More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2247 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2247  butyryl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
383 aa  775    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.176219  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4050  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  85.64 
 
 
383 aa  650    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.795074  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2187  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  73.23 
 
 
385 aa  575  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0028  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  73.89 
 
 
384 aa  570  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0034  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  73.63 
 
 
384 aa  570  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211865  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3629  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  75.66 
 
 
386 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3702  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  75.66 
 
 
386 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.646071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3634  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  75.4 
 
 
386 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0647428  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1359  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  71.16 
 
 
381 aa  560  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4089  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  77.25 
 
 
386 aa  558  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0445399  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2554  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  73.81 
 
 
386 aa  553  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1387  butyryl-CoA dehydrogenase  71.58 
 
 
387 aa  553  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1474  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  70.5 
 
 
384 aa  550  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30500  butyryl-CoA dehydrogenase  70.23 
 
 
385 aa  550  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.262375 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3266  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  70.76 
 
 
385 aa  546  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  0.605117 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12522  acyl-CoA dehydrogenase fadE19  72.97 
 
 
394 aa  537  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6410  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  69.27 
 
 
385 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3319  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  71.69 
 
 
382 aa  532  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2151  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.74 
 
 
383 aa  532  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1405  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  68.54 
 
 
391 aa  529  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000121185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6228  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  68.93 
 
 
383 aa  525  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0946  butyryl-CoA dehydrogenase  70.71 
 
 
384 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0982418  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6416  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  67.98 
 
 
384 aa  517  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1974  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  69.79 
 
 
382 aa  508  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00328212  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06870  butyryl-CoA dehydrogenase  66.75 
 
 
395 aa  501  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0405  butyryl-CoA dehydrogenase  67.72 
 
 
388 aa  498  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3850  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  62.14 
 
 
388 aa  484  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.428744 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00480  butyryl-CoA dehydrogenase  59.95 
 
 
418 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2102  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  62.08 
 
 
394 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.563951  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1730  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  61.79 
 
 
396 aa  463  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.0345333 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08210  butyryl-CoA dehydrogenase  58.1 
 
 
394 aa  443  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.249284 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3506  butyryl-CoA dehydrogenase  57.73 
 
 
399 aa  441  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.428352  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0732  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  57.94 
 
 
379 aa  412  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.68 
 
 
382 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1707  butyryl-CoA dehydrogenase  54.64 
 
 
388 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000836039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.39 
 
 
380 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.79 
 
 
380 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.34 
 
 
381 aa  369  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  48.81 
 
 
381 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  48.81 
 
 
381 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  48.81 
 
 
381 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  48.81 
 
 
381 aa  365  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  48.81 
 
 
381 aa  365  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  48.81 
 
 
381 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  48.81 
 
 
381 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  48.81 
 
 
381 aa  364  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.54 
 
 
381 aa  364  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  48.54 
 
 
381 aa  363  3e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.68 
 
 
377 aa  347  2e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  46.95 
 
 
379 aa  344  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  46.95 
 
 
379 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.95 
 
 
379 aa  342  5e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.02 
 
 
382 aa  342  7e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  46.68 
 
 
379 aa  341  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  46.68 
 
 
379 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  46.68 
 
 
379 aa  340  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  46.68 
 
 
379 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.75 
 
 
379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  46.68 
 
 
379 aa  339  4e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  46.68 
 
 
379 aa  339  4e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0202  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.57 
 
 
382 aa  338  9e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221874  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  46.42 
 
 
379 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.97 
 
 
376 aa  333  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.56 
 
 
379 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.34 
 
 
380 aa  332  6e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.7 
 
 
381 aa  332  8e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6425  butyryl-CoA dehydrogenase  44.15 
 
 
380 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766323  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0714  Acyl-CoA dehydrogenase  46.44 
 
 
377 aa  328  7e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  46.17 
 
 
376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  46.17 
 
 
376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  46.17 
 
 
376 aa  327  3e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  46.17 
 
 
376 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  46.17 
 
 
376 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3404  acyl-CoA dehydrogenase-like  46.17 
 
 
377 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4963  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.17 
 
 
377 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  46.17 
 
 
376 aa  326  5e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.83 
 
 
380 aa  326  5e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.81 
 
 
383 aa  326  5e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  46.17 
 
 
381 aa  325  6e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5323  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.17 
 
 
377 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00118834  normal  0.0149252 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.23 
 
 
386 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  46.17 
 
 
381 aa  325  9e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  45.65 
 
 
381 aa  323  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4904  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.44 
 
 
377 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316996  normal  0.149852 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.54 
 
 
383 aa  323  4e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.17 
 
 
377 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351154  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.65 
 
 
377 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.21 
 
 
379 aa  320  3e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2026  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.95 
 
 
641 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000211003  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.01 
 
 
389 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.59 
 
 
379 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0247  Acyl-CoA dehydrogenase  45.67 
 
 
378 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1782  butyryl-CoA dehydrogenase  47.06 
 
 
379 aa  317  3e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.257154  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.85 
 
 
376 aa  316  5e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2163  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.09 
 
 
389 aa  315  9e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820192  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  43.09 
 
 
380 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  44.95 
 
 
379 aa  312  4.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.47 
 
 
380 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.82 
 
 
377 aa  309  6.999999999999999e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0391  acyl-CoA dehydrogenase  45.48 
 
 
375 aa  307  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.31925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>