251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3606 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3606  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 
389 aa  759    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0938214 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3987  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  79.29 
 
 
395 aa  588  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1926  Arginase/agmatinase/formimino glutamase  67.58 
 
 
295 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8299  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  44.08 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1296  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.06 
 
 
305 aa  172  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.925134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2768  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  40.69 
 
 
298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4687  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.08 
 
 
300 aa  166  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5245  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  39.13 
 
 
307 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341043  normal  0.463568 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0221  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  38.26 
 
 
330 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00735889 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0213  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  36.78 
 
 
362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0654  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.59 
 
 
310 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2669  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.49 
 
 
301 aa  114  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0909707  normal  0.34784 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.08 
 
 
309 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  29.05 
 
 
299 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  29.93 
 
 
299 aa  90.9  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  29.24 
 
 
299 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  30.94 
 
 
306 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  30.74 
 
 
302 aa  87.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  28.14 
 
 
297 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  28.14 
 
 
297 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  29.63 
 
 
306 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  28.14 
 
 
297 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  28.14 
 
 
297 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  28.14 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  28.14 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  28.14 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  28.14 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  28.14 
 
 
297 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  31.58 
 
 
298 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  28.14 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.77 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  30.71 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  30.95 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  28.62 
 
 
311 aa  77  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  26.45 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  26.45 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  27.74 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  26.06 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  27.12 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  25.24 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  28.98 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  26.42 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  29.87 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  26.42 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  29.87 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  26.62 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  29.23 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  29.97 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  28.87 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  25.32 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  28.82 
 
 
282 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  28.06 
 
 
303 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  28.14 
 
 
298 aa  72.8  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  26.77 
 
 
311 aa  72.4  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  26.15 
 
 
297 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  28.16 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  28.21 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  27.33 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  26.98 
 
 
341 aa  70.5  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  28.46 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  26.71 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  27.15 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  28.83 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  26.97 
 
 
304 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  30.21 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  27.96 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  26.47 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  27.54 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  23.93 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  28.01 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  27.08 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  26.78 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  26.78 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  26.78 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  26.51 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  28.08 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  27.27 
 
 
326 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  25.39 
 
 
319 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  25.08 
 
 
302 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  25.97 
 
 
307 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  26.91 
 
 
309 aa  64.3  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  28.01 
 
 
309 aa  64.3  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2047  arginase  29.66 
 
 
306 aa  64.3  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.657503  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  28.04 
 
 
296 aa  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  29.1 
 
 
308 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  23.55 
 
 
316 aa  63.2  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  31.02 
 
 
351 aa  63.2  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  26.24 
 
 
398 aa  63.2  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  25.68 
 
 
321 aa  62.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0004  agmatinase  26.02 
 
 
290 aa  61.6  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  28.73 
 
 
315 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  27.87 
 
 
309 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  27.17 
 
 
307 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  26.13 
 
 
328 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5045  formimidoylglutamase  28.28 
 
 
329 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  28.52 
 
 
308 aa  60.5  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4425  Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase arginase family-like protein  28.69 
 
 
477 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  26.41 
 
 
346 aa  59.7  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1578  agmatinase  30.69 
 
 
318 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3024  putative agmatinase  26.89 
 
 
354 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197883  normal  0.651701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>