More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2545 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2545  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
373 aa  730    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1262  oxidoreductase molybdopterin binding  48.79 
 
 
367 aa  276  5e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4315  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.57 
 
 
350 aa  240  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4179  oxidoreductase molybdopterin binding  44.79 
 
 
351 aa  239  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0370615  unclonable  0.000000000255221 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3236  oxidoreductase molybdopterin binding protein  39.92 
 
 
351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143797  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0428  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.14 
 
 
230 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.33 
 
 
501 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  34.18 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  32.02 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2986  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.83 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0217905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  35.09 
 
 
227 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4200  oxidoreductase molybdopterin binding  33.77 
 
 
220 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483422  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0361  molybdopterin-binding oxidoreductase  32.24 
 
 
231 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3171  oxidoreductase molybdopterin binding  34.42 
 
 
220 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537179  normal  0.5179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.97 
 
 
240 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  29.26 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.03 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.79 
 
 
465 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.94 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0391  oxidoreductase molybdopterin binding  28.82 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.62 
 
 
266 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  28.57 
 
 
231 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  32.89 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2529  oxidoreductase molybdopterin binding protein  38.26 
 
 
181 aa  67.8  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  30.28 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0889  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.65 
 
 
367 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204318  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  28.14 
 
 
263 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3462  oxidoreductase molybdopterin binding  33.77 
 
 
220 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167102  normal  0.590309 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.1 
 
 
209 aa  63.9  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2579  oxidoreductase molybdopterin binding  31.13 
 
 
224 aa  63.9  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1981  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.33 
 
 
340 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141842  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  27.85 
 
 
263 aa  63.9  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  29.41 
 
 
495 aa  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  28.14 
 
 
263 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.01 
 
 
430 aa  63.2  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  25.39 
 
 
259 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3093  oxidoreductase molybdopterin binding  35.4 
 
 
440 aa  63.2  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.13966  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4330  oxidoreductase molybdopterin binding  28.38 
 
 
396 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591499  normal  0.212281 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.57 
 
 
200 aa  61.6  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  30.07 
 
 
425 aa  61.2  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  25.75 
 
 
262 aa  61.2  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  34.29 
 
 
420 aa  60.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2682  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  31.82 
 
 
199 aa  61.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.11 
 
 
229 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1263  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.12 
 
 
204 aa  61.2  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0014  oxidoreductase molybdopterin binding  26.21 
 
 
230 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  28.42 
 
 
257 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  31.37 
 
 
256 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  26.8 
 
 
263 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.27 
 
 
199 aa  60.1  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2409  oxidoreductase molybdopterin binding  29.68 
 
 
230 aa  60.1  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00600031  normal  0.457141 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  35.48 
 
 
349 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  26.95 
 
 
263 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0714  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  34.38 
 
 
414 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0728  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.38 
 
 
414 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.0312401 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  32.91 
 
 
234 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.34 
 
 
253 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2527  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.06 
 
 
345 aa  59.7  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  27.54 
 
 
263 aa  59.7  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  29.5 
 
 
234 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2760  oxidoreductase molybdopterin binding  31.93 
 
 
447 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.280905  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2564  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.69 
 
 
230 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  33.33 
 
 
234 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  24.87 
 
 
259 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3632  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.05 
 
 
221 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  29.49 
 
 
430 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  26.95 
 
 
263 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  31.82 
 
 
233 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.84 
 
 
200 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  30.06 
 
 
259 aa  57.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1107  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.67 
 
 
207 aa  57.8  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.266904  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  28.34 
 
 
234 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0708  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.81 
 
 
414 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133637  normal  0.0501912 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2042  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.41 
 
 
344 aa  57.4  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2055  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.11 
 
 
344 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00062173  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0623  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.26 
 
 
305 aa  57  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.689313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  33.99 
 
 
570 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  25.75 
 
 
259 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  29.52 
 
 
406 aa  57  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2109  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.82 
 
 
344 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.327015  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1758  putative sulfite oxidase subunit YedY  26.63 
 
 
325 aa  57  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.33 
 
 
505 aa  57  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.48 
 
 
405 aa  57  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1893  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.32 
 
 
334 aa  56.6  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.772909  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0990  putative sulfite oxidase subunit YedY  25.62 
 
 
319 aa  56.6  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0932  putative sulfite oxidase subunit YedY  25.62 
 
 
319 aa  56.6  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  25.71 
 
 
258 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4058  oxidoreductase molybdopterin binding  29.17 
 
 
200 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.319932  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  27.43 
 
 
258 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  30.29 
 
 
361 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2134  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.9 
 
 
302 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2102  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.55 
 
 
344 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1410  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.86 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  31.21 
 
 
202 aa  55.8  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.74907  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2283  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.55 
 
 
344 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0379362  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2014  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.17 
 
 
332 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0576  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.22 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2619  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.48 
 
 
338 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0854128  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4557  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.55 
 
 
344 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0077  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.25 
 
 
301 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>