124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3236 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3236  oxidoreductase molybdopterin binding protein  100 
 
 		 351 aa  651    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143797  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2545  oxidoreductase molybdopterin binding  37.24 
 
 		 373 aa  152  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1262  oxidoreductase molybdopterin binding  39.09 
 
 		 367 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4179  oxidoreductase molybdopterin binding  39.67 
 
 		 351 aa  136  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0370615  unclonable  0.000000000255221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4315  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.6 
 
 		 350 aa  123  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0428  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.26 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0983  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.52 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3134  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  33.61 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  40.2 
 
 		 420 aa  56.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  36.21 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3258  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  32.76 
 
 		 449 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.16 
 
 		 501 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  38.83 
 
 		 414 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3093  oxidoreductase molybdopterin binding  39.71 
 
 		 440 aa  53.9  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.13966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  35.97 
 
 		 372 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1040  hypothetical protein  42.47 
 
 		 200 aa  53.1  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.686628  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2682  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  35.58 
 
 		 199 aa  53.1  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  45 
 
 		 431 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4330  oxidoreductase molybdopterin binding  29.83 
 
 		 396 aa  53.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591499  normal  0.212281 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2286  molybdopterin-binding oxidoreductase  34.75 
 
 		 451 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0386813  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  37.04 
 
 		 424 aa  52.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.19 
 
 		 233 aa  53.1  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  50 
 
 		 425 aa  52.8  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  34.21 
 
 		 445 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  31.21 
 
 		 234 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  34.21 
 
 		 449 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2631  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  33.61 
 
 		 443 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0714  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  40.19 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0728  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.19 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.0312401 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  31.91 
 
 		 409 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.3 
 
 		 415 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  45 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  32.46 
 
 		 495 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2513  oxidoreductase molybdopterin binding  36.63 
 
 		 528 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  44.07 
 
 		 427 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  37.14 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3462  oxidoreductase molybdopterin binding  35.29 
 
 		 220 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167102  normal  0.590309 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0889  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.99 
 
 		 367 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  36.05 
 
 		 505 aa  51.2  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3171  oxidoreductase molybdopterin binding  34 
 
 		 220 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537179  normal  0.5179 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.1 
 
 		 237 aa  50.4  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  43.33 
 
 		 425 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0708  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.25 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133637  normal  0.0501912 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3784  oxidoreductase molybdopterin binding  32.46 
 
 		 457 aa  50.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1263  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.97 
 
 		 204 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  43.86 
 
 		 440 aa  50.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  36.56 
 
 		 430 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  30.39 
 
 		 205 aa  50.1  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.36 
 
 		 229 aa  49.7  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  34.91 
 
 		 231 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  31.19 
 
 		 427 aa  49.7  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08058  sulfite oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02190)  29.88 
 
 		 380 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08449  nitrate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10420)  34.65 
 
 		 1016 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.92163  normal  0.772146 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  37.27 
 
 		 419 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  36.36 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0801  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.33 
 
 		 451 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.325021  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  32.71 
 
 		 406 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  27.15 
 
 		 256 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0361  molybdopterin-binding oxidoreductase  35.92 
 
 		 231 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  38.54 
 
 		 570 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3124  oxidoreductase molybdopterin binding protein  55.32 
 
 		 213 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.837634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  33.98 
 
 		 231 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  38.95 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2986  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0217905 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  33.66 
 
 		 406 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0391  oxidoreductase molybdopterin binding  33.98 
 
 		 231 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  43.1 
 
 		 431 aa  47.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.78 
 
 		 430 aa  47  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2438  putative sulfite oxidase molybdopterin subunit  38.71 
 
 		 457 aa  47.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.33 
 
 		 415 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  33.66 
 
 		 402 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1452  oxidoreductase molybdopterin binding  40.28 
 
 		 309 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.952926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  29.38 
 
 		 414 aa  47  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2329  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.19 
 
 		 512 aa  47  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  32.46 
 
 		 270 aa  46.6  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.36 
 
 		 416 aa  46.6  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4200  oxidoreductase molybdopterin binding  31.37 
 
 		 220 aa  46.6  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.39 
 
 		 249 aa  46.2  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  33.33 
 
 		 512 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.33 
 
 		 512 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.33 
 
 		 512 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2760  oxidoreductase molybdopterin binding  33.01 
 
 		 447 aa  46.2  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.280905  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.19 
 
 		 209 aa  45.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.58 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2579  oxidoreductase molybdopterin binding  32.04 
 
 		 224 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  31.76 
 
 		 409 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  42.86 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  23.58 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.2 
 
 		 505 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.92 
 
 		 505 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  37.11 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  52 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2049  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.78 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00190211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2529  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.07 
 
 		 181 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  34.69 
 
 		 414 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.88 
 
 		 415 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  0.0000568946 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  35 
 
 		 410 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  26.36 
 
 		 263 aa  43.9  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0623  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.08 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689313 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>