More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1209 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_01490  Acyl-CoA dehydrogenase  69.09 
 
 
453 aa  675    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3323  Glutaryl-CoA dehydrogenase  71.87 
 
 
454 aa  695    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000794594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5685  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  67.7 
 
 
452 aa  645    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1209  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 
453 aa  937    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1396  Acyl-CoA dehydrogenase  63.71 
 
 
400 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.012547  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1221  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  51.88 
 
 
466 aa  487  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.395809  normal  0.664246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6905  Glutaryl-CoA dehydrogenase  57.25 
 
 
382 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3470  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.36 
 
 
395 aa  452  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.131363  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0098  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.3 
 
 
442 aa  449  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0434945  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0077  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.64 
 
 
394 aa  425  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2455  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  53.25 
 
 
398 aa  417  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.19606  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0871  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.86 
 
 
409 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1382  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.65 
 
 
396 aa  408  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000229631 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1365  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.04 
 
 
396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0100837  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3505  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.97 
 
 
393 aa  395  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147907  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3043  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50 
 
 
402 aa  392  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.942472  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2061  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  54.67 
 
 
404 aa  392  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1809  Glutaryl-CoA dehydrogenase  52.05 
 
 
395 aa  390  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.141566  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2382  Glutaryl-CoA dehydrogenase  48.96 
 
 
407 aa  372  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0375  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  48.96 
 
 
385 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.47 
 
 
408 aa  345  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0610  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43 
 
 
410 aa  329  6e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.326898  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03070  acyl-CoA dehydrogenase  43.59 
 
 
404 aa  329  8e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0739  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.11 
 
 
411 aa  327  3e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0987  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.28 
 
 
395 aa  316  4e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0217  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.72 
 
 
403 aa  316  6e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0223  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.72 
 
 
403 aa  316  6e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2387  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  43.73 
 
 
402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.702715  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0031  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.2 
 
 
399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30270  acyl-CoA dehydrogenase  44.99 
 
 
461 aa  312  9e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19560  acyl-CoA dehydrogenase  42.2 
 
 
400 aa  310  2e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0434  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.46 
 
 
404 aa  305  8.000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.89 
 
 
396 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0223  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.21 
 
 
414 aa  302  9e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2905  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.9 
 
 
387 aa  301  1e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1746  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  38.35 
 
 
401 aa  300  4e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02900  acyl-CoA dehydrogenase  40.16 
 
 
402 aa  299  6e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2075  Acyl-CoA dehydrogenase-like  41.11 
 
 
392 aa  297  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000570553  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1877  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  38.83 
 
 
386 aa  296  4e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3206  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.69 
 
 
392 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0674188  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0502  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.6 
 
 
387 aa  289  6e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3055  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.64 
 
 
399 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.712311  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2757  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.84 
 
 
396 aa  286  5.999999999999999e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0541  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.1 
 
 
384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2578  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.31 
 
 
386 aa  283  5.000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0874  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.44 
 
 
419 aa  281  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0830  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.96 
 
 
397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.897667  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2522  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.7 
 
 
386 aa  272  7e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0610  acyl-CoA dehydrogenase-like  36.27 
 
 
392 aa  272  8.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.777279  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4671  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.07 
 
 
396 aa  272  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1745  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.6 
 
 
393 aa  269  8e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0523297  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17470  acyl-CoA dehydrogenase  36.73 
 
 
396 aa  268  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.773993  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2761  acyl-CoA dehydrogenase-like  38.73 
 
 
430 aa  267  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.192493  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4147  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  36.44 
 
 
376 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0923518  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1408  acyl-CoA dehydrogenase  37.4 
 
 
392 aa  268  2e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.458942  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4378  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.44 
 
 
376 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00748225  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23170  acyl-CoA dehydrogenase  36.51 
 
 
408 aa  268  2e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4222  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.44 
 
 
389 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1068  glutaryl-CoA dehydrogenase  37.56 
 
 
396 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1026  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.88 
 
 
402 aa  265  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.18 
 
 
387 aa  264  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.36 
 
 
396 aa  263  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.480554  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04655  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  35.84 
 
 
392 aa  260  4e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1436  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.06 
 
 
415 aa  259  7e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.549354  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10405  acyl-CoA dehydrogenase fadE7  35.46 
 
 
395 aa  259  9e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4712  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.87 
 
 
397 aa  259  9e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.145534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4233  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.48 
 
 
394 aa  258  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0274104  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1290  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.1 
 
 
393 aa  258  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9061  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.88 
 
 
385 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0429  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.41 
 
 
386 aa  257  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.62 
 
 
408 aa  256  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00258655  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0608  acyl-CoA dehydrogenase  35.75 
 
 
404 aa  256  7e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1162  Acyl-CoA dehydrogenase-like  35.26 
 
 
404 aa  256  8e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0873897  normal  0.0990997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1284  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.26 
 
 
404 aa  255  9e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8460  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.6 
 
 
391 aa  255  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3367  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.23 
 
 
385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2451  glutaryl-CoA dehydrogenase  35.79 
 
 
404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2231  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.27 
 
 
392 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0159  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.64 
 
 
397 aa  253  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0753  acyl-CoA dehydrogenase-like  35.26 
 
 
404 aa  254  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.202646  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1268  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.79 
 
 
413 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.831834  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1264  acyl-CoA dehydrogenase-like  35 
 
 
404 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.51833  normal  0.675418 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3419  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35 
 
 
394 aa  250  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0350417  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0844  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.1 
 
 
396 aa  250  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.114761 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0822  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.23 
 
 
394 aa  250  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5749  glutaryl-CoA dehydrogenase  36.43 
 
 
387 aa  249  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.312995 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2632  hypothetical protein  38.16 
 
 
385 aa  249  7e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2502  hypothetical protein  38.16 
 
 
385 aa  249  7e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1649  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.89 
 
 
415 aa  249  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.246483 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0517  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.88 
 
 
386 aa  249  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.602895  decreased coverage  0.000687036 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4408  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.86 
 
 
394 aa  248  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2879  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  36.07 
 
 
400 aa  247  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4297  acyl-CoA dehydrogenase-like  35 
 
 
404 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296437  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4292  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.66 
 
 
389 aa  247  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04805  acyl-CoA dehydrogenase 1  35.79 
 
 
391 aa  247  4e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0821  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.39 
 
 
409 aa  247  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384147  normal  0.990129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1671  acyl-CoA dehydrogenase-like  35.94 
 
 
398 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5095  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.7 
 
 
409 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.0779135 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2005  glutaryl-CoA dehydrogenase  36.27 
 
 
395 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518246  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24930  Glutaryl-CoA dehydrogenase  34.3 
 
 
395 aa  245  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>