More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6905 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6905  Glutaryl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
382 aa  778    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1396  Acyl-CoA dehydrogenase  60.26 
 
 
400 aa  498  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.012547  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5685  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  62.02 
 
 
452 aa  498  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01490  Acyl-CoA dehydrogenase  59.48 
 
 
453 aa  486  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3323  Glutaryl-CoA dehydrogenase  58.66 
 
 
454 aa  476  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000794594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1209  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  57.25 
 
 
453 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1382  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  59.69 
 
 
396 aa  464  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000229631 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1365  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.64 
 
 
396 aa  457  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0100837  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1221  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  55.01 
 
 
466 aa  436  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.395809  normal  0.664246 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0098  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.32 
 
 
442 aa  413  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0434945  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3470  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.86 
 
 
395 aa  404  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.131363  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0610  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.29 
 
 
410 aa  401  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.326898  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0077  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  54.1 
 
 
394 aa  393  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0739  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.86 
 
 
411 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2455  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  52.34 
 
 
398 aa  382  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.19606  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3043  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.26 
 
 
402 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.942472  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0871  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.71 
 
 
409 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.2 
 
 
408 aa  363  3e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3505  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.96 
 
 
393 aa  356  5e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147907  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0434  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.7 
 
 
404 aa  352  5.9999999999999994e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.91 
 
 
396 aa  346  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1809  Glutaryl-CoA dehydrogenase  49.35 
 
 
395 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.141566  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2382  Glutaryl-CoA dehydrogenase  47.81 
 
 
407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2061  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  49.59 
 
 
404 aa  323  3e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2387  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  47.4 
 
 
402 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.702715  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02900  acyl-CoA dehydrogenase  44.2 
 
 
402 aa  305  7e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0375  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  45.08 
 
 
385 aa  305  7e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0031  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.04 
 
 
399 aa  290  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30270  acyl-CoA dehydrogenase  44.81 
 
 
461 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0217  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.53 
 
 
403 aa  286  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0223  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.53 
 
 
403 aa  286  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1746  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  40.83 
 
 
401 aa  278  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1877  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  40.57 
 
 
386 aa  276  6e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2578  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.7 
 
 
386 aa  273  3e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19560  acyl-CoA dehydrogenase  41.82 
 
 
400 aa  272  7e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03070  acyl-CoA dehydrogenase  40.78 
 
 
404 aa  271  1e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0987  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.9 
 
 
395 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2522  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.58 
 
 
386 aa  270  4e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0502  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.18 
 
 
387 aa  268  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0223  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.58 
 
 
414 aa  267  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3055  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.95 
 
 
399 aa  265  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.712311  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0830  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.32 
 
 
397 aa  264  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.897667  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2075  Acyl-CoA dehydrogenase-like  39.64 
 
 
392 aa  263  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000570553  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2905  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.4 
 
 
387 aa  258  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2757  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.74 
 
 
396 aa  258  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133725 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3206  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.86 
 
 
392 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0674188  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2761  acyl-CoA dehydrogenase-like  38.96 
 
 
430 aa  257  3e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.192493  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0874  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.12 
 
 
419 aa  256  5e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1068  glutaryl-CoA dehydrogenase  39.48 
 
 
396 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0610  acyl-CoA dehydrogenase-like  36.1 
 
 
392 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.777279  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1408  acyl-CoA dehydrogenase  38.02 
 
 
392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.458942  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.02 
 
 
396 aa  252  7e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.480554  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8460  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.14 
 
 
391 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1745  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.4 
 
 
393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0523297  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0159  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.76 
 
 
397 aa  243  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0541  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.2 
 
 
384 aa  242  7e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1026  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.27 
 
 
402 aa  242  7e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.46 
 
 
387 aa  241  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04655  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  36.36 
 
 
392 aa  241  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2231  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.66 
 
 
392 aa  242  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17470  acyl-CoA dehydrogenase  37.14 
 
 
396 aa  241  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.773993  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1290  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.36 
 
 
393 aa  239  5e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04805  acyl-CoA dehydrogenase 1  37.28 
 
 
391 aa  239  6.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4408  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.34 
 
 
394 aa  238  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0429  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.95 
 
 
386 aa  236  7e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0844  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.6 
 
 
396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.114761 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.13 
 
 
401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23170  acyl-CoA dehydrogenase  37.14 
 
 
408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10405  acyl-CoA dehydrogenase fadE7  36.34 
 
 
395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4513  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.85 
 
 
402 aa  233  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2632  hypothetical protein  36.41 
 
 
385 aa  233  5e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2502  hypothetical protein  36.41 
 
 
385 aa  233  5e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3419  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.98 
 
 
394 aa  231  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0350417  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4671  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.17 
 
 
396 aa  232  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1436  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.45 
 
 
415 aa  230  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.549354  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4222  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.88 
 
 
389 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4233  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.34 
 
 
394 aa  229  8e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0274104  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1120  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.03 
 
 
408 aa  228  9e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0419  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.31 
 
 
395 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2005  glutaryl-CoA dehydrogenase  36.53 
 
 
395 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518246  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4378  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35 
 
 
376 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00748225  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4147  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  35 
 
 
376 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0923518  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0711  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.19 
 
 
395 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245364  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0517  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.69 
 
 
386 aa  226  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.602895  decreased coverage  0.000687036 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24930  Glutaryl-CoA dehydrogenase  34.63 
 
 
395 aa  226  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440339  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3069  acyl-CoA dehydrogenase-like  35.54 
 
 
404 aa  226  7e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66075  normal  0.0926601 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4712  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.08 
 
 
397 aa  226  7e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.145534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4889  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.63 
 
 
392 aa  225  8e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378984  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1037  acyl-CoA dehydrogenase-like  39.31 
 
 
396 aa  225  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0117  Acyl-CoA dehydrogenase-like  34.84 
 
 
393 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0899419  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.98 
 
 
389 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  35.88 
 
 
379 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  35.88 
 
 
379 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2570  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.92 
 
 
395 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.216949  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4412  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.07 
 
 
403 aa  224  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.620152  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.07 
 
 
379 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.41 
 
 
379 aa  223  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9061  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.3 
 
 
385 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  36.15 
 
 
379 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2813  acyl-CoA dehydrogenase-like  34.28 
 
 
404 aa  223  6e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.207157  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>