More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0950 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0950  arginase  100 
 
 		 328 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  88.96 
 
 		 328 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  89.91 
 
 		 327 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  72.84 
 
 		 325 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  73.63 
 
 		 331 aa  462  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  71.02 
 
 		 324 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  69.65 
 
 		 326 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  57.28 
 
 		 322 aa  332  8e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  57.47 
 
 		 308 aa  328  7e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  57.47 
 
 		 308 aa  328  8e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  58.69 
 
 		 309 aa  326  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  53.07 
 
 		 311 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  53.72 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  52.12 
 
 		 311 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  53.31 
 
 		 310 aa  306  5.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  51.32 
 
 		 318 aa  295  5e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  48.87 
 
 		 306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  48.54 
 
 		 306 aa  282  7.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  47.1 
 
 		 308 aa  279  5e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  49.19 
 
 		 309 aa  276  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  48.72 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  48.22 
 
 		 309 aa  269  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  46.89 
 
 		 306 aa  268  8e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  49.68 
 
 		 308 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  49.03 
 
 		 308 aa  263  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  49.05 
 
 		 308 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  49.36 
 
 		 308 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2047  arginase  48.68 
 
 		 306 aa  259  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.657503  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  48.66 
 
 		 307 aa  255  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  47.06 
 
 		 306 aa  255  9e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  45.45 
 
 		 309 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  46.03 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  45.86 
 
 		 321 aa  245  8e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  46.67 
 
 		 310 aa  245  9e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  44.85 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  43.73 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  44.9 
 
 		 304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  44.92 
 
 		 302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  44.52 
 
 		 306 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  44.41 
 
 		 305 aa  232  8.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  45.93 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  43.67 
 
 		 306 aa  230  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  45.39 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  44.37 
 
 		 304 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  40.72 
 
 		 300 aa  225  6e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  41.51 
 
 		 315 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  43.56 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  45.72 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  42.11 
 
 		 296 aa  222  8e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  41.78 
 
 		 303 aa  221  9e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  42.86 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  45.33 
 
 		 282 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  38.54 
 
 		 299 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  41.97 
 
 		 298 aa  215  7e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  43.51 
 
 		 307 aa  215  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  38.69 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  38.69 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  38.69 
 
 		 297 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  38.69 
 
 		 297 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  38.69 
 
 		 297 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  38.69 
 
 		 297 aa  212  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  42.24 
 
 		 299 aa  212  7e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  38.69 
 
 		 297 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  39.02 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  41.23 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  41.58 
 
 		 298 aa  211  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  38.03 
 
 		 297 aa  210  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  38.03 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  42.62 
 
 		 299 aa  209  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  40.13 
 
 		 308 aa  206  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  40.66 
 
 		 301 aa  202  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  37.38 
 
 		 297 aa  202  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  39.61 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  36.63 
 
 		 297 aa  188  8e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  35.76 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  35.76 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  37.38 
 
 		 301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  35.95 
 
 		 302 aa  182  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  33.81 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  34.78 
 
 		 301 aa  155  9e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  34.93 
 
 		 398 aa  151  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  33.12 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  29.07 
 
 		 317 aa  128  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.97 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  29.94 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  29.24 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.59 
 
 		 316 aa  106  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.19 
 
 		 309 aa  106  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.8 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.63 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.08 
 
 		 315 aa  99.8  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  28.98 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  22.39 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  32.24 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0695  agmatinase  28.43 
 
 		 289 aa  93.2  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1315  agmatinase  27.52 
 
 		 285 aa  89.7  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3988  agmatinase  30.62 
 
 		 331 aa  89.4  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0861741 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21591  arginase  26.76 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2852  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.63 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2759  agmatinase  25.08 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>