More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2382 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2382  Glutaryl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
407 aa  827    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3505  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  62.14 
 
 
393 aa  482  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147907  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0871  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  58.04 
 
 
409 aa  478  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2455  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  59.59 
 
 
398 aa  463  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.19606  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0031  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  59.43 
 
 
399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1809  Glutaryl-CoA dehydrogenase  61.64 
 
 
395 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.141566  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3043  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.5 
 
 
402 aa  433  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.942472  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0375  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  58.55 
 
 
385 aa  420  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30270  acyl-CoA dehydrogenase  55.41 
 
 
461 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3470  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.83 
 
 
395 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.131363  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0077  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.12 
 
 
394 aa  410  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2061  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  57.11 
 
 
404 aa  409  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0223  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.77 
 
 
414 aa  398  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01490  Acyl-CoA dehydrogenase  49.87 
 
 
453 aa  392  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19560  acyl-CoA dehydrogenase  51.24 
 
 
400 aa  380  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03070  acyl-CoA dehydrogenase  51.66 
 
 
404 aa  375  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1209  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.96 
 
 
453 aa  372  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3323  Glutaryl-CoA dehydrogenase  48.7 
 
 
454 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000794594 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1396  Acyl-CoA dehydrogenase  49.35 
 
 
400 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.012547  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5685  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47 
 
 
452 aa  364  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0098  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.02 
 
 
442 aa  344  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0434945  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2387  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  50 
 
 
402 aa  341  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.702715  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1221  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  47.92 
 
 
466 aa  337  2.9999999999999997e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.395809  normal  0.664246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6905  Glutaryl-CoA dehydrogenase  47.81 
 
 
382 aa  337  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1746  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  45.69 
 
 
401 aa  331  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1877  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  45.43 
 
 
386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3206  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.34 
 
 
392 aa  325  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0674188  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0987  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.21 
 
 
395 aa  316  4e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1365  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.91 
 
 
396 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0100837  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2905  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.78 
 
 
387 aa  312  4.999999999999999e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0541  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.95 
 
 
384 aa  311  9e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2578  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.27 
 
 
386 aa  310  2e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0502  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.78 
 
 
387 aa  309  5.9999999999999995e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0830  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.31 
 
 
397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.897667  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3367  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.05 
 
 
385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0610  acyl-CoA dehydrogenase-like  41.65 
 
 
392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.777279  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.43 
 
 
396 aa  306  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1382  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.76 
 
 
396 aa  306  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000229631 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2522  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.75 
 
 
386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2757  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.36 
 
 
396 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133725 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0874  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.72 
 
 
419 aa  303  5.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3055  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.33 
 
 
399 aa  302  8.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.712311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9061  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.08 
 
 
385 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1745  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.75 
 
 
393 aa  298  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0523297  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0429  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.49 
 
 
386 aa  293  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2075  Acyl-CoA dehydrogenase-like  42.75 
 
 
392 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000570553  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0517  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.49 
 
 
386 aa  290  4e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.602895  decreased coverage  0.000687036 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17470  acyl-CoA dehydrogenase  43.75 
 
 
396 aa  289  6e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.773993  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1026  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.09 
 
 
402 aa  287  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1408  acyl-CoA dehydrogenase  40.47 
 
 
392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.458942  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4378  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.33 
 
 
376 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00748225  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0159  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.99 
 
 
397 aa  282  9e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4147  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  41.33 
 
 
376 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0923518  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.53 
 
 
396 aa  281  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.480554  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10405  acyl-CoA dehydrogenase fadE7  41.15 
 
 
395 aa  281  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4222  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.6 
 
 
389 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04655  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  39.79 
 
 
392 aa  281  2e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2761  acyl-CoA dehydrogenase-like  42.82 
 
 
430 aa  281  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.192493  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0434  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.44 
 
 
404 aa  281  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0610  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.6 
 
 
410 aa  281  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.326898  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.86 
 
 
408 aa  281  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4408  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.48 
 
 
394 aa  276  5e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1290  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.96 
 
 
393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.67 
 
 
387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02900  acyl-CoA dehydrogenase  42.64 
 
 
402 aa  272  7e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2231  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.44 
 
 
392 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1068  glutaryl-CoA dehydrogenase  43.49 
 
 
396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23170  acyl-CoA dehydrogenase  40.36 
 
 
408 aa  269  5.9999999999999995e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1120  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.77 
 
 
408 aa  269  7e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5749  glutaryl-CoA dehydrogenase  43.23 
 
 
387 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.312995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1436  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.23 
 
 
415 aa  268  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.549354  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1133  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.33 
 
 
398 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8460  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.04 
 
 
391 aa  266  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.98 
 
 
401 aa  266  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4712  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.53 
 
 
397 aa  266  7e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.145534 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1671  acyl-CoA dehydrogenase-like  39.59 
 
 
398 aa  265  8e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0739  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.75 
 
 
411 aa  265  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0815  glutaryl-CoA dehydrogenase  39.27 
 
 
394 aa  265  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2632  hypothetical protein  42.03 
 
 
385 aa  263  3e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2502  hypothetical protein  42.03 
 
 
385 aa  263  3e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0805  putative glutaryl-CoA dehydrogenase  39.01 
 
 
394 aa  263  3e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.75963  normal  0.310028 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4513  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.89 
 
 
402 aa  263  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0821  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.9 
 
 
409 aa  263  6e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384147  normal  0.990129 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25572  predicted protein  40.16 
 
 
470 aa  262  6.999999999999999e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1536  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.38 
 
 
398 aa  262  8e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4671  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.7 
 
 
396 aa  262  8.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.96 
 
 
389 aa  262  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.61 
 
 
408 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00258655  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2005  glutaryl-CoA dehydrogenase  40.11 
 
 
395 aa  260  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518246  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0844  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.71 
 
 
396 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.114761 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4292  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.21 
 
 
389 aa  260  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2728  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.35 
 
 
403 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.335629  normal  0.940576 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4233  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.16 
 
 
394 aa  258  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0274104  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2955  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.85 
 
 
403 aa  257  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0522083  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1295  putative acyl-CoA dehydrogenase  38.6 
 
 
403 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04805  acyl-CoA dehydrogenase 1  40.98 
 
 
391 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2879  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  39.22 
 
 
400 aa  254  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1162  Acyl-CoA dehydrogenase-like  37.81 
 
 
404 aa  253  6e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0873897  normal  0.0990997 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0419  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.52 
 
 
395 aa  252  7e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1284  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.81 
 
 
404 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>