235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0728 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0714  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  100 
 
 
414 aa  810    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0728  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 
414 aa  810    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.0312401 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0708  oxidoreductase, molybdopterin binding  98.79 
 
 
414 aa  804    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133637  normal  0.0501912 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10220  transmembrane protein  73.58 
 
 
442 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0532075  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2760  oxidoreductase molybdopterin binding  66.67 
 
 
447 aa  505  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.280905  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3093  oxidoreductase molybdopterin binding  42.89 
 
 
440 aa  265  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.13966  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2986  oxidoreductase molybdopterin binding protein  41.35 
 
 
395 aa  242  7.999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0217905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0889  oxidoreductase, molybdopterin binding  41.6 
 
 
367 aa  239  9e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204318  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0983  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.93 
 
 
417 aa  233  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4330  oxidoreductase molybdopterin binding  37.38 
 
 
396 aa  216  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591499  normal  0.212281 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0108  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.27 
 
 
201 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.532472  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3399  oxidoreductase molybdopterin binding  36.17 
 
 
201 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  hitchhiker  0.00928486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0122  molybdopterin binding oxidoreductase  32.87 
 
 
215 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2341  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.51 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0559328  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2124  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
201 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.117329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  38.33 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4470  oxidoreductase molybdopterin binding  34.75 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000629984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5182  oxidoreductase molybdopterin binding  33.57 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2401  oxidoreductase molybdopterin binding  31.91 
 
 
201 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242306  normal  0.764459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6291  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  37.59 
 
 
202 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.0912306 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2409  oxidoreductase molybdopterin binding  34.75 
 
 
230 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00600031  normal  0.457141 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2079  oxidoreductase molybdopterin binding  32.62 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393771  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2080  oxidoreductase molybdopterin binding  27.14 
 
 
197 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  35.61 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0014  oxidoreductase molybdopterin binding  34.51 
 
 
230 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  33.57 
 
 
374 aa  66.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.56 
 
 
233 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4200  oxidoreductase molybdopterin binding  34.97 
 
 
220 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483422  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3614  oxidoreductase, molybdopterin binding  25 
 
 
196 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507139  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5298  oxidoreductase molybdopterin binding  25.71 
 
 
198 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.41 
 
 
237 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.43 
 
 
229 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.16 
 
 
266 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2875  hypothetical protein  35.46 
 
 
220 aa  64.3  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188731  normal  0.0133652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  32.85 
 
 
227 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2056  oxidoreductase molybdopterin binding  26.43 
 
 
197 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0382  oxidoreductase molybdopterin binding  36.17 
 
 
228 aa  63.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.761682 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3171  oxidoreductase molybdopterin binding  34.75 
 
 
220 aa  63.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537179  normal  0.5179 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2682  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  31.21 
 
 
199 aa  63.2  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2793  oxidoreductase molybdopterin binding  32.52 
 
 
206 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3462  oxidoreductase molybdopterin binding  30.66 
 
 
220 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167102  normal  0.590309 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4058  oxidoreductase molybdopterin binding  27.86 
 
 
200 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.319932  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  33.08 
 
 
234 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  27.93 
 
 
260 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3101  oxidoreductase molybdopterin binding  35.09 
 
 
205 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1055  oxidoreductase molybdopterin binding  31.03 
 
 
202 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.44844  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  34.72 
 
 
570 aa  61.6  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  32.31 
 
 
234 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2603  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.43 
 
 
198 aa  60.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  32.23 
 
 
218 aa  60.5  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  32.31 
 
 
234 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  33.81 
 
 
263 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  32.33 
 
 
205 aa  59.7  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  31.54 
 
 
256 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0428  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.33 
 
 
230 aa  59.7  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  32.73 
 
 
501 aa  59.7  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1931  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
221 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00345807  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2564  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.62 
 
 
230 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1086  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.9 
 
 
205 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2471  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.62 
 
 
197 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  40.22 
 
 
512 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  33.8 
 
 
554 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.22 
 
 
512 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.22 
 
 
512 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  36.44 
 
 
241 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3632  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.86 
 
 
221 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.18 
 
 
505 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4230  oxidoreductase molybdopterin binding  37.16 
 
 
531 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  34.75 
 
 
255 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  34.59 
 
 
370 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1719  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.96 
 
 
198 aa  57.4  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135393  normal  0.135819 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  29.3 
 
 
495 aa  57.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.65 
 
 
232 aa  57  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.12 
 
 
505 aa  57  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  34.82 
 
 
233 aa  57  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.36 
 
 
240 aa  57  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  30.43 
 
 
259 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  30 
 
 
200 aa  57  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  33.9 
 
 
255 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1906  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.99 
 
 
229 aa  56.6  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0593419  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3360  oxidoreductase molybdopterin binding  32.43 
 
 
211 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  33.9 
 
 
215 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.5 
 
 
200 aa  56.2  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  32.61 
 
 
258 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4091  oxidoreductase molybdopterin binding  34.24 
 
 
199 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.228121 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.97 
 
 
261 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3725  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.21 
 
 
200 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  31.62 
 
 
263 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  32.45 
 
 
247 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  32.62 
 
 
231 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2545  oxidoreductase molybdopterin binding  33.59 
 
 
373 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.23 
 
 
256 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  30.43 
 
 
259 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.73 
 
 
253 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1443  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.21 
 
 
520 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.63286  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  32.76 
 
 
263 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3045  oxidoreductase molybdopterin binding  30.34 
 
 
202 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00029473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  28 
 
 
259 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  30.33 
 
 
234 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0323  oxidoreductase molybdopterin binding  34.04 
 
 
229 aa  55.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.204614  normal  0.422647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>