More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3258 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3702  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  76.74 
 
 		 571 aa  876    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  78.76 
 
 		 573 aa  912    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3258  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 580 aa  1161    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2751  exonuclease RecJ  66.32 
 
 		 581 aa  689    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2758  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  77.39 
 
 		 574 aa  902    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5406  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  72.85 
 
 		 572 aa  834    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3234  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  78.75 
 
 		 576 aa  922    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.224513  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1012  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  83.36 
 
 		 600 aa  990    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0694189 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3183  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  75.22 
 
 		 576 aa  841    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2400  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  66.49 
 
 		 579 aa  709    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.927411 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  77.22 
 
 		 574 aa  885    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1448  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.51 
 
 		 577 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1038  exonuclease RecJ  56.87 
 
 		 566 aa  615  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.329478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1074  exonuclease RecJ  56.45 
 
 		 565 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0444947  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2838  RecJ exonuclease  55.81 
 
 		 566 aa  601  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.934115  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease protein  57.32 
 
 		 565 aa  598  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00151931  normal  0.274168 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2026  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.24 
 
 		 565 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.698536 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1969  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.02 
 
 		 563 aa  598  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00305659  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1154  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.84 
 
 		 565 aa  597  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0447096 
 
 
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NC_008390  Bamb_2153  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.24 
 
 		 565 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000147893  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.24 
 
 		 564 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497812  normal  0.288787 
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_2642  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.46 
 
 		 564 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_1478  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.46 
 
 		 564 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2205  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.46 
 
 		 564 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2588  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.46 
 
 		 564 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1698  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.46 
 
 		 564 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.46 
 
 		 564 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3113  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.46 
 
 		 564 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I1885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.46 
 
 		 564 aa  589  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214774  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A1564  RecJ exonuclease  57.64 
 
 		 568 aa  588  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373395  normal  0.277595 
 
 
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NC_010682  Rpic_0958  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.89 
 
 		 564 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.388256  normal  0.0147257 
 
 
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NC_010681  Bphyt_2569  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.29 
 
 		 568 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217652  normal  0.0265746 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A5422  RecJ exonuclease  57.42 
 
 		 565 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008062  Bcen_5961  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.89 
 
 		 565 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.987838  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_2116  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.89 
 
 		 565 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.457344  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_2134  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.54 
 
 		 565 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
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NC_007404  Tbd_1771  exonuclease RecJ  54.1 
 
 		 565 aa  554  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.495895  normal  0.722264 
 
 
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NC_010531  Pnec_0487  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.11 
 
 		 601 aa  553  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.624528  normal  1 
 
 
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NC_009379  Pnuc_1470  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.41 
 
 		 586 aa  550  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007614  Nmul_A0640  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.73 
 
 		 613 aa  538  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_2065  exonuclease RecJ  50.7 
 
 		 564 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_1477  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.34 
 
 		 569 aa  505  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221142  normal  0.152861 
 
 
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NC_004578  PSPTO_1488  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.69 
 
 		 569 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_4244  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.34 
 
 		 569 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.51 
 
 		 569 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.810057 
 
 
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NC_010322  PputGB1_1082  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50 
 
 		 569 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_1298  RecJ exonuclease  52.5 
 
 		 571 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882929  normal  0.617769 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_3760  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.32 
 
 		 610 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.671236 
 
 
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NC_007492  Pfl01_1035  exonuclease RecJ  50.53 
 
 		 569 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626016 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1395  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.09 
 
 		 571 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16220  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.09 
 
 		 571 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2737  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.77 
 
 		 574 aa  484  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3302  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.94 
 
 		 572 aa  482  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0912686  normal  0.117483 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3376  exonuclease RecJ  50.17 
 
 		 569 aa  479  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.593595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39440  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.43 
 
 		 569 aa  477  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.31407  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3447  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.53 
 
 		 574 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4094  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.65 
 
 		 584 aa  473  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0892  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.69 
 
 		 584 aa  473  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.488933  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0845  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.35 
 
 		 577 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0772  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.01 
 
 		 574 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167693  hitchhiker  0.00446395 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3641  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.17 
 
 		 577 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0807  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.44 
 
 		 574 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3522  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.35 
 
 		 577 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0952  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.15 
 
 		 574 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3849  ssDNA exonuclease RecJ  47.96 
 
 		 577 aa  467  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.333614 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0881  ssDNA exonuclease RecJ  47.96 
 
 		 577 aa  467  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.796775  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0922  ssDNA exonuclease RecJ  47.96 
 
 		 577 aa  467  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3890  ssDNA exonuclease RecJ  48.13 
 
 		 577 aa  468  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.17 
 
 		 574 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3226  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.17 
 
 		 574 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0897  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.1 
 
 		 574 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3329  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.35 
 
 		 574 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1817  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.85 
 
 		 585 aa  463  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0771206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1213  exonuclease RecJ  44.77 
 
 		 581 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1993  ssDNA exonuclease RecJ  45.69 
 
 		 584 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03407  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.65 
 
 		 573 aa  461  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3198  ssDNA exonuclease RecJ  46.18 
 
 		 577 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3210  ssDNA exonuclease RecJ  46 
 
 		 577 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.398907 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3276  ssDNA exonuclease RecJ  46 
 
 		 577 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  45.47 
 
 		 577 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0800  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.29 
 
 		 577 aa  457  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133644  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00958  ssDNA exonuclease RecJ  44.16 
 
 		 579 aa  456  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1417  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.37 
 
 		 579 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3378  ssDNA exonuclease RecJ  46 
 
 		 577 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  45.47 
 
 		 577 aa  457  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3273  ssDNA exonuclease RecJ  46 
 
 		 577 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3218  ssDNA exonuclease RecJ  45.47 
 
 		 577 aa  458  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3051  ssDNA exonuclease RecJ  45.47 
 
 		 577 aa  457  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  45.47 
 
 		 577 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_3025  ssDNA exonuclease RecJ  45.47 
 
 		 577 aa  456  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0895  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.81 
 
 		 574 aa  458  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647081 
 
 
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NC_010468  EcolC_0817  ssDNA exonuclease RecJ  45.21 
 
 		 577 aa  457  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3312  ssDNA exonuclease RecJ  45.47 
 
 		 577 aa  456  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I0564  ssDNA exonuclease RecJ  45.01 
 
 		 579 aa  453  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.755584  n/a   
 
 
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NC_006369  lpl1567  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.02 
 
 		 579 aa  452  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_3712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.81 
 
 		 572 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_004439  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.33 
 
 		 579 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_0665  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.91 
 
 		 574 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0729862  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_2272  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.89 
 
 		 577 aa  450  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_1819  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.87 
 
 		 577 aa  451  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  1 
 
 
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