129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0983 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0983  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 		 417 aa  823    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2986  oxidoreductase molybdopterin binding protein  48.96 
 
 		 395 aa  352  5.9999999999999994e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0217905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4330  oxidoreductase molybdopterin binding  48.47 
 
 		 396 aa  333  4e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591499  normal  0.212281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0889  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.99 
 
 		 367 aa  317  3e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3093  oxidoreductase molybdopterin binding  46.46 
 
 		 440 aa  305  8.000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.13966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0714  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  38.93 
 
 		 414 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0728  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.93 
 
 		 414 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.0312401 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0708  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.19 
 
 		 414 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133637  normal  0.0501912 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10220  transmembrane protein  39.52 
 
 		 442 aa  237  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0532075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2760  oxidoreductase molybdopterin binding  39.25 
 
 		 447 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.280905  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.97 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  35.26 
 
 		 256 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  34.39 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  32.5 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  34.15 
 
 		 255 aa  62.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  35.11 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.11 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.11 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.58 
 
 		 505 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0428  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.23 
 
 		 230 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  32.58 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.33 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  32.58 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  28.37 
 
 		 495 aa  57.4  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  35.34 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  35.34 
 
 		 234 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.38 
 
 		 505 aa  57  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.81 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  33.85 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.19 
 
 		 266 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  32.81 
 
 		 263 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1262  oxidoreductase molybdopterin binding  41.24 
 
 		 367 aa  54.3  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  31.85 
 
 		 241 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.88 
 
 		 525 aa  53.5  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  34.17 
 
 		 234 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  30.95 
 
 		 257 aa  52.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3236  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.3 
 
 		 351 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143797  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  26.83 
 
 		 263 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.93 
 
 		 501 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4533  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.99 
 
 		 508 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484625  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.72 
 
 		 237 aa  51.6  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  27.48 
 
 		 263 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  25.96 
 
 		 262 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2579  oxidoreductase molybdopterin binding  30.25 
 
 		 224 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 		 241 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2545  oxidoreductase molybdopterin binding  38.79 
 
 		 373 aa  50.8  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  31.54 
 
 		 215 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  32.85 
 
 		 256 aa  50.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.36 
 
 		 229 aa  50.8  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  30.25 
 
 		 234 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  24.24 
 
 		 451 aa  50.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.8 
 
 		 416 aa  50.4  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.41 
 
 		 517 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2817  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.04 
 
 		 301 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.71 
 
 		 200 aa  49.7  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.77 
 
 		 251 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  38.95 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4179  oxidoreductase molybdopterin binding  34.92 
 
 		 351 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0370615  unclonable  0.000000000255221 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.77 
 
 		 256 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  26.72 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.93 
 
 		 233 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  35.64 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  31.2 
 
 		 263 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  32.52 
 
 		 258 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  31.47 
 
 		 258 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  31.45 
 
 		 259 aa  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  32.59 
 
 		 531 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  30.13 
 
 		 242 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.85 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  30.4 
 
 		 259 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  31.85 
 
 		 528 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.32 
 
 		 199 aa  47.4  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.58 
 
 		 511 aa  47.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4470  oxidoreductase molybdopterin binding  33.88 
 
 		 201 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000629984 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6733  oxidoreductase molybdopterin binding  30.71 
 
 		 608 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3462  oxidoreductase molybdopterin binding  30.3 
 
 		 220 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167102  normal  0.590309 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  28.99 
 
 		 262 aa  47  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  26.56 
 
 		 263 aa  47  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.83 
 
 		 263 aa  47  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.83 
 
 		 263 aa  47  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  29.37 
 
 		 263 aa  47  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 		 524 aa  47  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1410  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.14 
 
 		 301 aa  46.6  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  25.59 
 
 		 260 aa  46.6  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  36.46 
 
 		 401 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  27.27 
 
 		 218 aa  46.6  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  31.2 
 
 		 263 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0738  Sulfite oxidase-like protein  32.82 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0077  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.14 
 
 		 301 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.09 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.33 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.48 
 
 		 259 aa  45.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  30.4 
 
 		 257 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  30.53 
 
 		 258 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  35.29 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  35.29 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.36 
 
 		 315 aa  45.8  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00411856  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.22 
 
 		 263 aa  44.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  28 
 
 		 259 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.35 
 
 		 261 aa  45.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>