More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2061 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2061  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  100 
 
 
404 aa  819    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0871  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  65.83 
 
 
409 aa  558  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2455  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  67.61 
 
 
398 aa  556  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.19606  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0375  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  67.01 
 
 
385 aa  497  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1809  Glutaryl-CoA dehydrogenase  61.89 
 
 
395 aa  477  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.141566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3470  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.55 
 
 
395 aa  474  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.131363  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0077  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.44 
 
 
394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3505  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  56.36 
 
 
393 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147907  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2382  Glutaryl-CoA dehydrogenase  57.11 
 
 
407 aa  444  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1209  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.89 
 
 
453 aa  425  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3043  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.3 
 
 
402 aa  421  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.942472  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01490  Acyl-CoA dehydrogenase  51.69 
 
 
453 aa  411  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5685  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.69 
 
 
452 aa  408  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1396  Acyl-CoA dehydrogenase  51.26 
 
 
400 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.012547  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3323  Glutaryl-CoA dehydrogenase  51.17 
 
 
454 aa  398  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000794594 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03070  acyl-CoA dehydrogenase  49.74 
 
 
404 aa  369  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30270  acyl-CoA dehydrogenase  50.26 
 
 
461 aa  367  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0031  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.93 
 
 
399 aa  364  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2387  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  48.98 
 
 
402 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.702715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6905  Glutaryl-CoA dehydrogenase  49.61 
 
 
382 aa  359  5e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0098  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.48 
 
 
442 aa  348  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0434945  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1221  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  45.22 
 
 
466 aa  344  2e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.395809  normal  0.664246 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19560  acyl-CoA dehydrogenase  48.14 
 
 
400 aa  336  2.9999999999999997e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1382  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.09 
 
 
396 aa  336  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000229631 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1365  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.53 
 
 
396 aa  330  3e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0100837  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0223  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.16 
 
 
414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1746  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  45.04 
 
 
401 aa  325  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1877  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  44.94 
 
 
386 aa  318  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0987  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.71 
 
 
395 aa  313  4.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2905  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.71 
 
 
387 aa  303  3.0000000000000004e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0502  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.45 
 
 
387 aa  303  5.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3206  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.19 
 
 
392 aa  302  7.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0674188  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.29 
 
 
408 aa  301  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.04 
 
 
396 aa  300  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0159  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.71 
 
 
397 aa  300  3e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0610  acyl-CoA dehydrogenase-like  40.46 
 
 
392 aa  298  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.777279  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3055  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43 
 
 
399 aa  296  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.712311  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0874  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.97 
 
 
419 aa  296  5e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17470  acyl-CoA dehydrogenase  41.79 
 
 
396 aa  295  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.773993  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2075  Acyl-CoA dehydrogenase-like  43.04 
 
 
392 aa  295  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000570553  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0541  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.34 
 
 
384 aa  294  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0610  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.76 
 
 
410 aa  293  4e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.326898  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1436  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.53 
 
 
415 aa  292  6e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.549354  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2757  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.61 
 
 
396 aa  292  6e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133725 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1408  acyl-CoA dehydrogenase  40.98 
 
 
392 aa  292  9e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.458942  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23170  acyl-CoA dehydrogenase  41.79 
 
 
408 aa  291  1e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1026  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.6 
 
 
402 aa  289  6e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2578  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.38 
 
 
386 aa  288  9e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1745  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.51 
 
 
393 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0523297  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0434  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.51 
 
 
404 aa  288  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2761  acyl-CoA dehydrogenase-like  40.75 
 
 
430 aa  286  5e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.192493  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04655  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  39.49 
 
 
392 aa  286  7e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1290  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.74 
 
 
393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.74 
 
 
396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.480554  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0739  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.05 
 
 
411 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2522  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.71 
 
 
386 aa  283  5.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2231  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40 
 
 
392 aa  281  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.1 
 
 
387 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10405  acyl-CoA dehydrogenase fadE7  38.86 
 
 
395 aa  281  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0830  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.87 
 
 
397 aa  279  5e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.897667  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0539  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  41.04 
 
 
391 aa  278  9e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04805  acyl-CoA dehydrogenase 1  41.56 
 
 
391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3367  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.64 
 
 
385 aa  273  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4222  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.44 
 
 
389 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02900  acyl-CoA dehydrogenase  40.78 
 
 
402 aa  273  4.0000000000000004e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2632  hypothetical protein  40.16 
 
 
385 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2502  hypothetical protein  40.16 
 
 
385 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.53 
 
 
389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4378  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.62 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00748225  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4147  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  38.62 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0923518  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0419  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.16 
 
 
395 aa  269  5e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3322  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.78 
 
 
393 aa  270  5e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03020  Glutaryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial precursor, putative  38.92 
 
 
426 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.388117  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0517  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.23 
 
 
386 aa  267  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.602895  decreased coverage  0.000687036 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1068  glutaryl-CoA dehydrogenase  40.41 
 
 
396 aa  267  2e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8460  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.85 
 
 
391 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5829  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.9 
 
 
395 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.628432  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0429  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.97 
 
 
386 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0844  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.64 
 
 
396 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.114761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9061  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.86 
 
 
385 aa  266  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3170  glutaryl-CoA dehydrogenase  39.12 
 
 
422 aa  266  4e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.129371 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0706  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.66 
 
 
397 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4292  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.63 
 
 
389 aa  266  5.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0821  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.78 
 
 
409 aa  265  8.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384147  normal  0.990129 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4408  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.6 
 
 
394 aa  265  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6742  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.64 
 
 
395 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224399  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4070  acyl-CoA dehydrogenase-like  38.72 
 
 
398 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0175  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.74 
 
 
393 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017739  normal  0.388373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4671  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.3 
 
 
396 aa  265  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0158  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.74 
 
 
393 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  hitchhiker  0.0000982042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1734  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.21 
 
 
398 aa  263  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.177428 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0177  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.74 
 
 
393 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00130576  normal  0.936713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5749  glutaryl-CoA dehydrogenase  38.21 
 
 
387 aa  263  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.312995 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0118  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.72 
 
 
399 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.360682  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24930  Glutaryl-CoA dehydrogenase  38.6 
 
 
395 aa  263  6e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440339  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5068  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.48 
 
 
393 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000324963  normal  0.0231586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2451  glutaryl-CoA dehydrogenase  38.34 
 
 
404 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0608  acyl-CoA dehydrogenase  38.76 
 
 
404 aa  262  1e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1536  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.96 
 
 
398 aa  261  1e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2653  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  38.4 
 
 
397 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>