240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4330 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4330  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
396 aa  777    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591499  normal  0.212281 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0983  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.96 
 
 
417 aa  332  9e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2986  oxidoreductase molybdopterin binding protein  49.33 
 
 
395 aa  326  4.0000000000000003e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0217905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0889  oxidoreductase, molybdopterin binding  50.13 
 
 
367 aa  323  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204318  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3093  oxidoreductase molybdopterin binding  44.83 
 
 
440 aa  298  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.13966  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10220  transmembrane protein  39.04 
 
 
442 aa  228  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0532075  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0714  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  37.38 
 
 
414 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0728  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.38 
 
 
414 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.0312401 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0708  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.62 
 
 
414 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133637  normal  0.0501912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2760  oxidoreductase molybdopterin binding  37.44 
 
 
447 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.280905  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  34.38 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  34.38 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  36.02 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  34.34 
 
 
495 aa  73.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  34.19 
 
 
242 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  32.47 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  34.09 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  38.97 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  35.82 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  31.28 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  31.28 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  34.62 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  30.49 
 
 
451 aa  69.7  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  35.1 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  34.62 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.89 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.34 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  32 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  32 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  32.67 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4058  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
200 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.319932  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.22 
 
 
249 aa  67  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  29.44 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  32.58 
 
 
215 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  28.78 
 
 
259 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 
259 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  32.58 
 
 
234 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.8 
 
 
266 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  30.77 
 
 
258 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  28.79 
 
 
260 aa  63.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  30.96 
 
 
249 aa  64.3  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  35.04 
 
 
570 aa  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  32 
 
 
257 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  29.23 
 
 
259 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
554 aa  63.2  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.82 
 
 
256 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  31.33 
 
 
262 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  29.86 
 
 
234 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  30.77 
 
 
524 aa  62.8  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.57 
 
 
262 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.57 
 
 
262 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  35.14 
 
 
241 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.85 
 
 
253 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  28.05 
 
 
406 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3000  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.72 
 
 
198 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6733  oxidoreductase molybdopterin binding  34.78 
 
 
608 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.08 
 
 
262 aa  60.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4179  oxidoreductase molybdopterin binding  33.85 
 
 
351 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0370615  unclonable  0.000000000255221 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.92 
 
 
261 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  34.59 
 
 
258 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  34.46 
 
 
259 aa  60.1  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.32 
 
 
237 aa  60.1  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2545  oxidoreductase molybdopterin binding  28.11 
 
 
373 aa  59.7  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  30.86 
 
 
258 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.87 
 
 
508 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  28.79 
 
 
263 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.91 
 
 
199 aa  58.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  31.33 
 
 
263 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4230  oxidoreductase molybdopterin binding  34.27 
 
 
531 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  31.33 
 
 
263 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  31.78 
 
 
234 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  28.46 
 
 
263 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1262  oxidoreductase molybdopterin binding  34.21 
 
 
367 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  30.66 
 
 
531 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2603  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.33 
 
 
198 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  31.33 
 
 
263 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  31.33 
 
 
263 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  31.33 
 
 
263 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  31.33 
 
 
263 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  31.33 
 
 
263 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  27.35 
 
 
258 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  30.66 
 
 
528 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.12 
 
 
453 aa  58.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  28.04 
 
 
374 aa  57.8  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1443  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.09 
 
 
520 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.63286  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2409  oxidoreductase molybdopterin binding  31.01 
 
 
230 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00600031  normal  0.457141 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.78 
 
 
515 aa  58.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.35 
 
 
233 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  30.07 
 
 
262 aa  57.4  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2529  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.59 
 
 
181 aa  57.4  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  29.23 
 
 
259 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  34.81 
 
 
512 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.66 
 
 
525 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.81 
 
 
512 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  30.77 
 
 
263 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.81 
 
 
512 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4544  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.33 
 
 
512 aa  57.4  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  30.07 
 
 
376 aa  57  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>