More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1329 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 
389 aa  795    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17470  acyl-CoA dehydrogenase  75.06 
 
 
396 aa  615  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.773993  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1745  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.59 
 
 
393 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0523297  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10405  acyl-CoA dehydrogenase fadE7  68.75 
 
 
395 aa  542  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0987  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  65.71 
 
 
395 aa  528  1e-149  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4408  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  65.98 
 
 
394 aa  515  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3206  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.64 
 
 
392 aa  513  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0674188  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0429  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  64.06 
 
 
386 aa  509  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0517  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.19 
 
 
386 aa  510  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.602895  decreased coverage  0.000687036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0541  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  67.28 
 
 
384 aa  509  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4292  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.9 
 
 
389 aa  509  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  62.98 
 
 
401 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4513  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.95 
 
 
402 aa  502  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8460  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  66.41 
 
 
391 aa  504  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9061  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  64.16 
 
 
385 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4671  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.98 
 
 
396 aa  490  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4222  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.03 
 
 
389 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3367  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.38 
 
 
385 aa  488  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4378  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  62.07 
 
 
376 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00748225  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4147  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  62.07 
 
 
376 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0923518  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1746  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  60.31 
 
 
401 aa  475  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1877  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  60.99 
 
 
386 aa  472  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0874  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  58.61 
 
 
419 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0844  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  62.08 
 
 
396 aa  464  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.114761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3055  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  60.21 
 
 
399 aa  462  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.712311  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1068  glutaryl-CoA dehydrogenase  61.3 
 
 
396 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5749  glutaryl-CoA dehydrogenase  62.73 
 
 
387 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.312995 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2757  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  59.29 
 
 
396 aa  457  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133725 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2075  Acyl-CoA dehydrogenase-like  55.33 
 
 
392 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000570553  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23170  acyl-CoA dehydrogenase  56.15 
 
 
408 aa  418  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0830  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.03 
 
 
397 aa  403  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.897667  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2761  acyl-CoA dehydrogenase-like  54.66 
 
 
430 aa  396  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.192493  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2578  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.45 
 
 
386 aa  390  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2522  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.17 
 
 
386 aa  390  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0159  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.44 
 
 
397 aa  390  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04805  acyl-CoA dehydrogenase 1  53.47 
 
 
391 aa  385  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0610  acyl-CoA dehydrogenase-like  52.09 
 
 
392 aa  382  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.777279  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0502  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.45 
 
 
387 aa  379  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2905  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.73 
 
 
387 aa  376  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1536  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.33 
 
 
398 aa  372  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1408  acyl-CoA dehydrogenase  48.33 
 
 
392 aa  366  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.458942  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0805  putative glutaryl-CoA dehydrogenase  49.07 
 
 
394 aa  364  1e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.75963  normal  0.310028 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2632  hypothetical protein  50.13 
 
 
385 aa  363  2e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2502  hypothetical protein  50.13 
 
 
385 aa  363  2e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0815  glutaryl-CoA dehydrogenase  49.07 
 
 
394 aa  362  8e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1120  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.74 
 
 
408 aa  358  6e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3419  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.78 
 
 
394 aa  355  5.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0350417  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1649  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.21 
 
 
415 aa  354  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.246483 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1268  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.41 
 
 
413 aa  353  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.831834  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.46 
 
 
396 aa  352  7e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.480554  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1264  acyl-CoA dehydrogenase-like  45.81 
 
 
404 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.51833  normal  0.675418 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1284  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.07 
 
 
404 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2451  glutaryl-CoA dehydrogenase  45.55 
 
 
404 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0821  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.4 
 
 
409 aa  347  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384147  normal  0.990129 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1162  Acyl-CoA dehydrogenase-like  45.55 
 
 
404 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0873897  normal  0.0990997 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2130  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.89 
 
 
394 aa  345  6e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0270955 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5095  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.41 
 
 
409 aa  345  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.0779135 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3993  glutaryl-CoA dehydrogenase  47.3 
 
 
394 aa  344  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1436  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.17 
 
 
415 aa  344  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.549354  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2005  glutaryl-CoA dehydrogenase  48.67 
 
 
395 aa  344  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518246  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1037  acyl-CoA dehydrogenase-like  48.05 
 
 
396 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1671  acyl-CoA dehydrogenase-like  46.48 
 
 
398 aa  343  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2879  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  48.32 
 
 
400 aa  342  8e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1133  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.25 
 
 
398 aa  342  9e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0419  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.01 
 
 
395 aa  341  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0118  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.94 
 
 
399 aa  341  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.360682  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4712  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.6 
 
 
397 aa  341  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.145534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2231  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.56 
 
 
392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.35 
 
 
408 aa  339  4e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00258655  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0753  acyl-CoA dehydrogenase-like  45.22 
 
 
404 aa  339  4e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.202646  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4412  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.62 
 
 
403 aa  340  4e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.620152  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2407  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.18 
 
 
398 aa  339  5e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2481  acyl-CoA dehydrogenase-like  49.13 
 
 
406 aa  338  7e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0608  acyl-CoA dehydrogenase  44.96 
 
 
404 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24930  Glutaryl-CoA dehydrogenase  47.87 
 
 
395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440339  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1085  glutaryl-CoA dehydrogenase  45.24 
 
 
394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2979  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.92 
 
 
398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2170  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.55 
 
 
394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0549  glutaryl-CoA dehydrogenase  47.07 
 
 
393 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4297  acyl-CoA dehydrogenase-like  45.29 
 
 
404 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296437  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0776  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.97 
 
 
396 aa  335  9e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.567358 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3170  glutaryl-CoA dehydrogenase  46.27 
 
 
422 aa  335  9e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.129371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3322  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.07 
 
 
393 aa  334  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0706  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.11 
 
 
397 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1290  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.48 
 
 
393 aa  335  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3069  acyl-CoA dehydrogenase-like  45.29 
 
 
404 aa  334  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66075  normal  0.0926601 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4671  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.03 
 
 
395 aa  333  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0018836  normal  0.0173504 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05840  glutaryl-CoA dehydrogenase  46.81 
 
 
393 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2207  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.9 
 
 
398 aa  333  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.312955  normal  0.110735 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1255  acyl-CoA dehydrogenase-like  47.03 
 
 
407 aa  333  3e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229688  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.22 
 
 
387 aa  333  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4070  acyl-CoA dehydrogenase-like  46.23 
 
 
398 aa  333  4e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1033  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.17 
 
 
391 aa  333  4e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355643  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0900  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.15 
 
 
391 aa  333  4e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.461251 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3185  putative glutaryl-CoA dehydrogenase  45.66 
 
 
395 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2678  glutaryl-CoA dehydrogenase  45.66 
 
 
395 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1931  putative glutaryl-CoA dehydrogenase  45.66 
 
 
395 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2064  glutaryl-CoA dehydrogenase  45.66 
 
 
395 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2796  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  46.84 
 
 
391 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0845  glutaryl-CoA dehydrogenase  45.66 
 
 
395 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>