More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3093 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3093  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
440 aa  849    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.13966  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2986  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.28 
 
 
395 aa  340  4e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0217905 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0983  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.73 
 
 
417 aa  311  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4330  oxidoreductase molybdopterin binding  44.94 
 
 
396 aa  307  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591499  normal  0.212281 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0714  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  42.89 
 
 
414 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0728  oxidoreductase, molybdopterin binding  42.89 
 
 
414 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.0312401 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0708  oxidoreductase, molybdopterin binding  42.89 
 
 
414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133637  normal  0.0501912 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0889  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.58 
 
 
367 aa  267  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204318  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2760  oxidoreductase molybdopterin binding  43.55 
 
 
447 aa  263  6.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.280905  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10220  transmembrane protein  42.79 
 
 
442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0532075  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  29.43 
 
 
495 aa  81.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.21 
 
 
240 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  36.17 
 
 
255 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  32.99 
 
 
234 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  37.06 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.91 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  32.85 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  34.21 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  35.37 
 
 
263 aa  72.8  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  33.68 
 
 
234 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  35.92 
 
 
263 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  35.61 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  30.54 
 
 
374 aa  71.2  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  35.22 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  35 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  33.16 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  32.85 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  35.66 
 
 
554 aa  70.9  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.33 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.65 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  34.31 
 
 
263 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  30 
 
 
261 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  36.09 
 
 
258 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  34.72 
 
 
258 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  31.75 
 
 
234 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  31.43 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  33.76 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  30 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2409  oxidoreductase molybdopterin binding  32.19 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00600031  normal  0.457141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  38.46 
 
 
227 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  35.07 
 
 
263 aa  67  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.89 
 
 
501 aa  67  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  34.78 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  34.78 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  34.78 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  34.78 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  34.78 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  34.78 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  34.78 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0428  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.96 
 
 
230 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  30.94 
 
 
259 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  32.12 
 
 
255 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  36 
 
 
257 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.59 
 
 
249 aa  65.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  30.83 
 
 
263 aa  65.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  32.39 
 
 
263 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
570 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.57 
 
 
229 aa  65.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5298  oxidoreductase molybdopterin binding  26.45 
 
 
198 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  34.33 
 
 
263 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3614  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.24 
 
 
196 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507139  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2564  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.33 
 
 
230 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3101  oxidoreductase molybdopterin binding  35.24 
 
 
205 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.85 
 
 
251 aa  64.3  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  30.99 
 
 
258 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2529  oxidoreductase molybdopterin binding protein  37.32 
 
 
181 aa  63.9  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0014  oxidoreductase molybdopterin binding  32.17 
 
 
230 aa  63.9  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1443  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.24 
 
 
520 aa  63.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.63286  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  35.59 
 
 
256 aa  63.2  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0428  putative sulfite oxidase subunit YedY  25.89 
 
 
297 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.35 
 
 
465 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  31.91 
 
 
262 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.66 
 
 
199 aa  62  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  32.39 
 
 
258 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.12 
 
 
256 aa  62  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  33.93 
 
 
241 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0403  putative sulfite oxidase subunit YedY  25.89 
 
 
297 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  32.46 
 
 
263 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  28.81 
 
 
420 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  34.62 
 
 
247 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  32.74 
 
 
215 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.33 
 
 
233 aa  60.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  32.74 
 
 
255 aa  60.5  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  34.48 
 
 
262 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  32.37 
 
 
258 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1262  oxidoreductase molybdopterin binding  38.79 
 
 
367 aa  60.5  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  33.85 
 
 
247 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  33.85 
 
 
247 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.09 
 
 
505 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.21 
 
 
200 aa  59.3  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.23 
 
 
515 aa  59.3  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.09 
 
 
263 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  31.47 
 
 
258 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2545  oxidoreductase molybdopterin binding  35.4 
 
 
373 aa  59.3  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2579  oxidoreductase molybdopterin binding  31.93 
 
 
224 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1075  putative sulfite oxidase subunit YedY  25.43 
 
 
297 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.88 
 
 
262 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.51 
 
 
262 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.09 
 
 
263 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.62 
 
 
262 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>