More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0437 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2239  hypothetical protein  57.02 
 
 
659 aa  640    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.823485  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3363  acyl-CoA oxidase domain protein  55.52 
 
 
628 aa  650    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.482845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0304  acyl-CoA oxidase domain protein  55.77 
 
 
670 aa  644    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0437  acyl-CoA oxidase domain-containing protein  100 
 
 
657 aa  1332    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.266811  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31740  acyl-CoA dehydrogenase  54.32 
 
 
637 aa  634  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3221  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.64 
 
 
656 aa  622  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3808  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.11 
 
 
669 aa  622  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0851987  normal  0.621517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2726  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.48 
 
 
653 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0678  acyl-CoA oxidase domain protein  51 
 
 
654 aa  593  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.546337  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1022  acyl-CoA oxidase domain protein  49.61 
 
 
677 aa  593  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.899617  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3435  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  50.7 
 
 
645 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3498  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.7 
 
 
645 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.491542 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3446  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.7 
 
 
645 aa  592  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10069  normal  0.195202 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4030  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.07 
 
 
660 aa  567  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21270  acyl-CoA dehydrogenase  47.07 
 
 
663 aa  543  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.577955  normal  0.0824021 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1889  acyl-CoA oxidase domain protein  47.15 
 
 
701 aa  528  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000501892 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2935  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.96 
 
 
691 aa  509  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.386939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2142  acyl-CoA oxidase domain-containing protein  46.71 
 
 
704 aa  508  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.315023  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3111  acyl-CoA oxidase domain protein  45.36 
 
 
713 aa  504  1e-141  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322908  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3394  acyl-CoA oxidase domain-containing protein  41.64 
 
 
752 aa  502  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.943742  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11700  acyl-CoA dehydrogenase  45.43 
 
 
707 aa  494  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.20402  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3568  acyl-CoA oxidase domain protein  44.73 
 
 
694 aa  487  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307135  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34870  acyl-CoA dehydrogenase  45.13 
 
 
694 aa  485  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2376  acyl-CoA oxidase domain protein  42.11 
 
 
690 aa  483  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0709206 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23500  acyl-CoA dehydrogenase  43.37 
 
 
713 aa  443  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165225  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00320  Acyl-coenzyme A oxidase I, putative  30.09 
 
 
702 aa  251  3e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19979  precursor of oxidase acyl-coa oxidase  31.34 
 
 
706 aa  202  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.304645  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39759  Acyl-coenzyme A oxidase (Acyl-CoA oxidase)  30.04 
 
 
725 aa  202  1.9999999999999998e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.410007  normal  0.203181 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06752  fatty-acyl coenzyme A oxidase (Pox1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06090)  34.53 
 
 
696 aa  194  5e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.327675 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13743  predicted protein  29.43 
 
 
695 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75424  Acyl-coenzyme A oxidase 4 (Acyl-CoA oxidase 4) (AOX 4)  29.84 
 
 
714 aa  182  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.230455 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2861  cytochrome P450n  30.66 
 
 
938 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06765  conserved hypothetical protein  27.9 
 
 
695 aa  148  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1804  butyryl-CoA dehydrogenase  29.25 
 
 
386 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4651  hypothetical protein  26.91 
 
 
565 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.102009  normal  0.0123492 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1224  acyl-CoA dehydrogenase-like  26.2 
 
 
394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0161366  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4358  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.68 
 
 
381 aa  109  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1187  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.72 
 
 
381 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.25 
 
 
375 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.75 
 
 
377 aa  105  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6234  hypothetical protein  29.77 
 
 
582 aa  105  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3197  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.32 
 
 
381 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107231  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.95 
 
 
379 aa  103  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3185  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  27.32 
 
 
381 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3247  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.32 
 
 
381 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4293  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.64 
 
 
383 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.68 
 
 
375 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0292697  normal  0.208883 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2500  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.92 
 
 
386 aa  101  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0453809  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2909  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.52 
 
 
389 aa  101  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5152  putative acyl-CoA dehydrogenase  25.34 
 
 
381 aa  101  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.276621 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4753  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  26.08 
 
 
382 aa  100  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.231172  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6770  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.53 
 
 
390 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210456  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  26.71 
 
 
379 aa  100  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1586  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.63 
 
 
389 aa  100  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1570  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.64 
 
 
383 aa  99.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.83 
 
 
402 aa  99  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4074  Acyl-CoA dehydrogenase-like  24.89 
 
 
381 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.23 
 
 
375 aa  99  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0264  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.36 
 
 
394 aa  99  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0644181  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.88 
 
 
381 aa  98.2  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4257  butyryl-CoA dehydrogenase  28.28 
 
 
377 aa  98.2  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.725306  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7329  Acyl-CoA dehydrogenase  25.4 
 
 
383 aa  98.2  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.81 
 
 
382 aa  98.2  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.49 
 
 
375 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3810  acyl-CoA dehydrogenase-like  24.49 
 
 
381 aa  97.8  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409064  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1175  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.35 
 
 
381 aa  97.1  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.25 
 
 
388 aa  97.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0119178  unclonable  0.00000752707 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1555  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.59 
 
 
383 aa  96.3  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.69 
 
 
376 aa  96.3  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4372  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.87 
 
 
374 aa  95.5  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4539  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.18 
 
 
385 aa  96.3  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.452852  normal  0.739278 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1596  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.22 
 
 
593 aa  95.9  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0612446  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1807  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.59 
 
 
578 aa  96.3  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9558  normal  0.985453 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3467  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.18 
 
 
385 aa  96.3  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0842785 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3010  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  27.59 
 
 
387 aa  95.9  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.157219 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0351  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.77 
 
 
586 aa  95.9  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1052  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.94 
 
 
386 aa  95.5  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4367  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.37 
 
 
418 aa  95.5  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0847  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.59 
 
 
386 aa  95.5  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2307  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.69 
 
 
381 aa  95.1  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0176  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.07 
 
 
385 aa  95.1  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142689  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.22 
 
 
396 aa  94.4  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.480554  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0220  acyl-CoA dehydrogenase  26.84 
 
 
384 aa  94.4  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0793985  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1109  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.01 
 
 
388 aa  94.4  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2159  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25 
 
 
569 aa  94.4  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.235512  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0391  acyl-CoA dehydrogenase  26.1 
 
 
375 aa  94.4  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.31925  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3850  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.58 
 
 
380 aa  94  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5908  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  24.41 
 
 
385 aa  94  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276142  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0268  butyryl-CoA dehydrogenase  23.33 
 
 
379 aa  94  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4927  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.58 
 
 
380 aa  94  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.905693 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2632  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.35 
 
 
381 aa  94  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49444  normal  0.97315 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0096  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  26.07 
 
 
378 aa  93.2  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0160842  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2885  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.3 
 
 
383 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4384  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.07 
 
 
375 aa  93.2  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17615  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1727  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.32 
 
 
569 aa  92.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3683  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.78 
 
 
384 aa  92.8  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.685138 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3006  acyl-CoA dehydrogenase  24.77 
 
 
569 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.659019 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  25.77 
 
 
379 aa  92.8  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2352  acyl-CoA dehydrogenase  24.77 
 
 
569 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2436  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.3 
 
 
383 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>