228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10220 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10220  transmembrane protein  100 
 
 
442 aa  864    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0532075  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0714  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  73.58 
 
 
414 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0728  oxidoreductase, molybdopterin binding  73.58 
 
 
414 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.0312401 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0708  oxidoreductase, molybdopterin binding  73.33 
 
 
414 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133637  normal  0.0501912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2760  oxidoreductase molybdopterin binding  62.64 
 
 
447 aa  504  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.280905  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3093  oxidoreductase molybdopterin binding  41.3 
 
 
440 aa  262  8.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.13966  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0983  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.05 
 
 
417 aa  245  9e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2986  oxidoreductase molybdopterin binding protein  40.24 
 
 
395 aa  240  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0217905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4330  oxidoreductase molybdopterin binding  39.04 
 
 
396 aa  239  9e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591499  normal  0.212281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0889  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.8 
 
 
367 aa  237  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204318  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  35.88 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  35.93 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  33.93 
 
 
234 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6291  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  34.81 
 
 
202 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.0912306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  35.12 
 
 
255 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  34.71 
 
 
255 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  36.61 
 
 
242 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2409  oxidoreductase molybdopterin binding  33.57 
 
 
230 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00600031  normal  0.457141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  31.21 
 
 
262 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  32.69 
 
 
247 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.45 
 
 
253 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2793  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
206 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2341  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.59 
 
 
221 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0559328  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  31.06 
 
 
234 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.24 
 
 
261 aa  61.6  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  30.33 
 
 
495 aa  61.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  36.7 
 
 
255 aa  61.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  34.53 
 
 
258 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  27.31 
 
 
256 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  30.04 
 
 
249 aa  60.5  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  32.05 
 
 
247 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  35.78 
 
 
241 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  31.11 
 
 
215 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2080  oxidoreductase molybdopterin binding  25.99 
 
 
197 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4470  oxidoreductase molybdopterin binding  32.54 
 
 
201 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000629984 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3614  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.14 
 
 
196 aa  60.1  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507139  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.11 
 
 
256 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0382  oxidoreductase molybdopterin binding  37.06 
 
 
228 aa  59.7  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.761682 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  34.86 
 
 
255 aa  59.7  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.17 
 
 
237 aa  59.7  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  32.47 
 
 
234 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.43 
 
 
251 aa  59.7  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.58 
 
 
232 aa  58.9  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1672  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.9 
 
 
221 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.476748  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1055  oxidoreductase molybdopterin binding  31.74 
 
 
202 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.44844  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0108  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.7 
 
 
201 aa  58.9  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.532472  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0014  oxidoreductase molybdopterin binding  32.06 
 
 
230 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  31.41 
 
 
247 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  28.49 
 
 
205 aa  58.2  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  31.82 
 
 
234 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  35 
 
 
227 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1086  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.21 
 
 
205 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2056  oxidoreductase molybdopterin binding  25.42 
 
 
197 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  29.15 
 
 
249 aa  57.8  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.86 
 
 
249 aa  57  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  31.11 
 
 
258 aa  57  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3101  oxidoreductase molybdopterin binding  31.58 
 
 
205 aa  57  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  28.83 
 
 
260 aa  57  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1719  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.02 
 
 
198 aa  57  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135393  normal  0.135819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.47 
 
 
240 aa  56.6  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0122  molybdopterin binding oxidoreductase  27.27 
 
 
215 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2124  oxidoreductase molybdopterin binding  28.48 
 
 
201 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.117329 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  32.81 
 
 
258 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.82 
 
 
233 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3000  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.2 
 
 
198 aa  55.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  30.37 
 
 
259 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2682  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  33.03 
 
 
199 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  31.55 
 
 
231 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1931  oxidoreductase molybdopterin binding  32.62 
 
 
221 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00345807  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1597  oxidoreductase molybdopterin binding  28.07 
 
 
201 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  31.78 
 
 
241 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2875  hypothetical protein  31.4 
 
 
220 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188731  normal  0.0133652 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  31.58 
 
 
218 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  33.05 
 
 
233 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.39 
 
 
200 aa  54.7  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3399  oxidoreductase molybdopterin binding  27.78 
 
 
201 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  hitchhiker  0.00928486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  29.61 
 
 
263 aa  54.7  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5298  oxidoreductase molybdopterin binding  24.22 
 
 
198 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3632  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.41 
 
 
221 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.16 
 
 
239 aa  54.3  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1262  oxidoreductase molybdopterin binding  34.4 
 
 
367 aa  53.9  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  29.85 
 
 
259 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1443  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.9 
 
 
520 aa  53.9  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.63286  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.24 
 
 
204 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  31.86 
 
 
256 aa  53.9  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3360  oxidoreductase molybdopterin binding  32.22 
 
 
211 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.28 
 
 
243 aa  53.5  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4058  oxidoreductase molybdopterin binding  29.78 
 
 
200 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.319932  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  30 
 
 
258 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3045  oxidoreductase molybdopterin binding  31.29 
 
 
202 aa  53.5  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00029473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2401  oxidoreductase molybdopterin binding  27.27 
 
 
201 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242306  normal  0.764459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  31.25 
 
 
259 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3725  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.99 
 
 
200 aa  53.1  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  32.11 
 
 
263 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  32.31 
 
 
262 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2603  oxidoreductase, molybdopterin binding  25.42 
 
 
198 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  32.11 
 
 
263 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  32.11 
 
 
263 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  32.11 
 
 
263 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  32.11 
 
 
263 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>