162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2760 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2760  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
447 aa  881    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.280905  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0714  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  66.67 
 
 
414 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0728  oxidoreductase, molybdopterin binding  66.67 
 
 
414 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.0312401 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0708  oxidoreductase, molybdopterin binding  66.17 
 
 
414 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133637  normal  0.0501912 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10220  transmembrane protein  62.64 
 
 
442 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0532075  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3093  oxidoreductase molybdopterin binding  42.93 
 
 
440 aa  278  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.13966  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2986  oxidoreductase molybdopterin binding protein  41.6 
 
 
395 aa  249  7e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0217905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0889  oxidoreductase, molybdopterin binding  42.86 
 
 
367 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204318  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0983  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.75 
 
 
417 aa  236  9e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4330  oxidoreductase molybdopterin binding  37.44 
 
 
396 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591499  normal  0.212281 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3101  oxidoreductase molybdopterin binding  37.25 
 
 
205 aa  63.2  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5298  oxidoreductase molybdopterin binding  25.66 
 
 
198 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.79 
 
 
266 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.31 
 
 
505 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  30.05 
 
 
374 aa  60.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2603  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.4 
 
 
198 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  32.52 
 
 
242 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  33.81 
 
 
554 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.52 
 
 
229 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3614  oxidoreductase, molybdopterin binding  23.6 
 
 
196 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507139  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  37.4 
 
 
501 aa  57.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  35.16 
 
 
570 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2080  oxidoreductase molybdopterin binding  25.83 
 
 
197 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  29.76 
 
 
495 aa  57.4  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2409  oxidoreductase molybdopterin binding  30.14 
 
 
230 aa  57  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00600031  normal  0.457141 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2056  oxidoreductase molybdopterin binding  25.17 
 
 
197 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.67 
 
 
200 aa  55.5  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0014  oxidoreductase molybdopterin binding  31.82 
 
 
230 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  30.77 
 
 
234 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  25.69 
 
 
501 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1719  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.82 
 
 
198 aa  55.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135393  normal  0.135819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4533  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.16 
 
 
508 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484625  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2545  oxidoreductase molybdopterin binding  29.44 
 
 
373 aa  55.1  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  32.35 
 
 
524 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4058  oxidoreductase molybdopterin binding  27.63 
 
 
200 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.319932  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  33.09 
 
 
512 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.09 
 
 
512 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.09 
 
 
512 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.12 
 
 
505 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  30.23 
 
 
234 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1086  oxidoreductase, molybdopterin binding  31 
 
 
205 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  29.11 
 
 
255 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  29.56 
 
 
255 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  34.27 
 
 
227 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  28.29 
 
 
263 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2341  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.25 
 
 
221 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0559328  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2793  oxidoreductase molybdopterin binding  31 
 
 
206 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0108  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.36 
 
 
201 aa  53.1  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.532472  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  35.42 
 
 
372 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0428  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.33 
 
 
230 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2564  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.05 
 
 
230 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  26.41 
 
 
256 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0382  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
228 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.761682 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1471  oxidoreductase molybdopterin binding  30.36 
 
 
196 aa  53.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000177918  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0391  oxidoreductase molybdopterin binding  30.34 
 
 
231 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  28.99 
 
 
259 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1262  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
367 aa  52.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2875  hypothetical protein  31.21 
 
 
220 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188731  normal  0.0133652 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  31.06 
 
 
234 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4179  oxidoreductase molybdopterin binding  31.61 
 
 
351 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0370615  unclonable  0.000000000255221 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  30.23 
 
 
234 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  29.55 
 
 
205 aa  50.8  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1055  oxidoreductase molybdopterin binding  28.39 
 
 
202 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.44844  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5364  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.86 
 
 
545 aa  51.2  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.04 
 
 
261 aa  50.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5578  oxidoreductase molybdopterin binding  34.11 
 
 
199 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275007  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0237  oxidoreductase molybdopterin binding  23.35 
 
 
189 aa  50.4  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.164235  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  29.66 
 
 
231 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  33.66 
 
 
234 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  32 
 
 
431 aa  50.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  30.81 
 
 
247 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.08 
 
 
525 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1906  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.75 
 
 
229 aa  50.1  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0593419  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44482  predicted protein  32.61 
 
 
600 aa  50.1  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00564143  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4470  oxidoreductase molybdopterin binding  32.58 
 
 
201 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000629984 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6733  oxidoreductase molybdopterin binding  29.5 
 
 
608 aa  50.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0361  molybdopterin-binding oxidoreductase  29.66 
 
 
231 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.16 
 
 
237 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4315  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.95 
 
 
350 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3399  oxidoreductase molybdopterin binding  29.77 
 
 
201 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  hitchhiker  0.00928486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  32.2 
 
 
241 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  27.46 
 
 
259 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.77 
 
 
417 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.61 
 
 
532 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.62 
 
 
335 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  26.9 
 
 
260 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0122  molybdopterin binding oxidoreductase  28.36 
 
 
215 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  28.57 
 
 
231 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  31.19 
 
 
255 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6291  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  27.61 
 
 
202 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.0912306 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.83 
 
 
253 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2471  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.14 
 
 
197 aa  47.8  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.7 
 
 
199 aa  47.4  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2401  oxidoreductase molybdopterin binding  28.39 
 
 
201 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242306  normal  0.764459 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2124  oxidoreductase molybdopterin binding  27.74 
 
 
201 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.117329 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1931  oxidoreductase molybdopterin binding  31.85 
 
 
221 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00345807  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  29.17 
 
 
445 aa  47  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.97 
 
 
411 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1229  oxidoreductase molybdopterin binding  28.12 
 
 
220 aa  47  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00326003  normal  0.661197 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  30.49 
 
 
259 aa  47  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>