More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2811 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2811  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 		 601 aa  1225    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.0042307  normal  0.888498 
 
 
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NC_007963  Csal_3008  exonuclease RecJ  40.48 
 
 		 599 aa  394  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.859274  n/a   
 
 
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NC_011761  AFE_0476  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.86 
 
 		 605 aa  352  1e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_0636  phosphoesterase RecJ domain protein  38.86 
 
 		 605 aa  352  1e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007520  Tcr_1248  phosphoesterase, RecJ-like  33.62 
 
 		 597 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.3 
 
 		 599 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
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NC_008789  Hhal_0122  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.71 
 
 		 578 aa  244  3e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.82 
 
 		 811 aa  240  5.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_008599  CFF8240_1755  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.31 
 
 		 530 aa  239  1e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.65 
 
 		 732 aa  233  6e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.43 
 
 		 573 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.38 
 
 		 564 aa  231  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.1 
 
 		 801 aa  230  6e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.38 
 
 		 907 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_009487  SaurJH9_1693  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.83 
 
 		 757 aa  229  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_1726  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.83 
 
 		 757 aa  229  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
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NC_008309  HS_1474  single-strand DNA-specific exonuclease  31.13 
 
 		 573 aa  228  3e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_0772  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.93 
 
 		 574 aa  227  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167693  hitchhiker  0.00446395 
 
 
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NC_009727  CBUD_1569  single-stranded-DNA-specific exonuclease  32.62 
 
 		 574 aa  226  7e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160712  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_0952  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.54 
 
 		 574 aa  226  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_0807  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.9 
 
 		 574 aa  226  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002976  SERP1199  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.27 
 
 		 757 aa  225  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.73 
 
 		 573 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A0618  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.44 
 
 		 574 aa  225  2e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_1035  exonuclease RecJ  31.53 
 
 		 569 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626016 
 
 
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NC_002947  PP_1477  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.59 
 
 		 569 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221142  normal  0.152861 
 
 
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NC_010506  Swoo_0897  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.18 
 
 		 574 aa  219  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_006368  lpp1417  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.93 
 
 		 579 aa  219  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_1817  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.13 
 
 		 585 aa  218  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0771206 
 
 
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NC_008709  Ping_3302  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.33 
 
 		 572 aa  218  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0912686  normal  0.117483 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.22 
 
 		 574 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008577  Shewana3_3329  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.39 
 
 		 574 aa  217  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_4244  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.42 
 
 		 569 aa  217  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3226  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.22 
 
 		 574 aa  217  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1395  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.9 
 
 		 571 aa  217  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_3522  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.87 
 
 		 577 aa  216  9e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009052  Sbal_0845  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.87 
 
 		 577 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_2838  RecJ exonuclease  31.03 
 
 		 566 aa  215  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.934115  normal  1 
 
 
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NC_011663  Sbal223_3447  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.04 
 
 		 574 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_16220  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.9 
 
 		 571 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008228  Patl_3712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.26 
 
 		 572 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_3641  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.54 
 
 		 577 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011138  MADE_03407  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32 
 
 		 573 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.54 
 
 		 831 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.46 
 
 		 586 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009802  CCC13826_0910  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.82 
 
 		 535 aa  214  4.9999999999999996e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006369  lpl1567  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.63 
 
 		 579 aa  214  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_0895  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.53 
 
 		 574 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647081 
 
 
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NC_004578  PSPTO_1488  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.05 
 
 		 569 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009379  Pnuc_1470  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.68 
 
 		 586 aa  213  7.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.22 
 
 		 576 aa  213  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_0892  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.26 
 
 		 584 aa  212  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.488933  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_1082  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.97 
 
 		 569 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012039  Cla_0013  single-stranded-DNA specific exonuclease  27.94 
 
 		 523 aa  211  2e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_00958  ssDNA exonuclease RecJ  30.18 
 
 		 579 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.3 
 
 		 569 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.810057 
 
 
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NC_003912  CJE0028  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.39 
 
 		 523 aa  211  4e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.85142  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3890  ssDNA exonuclease RecJ  31.52 
 
 		 577 aa  211  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0055  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.02 
 
 		 523 aa  211  5e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_0749  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.34 
 
 		 574 aa  210  6e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0015193  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.54 
 
 		 583 aa  210  6e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A3210  ssDNA exonuclease RecJ  30.2 
 
 		 577 aa  210  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.398907 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A3276  ssDNA exonuclease RecJ  30.2 
 
 		 577 aa  210  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B3198  ssDNA exonuclease RecJ  30.2 
 
 		 577 aa  210  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
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NC_009707  JJD26997_0030  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.57 
 
 		 523 aa  210  7e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A1993  ssDNA exonuclease RecJ  31.41 
 
 		 584 aa  210  8e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_1298  RecJ exonuclease  30.67 
 
 		 571 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882929  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1195  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.15 
 
 		 584 aa  209  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3273  ssDNA exonuclease RecJ  30.2 
 
 		 577 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3310  ssDNA exonuclease RecJ  30.2 
 
 		 577 aa  209  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.24828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3378  ssDNA exonuclease RecJ  30.2 
 
 		 577 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2085  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.1 
 
 		 525 aa  208  2e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0350737  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004439  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.82 
 
 		 579 aa  208  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.69 
 
 		 573 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_39440  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.91 
 
 		 569 aa  208  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.31407  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_3218  ssDNA exonuclease RecJ  30.24 
 
 		 577 aa  207  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I0564  ssDNA exonuclease RecJ  30.71 
 
 		 579 aa  208  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.755584  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  30.24 
 
 		 577 aa  207  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0487  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.15 
 
 		 601 aa  207  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.624528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.62 
 
 		 763 aa  207  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  30.24 
 
 		 577 aa  207  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1698  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.76 
 
 		 564 aa  207  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A3113  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.76 
 
 		 564 aa  207  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_2721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.76 
 
 		 564 aa  207  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2205  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.76 
 
 		 564 aa  207  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1478  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.76 
 
 		 564 aa  207  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2642  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.76 
 
 		 564 aa  207  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1038  exonuclease RecJ  31.26 
 
 		 566 aa  207  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.329478 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.09 
 
 		 564 aa  207  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214774  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2272  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.07 
 
 		 577 aa  207  6e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E3312  ssDNA exonuclease RecJ  30.24 
 
 		 577 aa  206  8e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_2588  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.58 
 
 		 564 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  30.05 
 
 		 577 aa  206  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_3760  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.88 
 
 		 610 aa  206  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.671236 
 
 
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NC_012880  Dd703_3298  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.37 
 
 		 580 aa  205  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.746333  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.27 
 
 		 572 aa  205  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_3025  ssDNA exonuclease RecJ  30.05 
 
 		 577 aa  205  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.89 
 
 		 566 aa  205  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_0863  ssDNA exonuclease RecJ  29.95 
 
 		 584 aa  205  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002950  PG0054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.11 
 
 		 584 aa  204  3e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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