More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5685 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5685  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 
452 aa  937    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1209  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  67.7 
 
 
453 aa  645    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01490  Acyl-CoA dehydrogenase  66.74 
 
 
453 aa  649    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3323  Glutaryl-CoA dehydrogenase  67.56 
 
 
454 aa  643    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000794594 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1396  Acyl-CoA dehydrogenase  64.01 
 
 
400 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.012547  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6905  Glutaryl-CoA dehydrogenase  62.02 
 
 
382 aa  498  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1221  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  52.61 
 
 
466 aa  490  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.395809  normal  0.664246 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0098  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.93 
 
 
442 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0434945  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3470  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.95 
 
 
395 aa  448  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.131363  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0077  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.44 
 
 
394 aa  429  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1365  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.79 
 
 
396 aa  411  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0100837  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1382  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50 
 
 
396 aa  408  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000229631 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2455  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  51.56 
 
 
398 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.19606  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3505  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.74 
 
 
393 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147907  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3043  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.74 
 
 
402 aa  392  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.942472  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0871  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.16 
 
 
409 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1809  Glutaryl-CoA dehydrogenase  51.7 
 
 
395 aa  384  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.141566  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2061  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  52.07 
 
 
404 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2382  Glutaryl-CoA dehydrogenase  47 
 
 
407 aa  364  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0739  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.65 
 
 
411 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0610  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.45 
 
 
410 aa  355  7.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.326898  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.64 
 
 
408 aa  350  3e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0375  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  44.91 
 
 
385 aa  335  9e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0434  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.82 
 
 
404 aa  334  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.77 
 
 
396 aa  333  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03070  acyl-CoA dehydrogenase  44.36 
 
 
404 aa  322  6e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02900  acyl-CoA dehydrogenase  41.56 
 
 
402 aa  318  2e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0031  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.85 
 
 
399 aa  313  4.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0217  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.56 
 
 
403 aa  310  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0223  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.56 
 
 
403 aa  310  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0987  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.59 
 
 
395 aa  309  6.999999999999999e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1746  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  41.15 
 
 
401 aa  307  3e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30270  acyl-CoA dehydrogenase  43.33 
 
 
461 aa  306  5.0000000000000004e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1877  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  40.89 
 
 
386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2387  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  42.56 
 
 
402 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.702715  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0223  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.62 
 
 
414 aa  301  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19560  acyl-CoA dehydrogenase  44 
 
 
400 aa  298  1e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0874  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.49 
 
 
419 aa  296  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3206  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.43 
 
 
392 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0674188  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0830  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.84 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.897667  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2905  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.66 
 
 
387 aa  280  3e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2522  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.06 
 
 
386 aa  280  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23170  acyl-CoA dehydrogenase  38.92 
 
 
408 aa  280  5e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3055  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.98 
 
 
399 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.712311  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0429  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.02 
 
 
386 aa  276  4e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4671  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.87 
 
 
396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0541  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.76 
 
 
384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2757  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.42 
 
 
396 aa  274  3e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133725 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0502  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.88 
 
 
387 aa  273  3e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2578  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.58 
 
 
386 aa  271  1e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8460  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.46 
 
 
391 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1745  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.62 
 
 
393 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0523297  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4408  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.71 
 
 
394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2075  Acyl-CoA dehydrogenase-like  38.18 
 
 
392 aa  270  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000570553  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0610  acyl-CoA dehydrogenase-like  36.53 
 
 
392 aa  270  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.777279  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17470  acyl-CoA dehydrogenase  36.57 
 
 
396 aa  270  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.773993  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0517  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.24 
 
 
386 aa  266  5e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.602895  decreased coverage  0.000687036 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10405  acyl-CoA dehydrogenase fadE7  36.99 
 
 
395 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4222  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.64 
 
 
389 aa  266  8e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1068  glutaryl-CoA dehydrogenase  36.91 
 
 
396 aa  265  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4378  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.11 
 
 
376 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00748225  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4147  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  35.11 
 
 
376 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0923518  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1408  acyl-CoA dehydrogenase  36.72 
 
 
392 aa  261  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.458942  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9061  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.2 
 
 
385 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0844  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.2 
 
 
396 aa  260  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.114761 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4513  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.14 
 
 
402 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2761  acyl-CoA dehydrogenase-like  38.18 
 
 
430 aa  259  8e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.192493  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0159  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.14 
 
 
397 aa  258  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.22 
 
 
389 aa  257  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3367  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.42 
 
 
385 aa  257  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1436  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.8 
 
 
415 aa  256  4e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.549354  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.63 
 
 
401 aa  256  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.68 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.480554  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04655  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  35.94 
 
 
392 aa  253  7e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4292  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.99 
 
 
389 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5749  glutaryl-CoA dehydrogenase  36.62 
 
 
387 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.312995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.2 
 
 
387 aa  249  9e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.7 
 
 
408 aa  247  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00258655  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1026  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.35 
 
 
402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3419  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.1 
 
 
394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0350417  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0608  acyl-CoA dehydrogenase  35.32 
 
 
404 aa  243  7e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1284  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.96 
 
 
404 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2231  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.84 
 
 
392 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4233  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.95 
 
 
394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0274104  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0753  acyl-CoA dehydrogenase-like  35.58 
 
 
404 aa  239  5e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.202646  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0805  putative glutaryl-CoA dehydrogenase  36.98 
 
 
394 aa  239  9e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.75963  normal  0.310028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1268  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.84 
 
 
413 aa  239  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.831834  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1536  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.01 
 
 
398 aa  239  1e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4712  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.58 
 
 
397 aa  238  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.145534 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1162  Acyl-CoA dehydrogenase-like  34.83 
 
 
404 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0873897  normal  0.0990997 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0815  glutaryl-CoA dehydrogenase  36.72 
 
 
394 aa  237  3e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0822  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.58 
 
 
394 aa  237  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2451  glutaryl-CoA dehydrogenase  34.81 
 
 
404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04805  acyl-CoA dehydrogenase 1  36.41 
 
 
391 aa  236  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1290  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.64 
 
 
393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0821  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.12 
 
 
409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384147  normal  0.990129 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2879  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  36.88 
 
 
400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1264  acyl-CoA dehydrogenase-like  35.17 
 
 
404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.51833  normal  0.675418 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4391  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.66 
 
 
386 aa  235  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4889  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.27 
 
 
392 aa  232  9e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378984  normal  0.687816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>