More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17470 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_17470  acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
396 aa  810    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.773993  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1745  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  75.51 
 
 
393 aa  625  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0523297  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  75.06 
 
 
389 aa  615  1e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0987  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  70.38 
 
 
395 aa  584  1.0000000000000001e-165  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3206  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.44 
 
 
392 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0674188  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10405  acyl-CoA dehydrogenase fadE7  70.2 
 
 
395 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4292  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  72.8 
 
 
389 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4408  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  69.62 
 
 
394 aa  565  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0541  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  70.5 
 
 
384 aa  557  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3367  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.87 
 
 
385 aa  552  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8460  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  69.23 
 
 
391 aa  546  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9061  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  68.75 
 
 
385 aa  542  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0517  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  67.1 
 
 
386 aa  535  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.602895  decreased coverage  0.000687036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4378  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  67.02 
 
 
376 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00748225  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4222  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  66.06 
 
 
389 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4147  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  67.02 
 
 
376 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0923518  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0429  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  64.77 
 
 
386 aa  524  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  62.96 
 
 
401 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4671  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  66.13 
 
 
396 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4513  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  62.16 
 
 
402 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5749  glutaryl-CoA dehydrogenase  65.12 
 
 
387 aa  508  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.312995 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0844  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  66.75 
 
 
396 aa  504  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.114761 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1746  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  61.79 
 
 
401 aa  501  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1068  glutaryl-CoA dehydrogenase  63.48 
 
 
396 aa  499  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1877  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  62.3 
 
 
386 aa  493  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3055  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  62.59 
 
 
399 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.712311  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0874  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  59.95 
 
 
419 aa  483  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2757  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  62.79 
 
 
396 aa  483  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133725 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23170  acyl-CoA dehydrogenase  59.23 
 
 
408 aa  442  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2075  Acyl-CoA dehydrogenase-like  56.39 
 
 
392 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000570553  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0830  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.62 
 
 
397 aa  432  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.897667  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2761  acyl-CoA dehydrogenase-like  57.29 
 
 
430 aa  429  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.192493  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2522  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  56.36 
 
 
386 aa  427  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04805  acyl-CoA dehydrogenase 1  55.93 
 
 
391 aa  421  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0159  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  54.01 
 
 
397 aa  418  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0610  acyl-CoA dehydrogenase-like  54.4 
 
 
392 aa  411  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.777279  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0502  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.78 
 
 
387 aa  404  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2578  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.94 
 
 
386 aa  404  1e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2905  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.39 
 
 
387 aa  400  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3419  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.54 
 
 
394 aa  395  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0350417  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2632  hypothetical protein  53.39 
 
 
385 aa  395  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2502  hypothetical protein  53.39 
 
 
385 aa  395  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1408  acyl-CoA dehydrogenase  51.04 
 
 
392 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.458942  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1536  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.92 
 
 
398 aa  385  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0805  putative glutaryl-CoA dehydrogenase  49.62 
 
 
394 aa  383  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.75963  normal  0.310028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2451  glutaryl-CoA dehydrogenase  49.48 
 
 
404 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3993  glutaryl-CoA dehydrogenase  50.39 
 
 
394 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1436  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.5 
 
 
415 aa  383  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.549354  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.51 
 
 
408 aa  383  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00258655  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3069  acyl-CoA dehydrogenase-like  49.49 
 
 
404 aa  380  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66075  normal  0.0926601 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0815  glutaryl-CoA dehydrogenase  49.62 
 
 
394 aa  380  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.49 
 
 
396 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.480554  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0821  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.28 
 
 
409 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384147  normal  0.990129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1649  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.79 
 
 
415 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.246483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1162  Acyl-CoA dehydrogenase-like  48.43 
 
 
404 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0873897  normal  0.0990997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1284  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.69 
 
 
404 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5095  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.57 
 
 
409 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.0779135 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1661  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50 
 
 
406 aa  376  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0842003  normal  0.909495 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.61 
 
 
387 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2231  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.65 
 
 
392 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4712  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.5 
 
 
397 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.145534 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1268  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.74 
 
 
413 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.831834  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1264  acyl-CoA dehydrogenase-like  47.91 
 
 
404 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.51833  normal  0.675418 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1120  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.89 
 
 
408 aa  372  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1290  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.57 
 
 
393 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0900  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.61 
 
 
391 aa  371  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.461251 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0608  acyl-CoA dehydrogenase  48.43 
 
 
404 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0753  acyl-CoA dehydrogenase-like  47.62 
 
 
404 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.202646  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2481  acyl-CoA dehydrogenase-like  49.21 
 
 
406 aa  368  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4412  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.49 
 
 
403 aa  368  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.620152  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2796  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  50.13 
 
 
391 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1085  glutaryl-CoA dehydrogenase  48.56 
 
 
394 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1133  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.72 
 
 
398 aa  368  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3170  glutaryl-CoA dehydrogenase  50.53 
 
 
422 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.129371 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2005  glutaryl-CoA dehydrogenase  51.33 
 
 
395 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518246  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2407  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.65 
 
 
398 aa  368  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4297  acyl-CoA dehydrogenase-like  48.18 
 
 
404 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296437  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2979  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.39 
 
 
398 aa  366  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2130  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.6 
 
 
394 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0270955 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4671  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.74 
 
 
395 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0018836  normal  0.0173504 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2879  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  49.49 
 
 
400 aa  365  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0175  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.79 
 
 
393 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017739  normal  0.388373 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0419  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.79 
 
 
395 aa  365  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0776  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.13 
 
 
396 aa  365  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.567358 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04655  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  47.83 
 
 
392 aa  364  2e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2357  acyl-CoA dehydrogenase  47.55 
 
 
406 aa  363  2e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1671  acyl-CoA dehydrogenase-like  47.96 
 
 
398 aa  363  3e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1033  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.06 
 
 
391 aa  363  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355643  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0822  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.34 
 
 
394 aa  363  4e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0158  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.53 
 
 
393 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  hitchhiker  0.0000982042 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0177  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.53 
 
 
393 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00130576  normal  0.936713 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2813  acyl-CoA dehydrogenase-like  47.99 
 
 
404 aa  362  7.0000000000000005e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.207157  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05840  glutaryl-CoA dehydrogenase  48.87 
 
 
393 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5068  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.26 
 
 
393 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000324963  normal  0.0231586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1026  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.75 
 
 
402 aa  361  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3904  putative glutaryl-CoA dehydrogenase  50.13 
 
 
396 aa  361  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0984  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.8 
 
 
391 aa  361  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.374892  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0706  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50 
 
 
397 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0118  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.09 
 
 
399 aa  360  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.360682  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4233  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.85 
 
 
394 aa  360  2e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0274104  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>