More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0814 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0814  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 222 aa  454  1e-127  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.0012008  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  36.41 
 
 		 207 aa  131  7.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  36.87 
 
 		 207 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  36.87 
 
 		 207 aa  128  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  39.23 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  37.44 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  38.31 
 
 		 207 aa  125  7e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05720  50S ribosomal protein L4  39.72 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316206  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  34.7 
 
 		 206 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  37.09 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  35.94 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  35.48 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  35.48 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  35.48 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  35.48 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  35.48 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  35.48 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  35.48 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  35.48 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  35.48 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  36.41 
 
 		 207 aa  122  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  35.07 
 
 		 207 aa  122  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  35.02 
 
 		 207 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  38.1 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  38.1 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0396  50S ribosomal protein L4  39.81 
 
 		 209 aa  118  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  35.32 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  36.87 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  35.45 
 
 		 205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  35.68 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  38.65 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  37.09 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  37.04 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  37.04 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  39.34 
 
 		 207 aa  115  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2687  50S ribosomal protein L4  37.32 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0662732  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  39.34 
 
 		 207 aa  115  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  35.62 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  37.79 
 
 		 208 aa  115  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20021  50S ribosomal protein L4  35.85 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1128  50S ribosomal protein L4  35.85 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1956  50S ribosomal protein L4  39.15 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  38.68 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6048  50S ribosomal protein L4  40.49 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  36.49 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  36.97 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  36.76 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5786  ribosomal protein L4/L1e  36.32 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1148  50S ribosomal protein L4  38.32 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000671055  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1068  50S ribosomal protein L4  36.92 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000351414  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  34.88 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  35.27 
 
 		 207 aa  112  5e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  37.5 
 
 		 222 aa  112  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  35.94 
 
 		 214 aa  112  6e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  33.8 
 
 		 206 aa  112  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  36.32 
 
 		 215 aa  111  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5048  50S ribosomal protein L4  37.85 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5122  normal  0.277146 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  35.51 
 
 		 220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3998  50S ribosomal protein L4  39.88 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000169649 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23031  50S ribosomal protein L4  37.98 
 
 		 211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  38.25 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17391  50S ribosomal protein L4  36.07 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  32.06 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  33.18 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17641  50S ribosomal protein L4  36.07 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1306  50S ribosomal protein L4  39.02 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265076  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  36.36 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0375  50S ribosomal protein L4  38.21 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0307  50S ribosomal protein L4P  39.8 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224676 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  34.1 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0399  ribosomal protein L4/L1e  40.22 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3142  ribosomal protein L4/L1e  37.56 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.083105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  38.38 
 
 		 210 aa  108  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3161  50S ribosomal protein L4  36.36 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4314  ribosomal protein L4/L1e  35.71 
 
 		 216 aa  108  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  31.16 
 
 		 207 aa  108  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17481  50S ribosomal protein L4  35.62 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.533381  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3922  ribosomal protein L4/L1e  35.71 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17150  LSU ribosomal protein L4P  37.5 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1649  50S ribosomal protein L4  36.53 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10716  50S ribosomal protein L4  37.38 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311364 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  35.48 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  34.45 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0196  50S ribosomal protein L4  36.07 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.371225 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  31.25 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0274  50S ribosomal protein L4  38.73 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826226  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0279  50S ribosomal protein L4  38.73 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000793566  hitchhiker  0.00000000126953 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3794  50S ribosomal protein L4  35.75 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020741  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0628  ribosomal protein L4/L1e  36.59 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  33.95 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  36.02 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16771  50S ribosomal protein L4  36.62 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  34.72 
 
 		 205 aa  105  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1041  50S ribosomal protein L4  37.56 
 
 		 219 aa  104  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1014  50S ribosomal protein L4  37.56 
 
 		 219 aa  104  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1031  50S ribosomal protein L4  37.56 
 
 		 219 aa  104  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  37.11 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0768  50S ribosomal protein L4  34.26 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.294909  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0583  50S ribosomal protein L4  39.3 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  34.62 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>