More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4137 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  100 
 
 
299 aa  584  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  83.95 
 
 
299 aa  504  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  67.46 
 
 
302 aa  382  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  58.86 
 
 
298 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  59.2 
 
 
308 aa  328  5.0000000000000004e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  53.18 
 
 
300 aa  323  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  55.85 
 
 
301 aa  319  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  52.01 
 
 
297 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  52.01 
 
 
297 aa  318  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  52.01 
 
 
297 aa  317  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  52.68 
 
 
297 aa  317  1e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  51.68 
 
 
297 aa  316  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  52.01 
 
 
297 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  52.01 
 
 
297 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  51.68 
 
 
297 aa  316  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  56.61 
 
 
306 aa  315  5e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  51.68 
 
 
297 aa  315  6e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  53.18 
 
 
299 aa  315  6e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  51.34 
 
 
297 aa  315  8e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  51.34 
 
 
297 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  52.98 
 
 
315 aa  311  7.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  54.03 
 
 
298 aa  305  7e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  53.2 
 
 
297 aa  305  8.000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  53.62 
 
 
298 aa  291  8e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  50.99 
 
 
301 aa  290  2e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  50.33 
 
 
302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  52.2 
 
 
303 aa  285  7e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  51.53 
 
 
296 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  50.5 
 
 
299 aa  275  7e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  49.17 
 
 
306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  49.16 
 
 
310 aa  258  9e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  45.33 
 
 
302 aa  256  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  45.33 
 
 
302 aa  256  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  48.01 
 
 
321 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  45.72 
 
 
306 aa  249  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  45.95 
 
 
351 aa  249  4e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  46.51 
 
 
305 aa  248  8e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  45.39 
 
 
306 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  45.51 
 
 
307 aa  246  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  46.82 
 
 
307 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  45.82 
 
 
306 aa  245  8e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  45.85 
 
 
304 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  46 
 
 
321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  46.82 
 
 
311 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  45.39 
 
 
311 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  44.37 
 
 
304 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  44.48 
 
 
307 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  45.42 
 
 
311 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  47.57 
 
 
341 aa  231  9e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  43.61 
 
 
307 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  45.03 
 
 
319 aa  229  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  42.72 
 
 
310 aa  222  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  46.62 
 
 
282 aa  222  7e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  44.63 
 
 
324 aa  220  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  42.05 
 
 
302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  44.26 
 
 
309 aa  218  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  43.87 
 
 
326 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  44.16 
 
 
331 aa  218  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  42.76 
 
 
325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  43.05 
 
 
309 aa  216  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  43.38 
 
 
327 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  43.69 
 
 
328 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  43.09 
 
 
309 aa  212  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  43.38 
 
 
309 aa  209  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  42.62 
 
 
328 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  42.72 
 
 
308 aa  209  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  42.72 
 
 
308 aa  209  6e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  37.35 
 
 
398 aa  208  1e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  40.85 
 
 
306 aa  206  5e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  41.04 
 
 
308 aa  205  6e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  40.52 
 
 
306 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  41.83 
 
 
318 aa  201  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  42.62 
 
 
322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  42.11 
 
 
308 aa  198  9e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  38.06 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  39.04 
 
 
301 aa  189  5.999999999999999e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  41.31 
 
 
308 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  41.31 
 
 
308 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  38.13 
 
 
309 aa  185  8e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  36.89 
 
 
324 aa  183  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  41.18 
 
 
308 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  35.86 
 
 
309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2047  arginase  39.67 
 
 
306 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.657503  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  43.23 
 
 
301 aa  172  7.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  32.69 
 
 
317 aa  167  1e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  40.27 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  36.49 
 
 
309 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  39.35 
 
 
306 aa  152  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.31 
 
 
316 aa  150  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.03 
 
 
315 aa  149  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.53 
 
 
309 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  36.18 
 
 
309 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.51 
 
 
319 aa  136  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  26.71 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  32.16 
 
 
324 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3869  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.32 
 
 
321 aa  112  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1296  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.86 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.925134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3988  agmatinase  32.45 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0861741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4346  Agmatinase  31.05 
 
 
478 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5245  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.32 
 
 
307 aa  108  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341043  normal  0.463568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>