aa  523  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0709206 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11700  acyl-CoA dehydrogenase  45.41 
 
 
707 aa  520  1e-146  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.20402  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3394  acyl-CoA oxidase domain-containing protein  42.27 
 
 
752 aa  517  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.943742  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23500  acyl-CoA dehydrogenase  45.9 
 
 
713 aa  504  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165225  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00320  Acyl-coenzyme A oxidase I, putative  31.59 
 
 
702 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13743  predicted protein  32.92 
 
 
695 aa  246  8e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19979  precursor of oxidase acyl-coa oxidase  28.57 
 
 
706 aa  220  7e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.304645  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06752  fatty-acyl coenzyme A oxidase (Pox1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06090)  30.56 
 
 
696 aa  216  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.327675 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39759  Acyl-coenzyme A oxidase (Acyl-CoA oxidase)  30.26 
 
 
725 aa  215  1.9999999999999998e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.410007  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75424  Acyl-coenzyme A oxidase 4 (Acyl-CoA oxidase 4) (AOX 4)  28.62 
 
 
714 aa  205  2e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.230455 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06765  conserved hypothetical protein  28.62 
 
 
695 aa  167  5.9999999999999996e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2861  cytochrome P450n  30.24 
 
 
938 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6234  hypothetical protein  27.97 
 
 
582 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1804  butyryl-CoA dehydrogenase  31.11 
 
 
386 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4651  hypothetical protein  26.78 
 
 
565 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.102009  normal  0.0123492 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4117  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.88 
 
 
386 aa  98.6  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.92 
 
 
388 aa  98.6  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0119178  unclonable  0.00000752707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3470  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.87 
 
 
395 aa  97.1  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.131363  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3185  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  26.82 
 
 
381 aa  97.1  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3197  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.82 
 
 
381 aa  97.1  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107231  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3247  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.82 
 
 
381 aa  97.1  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7329  Acyl-CoA dehydrogenase  26.82 
 
 
383 aa  96.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1187  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.43 
 
 
381 aa  97.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2187  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.68 
 
 
385 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4539  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.12 
 
 
385 aa  95.9  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.452852  normal  0.739278 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3467  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.12 
 
 
385 aa  95.9  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0842785 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1224  acyl-CoA dehydrogenase-like  26.65 
 
 
394 aa  95.5  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0161366  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.77 
 
 
402 aa  96.3  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1015  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.97 
 
 
381 aa  95.1  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.25 
 
 
386 aa  95.1  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0463  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.4 
 
 
385 aa  95.1  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.547783  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1158  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.27 
 
 
380 aa  94.7  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3613  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.58 
 
 
382 aa  94.7  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1109  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.44 
 
 
388 aa  94.7  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.82 
 
 
380 aa  94.4  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26886  predicted protein  35.71 
 
 
492 aa  93.6  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.772551 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  25.79 
 
 
379 aa  92.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1221  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  28.12 
 
 
466 aa  92.8  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.395809  normal  0.664246 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30500  butyryl-CoA dehydrogenase  27.23 
 
 
385 aa  92.8  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.262375 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0148  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.12 
 
 
385 aa  92  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01762  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  28.24 
 
 
385 aa  92  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.272038 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.26 
 
 
379 aa  92  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0176  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.4 
 
 
385 aa  92  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142689  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2500  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.6 
 
 
386 aa  91.7  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0453809  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0130  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.12 
 
 
385 aa  92  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1172  acyl-CoA dehydrogenase  27.43 
 
 
384 aa  91.7  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.336122 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0274  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.73 
 
 
382 aa  91.7  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.630772  normal  0.481537 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1233  acyl-CoA dehydrogenase-like  27.43 
 
 
384 aa  91.7  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.831269  normal  0.440096 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3923  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.06 
 
 
381 aa  91.7  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3683  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.56 
 
 
384 aa  90.9  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.685138 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0838  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.92 
 
 
382 aa  91.3  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.541206 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2247  butyryl-CoA dehydrogenase  27.27 
 
 
383 aa  90.9  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.176219  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24700  acyl-CoA dehydrogenase  26.25 
 
 
373 aa  90.9  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791758  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  24.29 
 
 
379 aa  90.5  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6410  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  27.43 
 
 
385 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0081  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.94 
 
 
642 aa  89.7  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0028  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.79 
 
 
384 aa  89.7  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5007  acyl-CoA dehydrogenase  27.66 
 
 
378 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2436  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.65 
 
 
383 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3652  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.09 
 
 
584 aa  89  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4308  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.03 
 
 
380 aa  89  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.828452  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4074  Acyl-CoA dehydrogenase-like  25.88 
 
 
381 aa  88.6  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0264  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.92 
 
 
394 aa  88.6  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0644181  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4078  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  27.03 
 
 
380 aa  89  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4293  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.53 
 
 
383 aa  88.6  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4154  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.03 
 
 
380 aa  89  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.815208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4050  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.02 
 
 
383 aa  88.6  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.795074  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0220  acyl-CoA dehydrogenase  26.46 
 
 
384 aa  88.6  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0793985  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0906  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.94 
 
 
380 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4587  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.23 
 
 
380 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3492  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.35 
 
 
383 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4054  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.43 
 
 
384 aa  87.8  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.06 
 
 
379 aa  87.8  6e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2279  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.35 
 
 
383 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3810  acyl-CoA dehydrogenase-like  25.88 
 
 
381 aa  87.4  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409064  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1386  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.24 
 
 
385 aa  87.4  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6291  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.91 
 
 
379 aa  87.4  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0697  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.08 
 
 
380 aa  87  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0898  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.88 
 
 
379 aa  87  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.592416  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>