More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1248 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1248  phosphoesterase, RecJ-like  100 
 
 		 597 aa  1237    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_3008  exonuclease RecJ  42.07 
 
 		 599 aa  403  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.859274  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0476  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.63 
 
 		 605 aa  292  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_0636  phosphoesterase RecJ domain protein  34.63 
 
 		 605 aa  292  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2811  phosphoesterase RecJ domain protein  33.62 
 
 		 601 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.0042307  normal  0.888498 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1038  exonuclease RecJ  33.78 
 
 		 566 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.329478 
 
 
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NC_008463  PA14_16220  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.88 
 
 		 571 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1395  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.22 
 
 		 571 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007404  Tbd_1771  exonuclease RecJ  33.16 
 
 		 565 aa  249  7e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.495895  normal  0.722264 
 
 
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NC_008740  Maqu_2272  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.39 
 
 		 577 aa  247  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_2838  RecJ exonuclease  33.17 
 
 		 566 aa  244  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.934115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2758  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.89 
 
 		 574 aa  243  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1448  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.55 
 
 		 577 aa  238  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007947  Mfla_2065  exonuclease RecJ  32.71 
 
 		 564 aa  238  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1477  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.63 
 
 		 569 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221142  normal  0.152861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4244  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.63 
 
 		 569 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3302  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.46 
 
 		 572 aa  236  7e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0912686  normal  0.117483 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1035  exonuclease RecJ  32.97 
 
 		 569 aa  236  8e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.2 
 
 		 569 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.810057 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1074  exonuclease RecJ  33.15 
 
 		 565 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0444947  n/a   
 
 
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NC_009727  CBUD_1569  single-stranded-DNA-specific exonuclease  32.07 
 
 		 574 aa  235  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160712  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_0897  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.35 
 
 		 574 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_3376  exonuclease RecJ  33.33 
 
 		 569 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.593595 
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A0618  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.89 
 
 		 574 aa  234  4.0000000000000004e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.73 
 
 		 574 aa  233  5e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_3760  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.72 
 
 		 610 aa  232  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.671236 
 
 
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NC_010322  PputGB1_1082  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.69 
 
 		 569 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3226  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.55 
 
 		 574 aa  232  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008577  Shewana3_3329  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.55 
 
 		 574 aa  232  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_2569  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.43 
 
 		 568 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217652  normal  0.0265746 
 
 
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NC_007005  Psyr_1298  RecJ exonuclease  31.91 
 
 		 571 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882929  normal  0.617769 
 
 
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NC_008228  Patl_3712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.42 
 
 		 572 aa  231  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_0772  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.7 
 
 		 574 aa  231  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167693  hitchhiker  0.00446395 
 
 
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NC_004347  SO_0952  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.55 
 
 		 574 aa  230  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_0892  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.45 
 
 		 584 aa  230  5e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.488933  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_1213  exonuclease RecJ  31.86 
 
 		 581 aa  230  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008752  Aave_3702  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.31 
 
 		 571 aa  229  7e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713364 
 
 
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NC_004578  PSPTO_1488  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.53 
 
 		 569 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A1564  RecJ exonuclease  34.03 
 
 		 568 aa  229  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373395  normal  0.277595 
 
 
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NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.49 
 
 		 576 aa  229  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
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NC_007484  Noc_1189  RecJ exonuclease  33.81 
 
 		 574 aa  228  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009379  Pnuc_1470  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.92 
 
 		 586 aa  227  5.0000000000000005e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_0807  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.42 
 
 		 574 aa  226  7e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.89 
 
 		 574 aa  225  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_0922  ssDNA exonuclease RecJ  31.94 
 
 		 577 aa  225  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3849  ssDNA exonuclease RecJ  31.94 
 
 		 577 aa  224  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.333614 
 
 
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NC_009997  Sbal195_3641  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.16 
 
 		 577 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_0881  ssDNA exonuclease RecJ  31.94 
 
 		 577 aa  224  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.796775  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_3522  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.16 
 
 		 577 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_3447  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.16 
 
 		 574 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008700  Sama_2737  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.99 
 
 		 574 aa  224  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011138  MADE_03407  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.77 
 
 		 573 aa  224  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  30.92 
 
 		 577 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease protein  31.21 
 
 		 565 aa  223  6e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00151931  normal  0.274168 
 
 
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NC_009052  Sbal_0845  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.98 
 
 		 577 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  31.1 
 
 		 577 aa  223  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E3312  ssDNA exonuclease RecJ  31.1 
 
 		 577 aa  223  7e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  31.1 
 
 		 577 aa  223  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_3025  ssDNA exonuclease RecJ  31.15 
 
 		 577 aa  223  8e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_0749  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.78 
 
 		 574 aa  223  8e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0015193  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_0800  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.92 
 
 		 577 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133644  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0817  ssDNA exonuclease RecJ  30.92 
 
 		 577 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_3218  ssDNA exonuclease RecJ  31.1 
 
 		 577 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A3051  ssDNA exonuclease RecJ  31.1 
 
 		 577 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_39440  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.02 
 
 		 569 aa  222  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.31407  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_3298  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.61 
 
 		 580 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.746333  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.42 
 
 		 573 aa  222  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_004439  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.73 
 
 		 579 aa  221  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_0958  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.09 
 
 		 564 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.388256  normal  0.0147257 
 
 
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NC_009783  VIBHAR_00958  ssDNA exonuclease RecJ  29.91 
 
 		 579 aa  221  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.92 
 
 		 564 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497812  normal  0.288787 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1567  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.71 
 
 		 579 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_0895  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.16 
 
 		 574 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647081 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3310  ssDNA exonuclease RecJ  31.03 
 
 		 577 aa  218  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.24828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3890  ssDNA exonuclease RecJ  30.7 
 
 		 577 aa  218  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1969  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.69 
 
 		 563 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00305659  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1417  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.64 
 
 		 579 aa  217  4e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3210  ssDNA exonuclease RecJ  30.41 
 
 		 577 aa  216  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.398907 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3276  ssDNA exonuclease RecJ  30.41 
 
 		 577 aa  216  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1474  single-strand DNA-specific exonuclease  32.08 
 
 		 573 aa  216  9e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0487  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.09 
 
 		 601 aa  216  9e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.624528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3198  ssDNA exonuclease RecJ  30.67 
 
 		 577 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5422  RecJ exonuclease  34.03 
 
 		 565 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2026  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.68 
 
 		 565 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.698536 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3273  ssDNA exonuclease RecJ  30.41 
 
 		 577 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3378  ssDNA exonuclease RecJ  30.41 
 
 		 577 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2153  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.68 
 
 		 565 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000147893  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4094  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.67 
 
 		 584 aa  215  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3258  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.62 
 
 		 580 aa  215  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008062  Bcen_5961  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.68 
 
 		 565 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.987838  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A1993  ssDNA exonuclease RecJ  30.64 
 
 		 584 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.89 
 
 		 574 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_1154  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.98 
 
 		 565 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0447096 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_2116  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.51 
 
 		 565 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.457344  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.33 
 
 		 831 aa  213  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007614  Nmul_A0640  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.49 
 
 		 613 aa  212  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_2134  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.51 
 
 		 565 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
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NC_008340  Mlg_1819  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.72 
 
 		 577 aa  212  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  1 
 
 
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NC_007908  Rfer_3234  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.96 
 
 		 576 aa  211  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.224513  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I0564  ssDNA exonuclease RecJ  30.85 
 
 		 579 aa  211  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.755584  n/a   
 
 
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