More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1270 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  100 
 
 
306 aa  592  1e-168  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  59.32 
 
 
298 aa  342  4e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  58.86 
 
 
298 aa  330  2e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  56.29 
 
 
299 aa  317  2e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  55.93 
 
 
298 aa  317  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  56.61 
 
 
299 aa  315  5e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  58.11 
 
 
299 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  52.9 
 
 
303 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  53.58 
 
 
296 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  51.53 
 
 
297 aa  303  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  54.73 
 
 
302 aa  302  4.0000000000000003e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  51.52 
 
 
300 aa  298  8e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  50.34 
 
 
301 aa  297  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  51.51 
 
 
299 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  49.66 
 
 
297 aa  289  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  49.66 
 
 
297 aa  289  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  49.66 
 
 
297 aa  288  7e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  49.66 
 
 
297 aa  288  7e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  51.67 
 
 
315 aa  288  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  49.32 
 
 
297 aa  286  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  48.99 
 
 
297 aa  287  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  48.65 
 
 
297 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  48.65 
 
 
297 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  48.99 
 
 
297 aa  285  7e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  48.99 
 
 
297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  48.31 
 
 
297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  49.19 
 
 
308 aa  275  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  51.67 
 
 
302 aa  271  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  49.01 
 
 
301 aa  263  2e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  50.33 
 
 
306 aa  262  4e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  49.18 
 
 
319 aa  259  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  48.16 
 
 
307 aa  257  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  47.06 
 
 
311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  47.06 
 
 
311 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  46.56 
 
 
324 aa  251  9.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  47.32 
 
 
321 aa  248  9e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  41.56 
 
 
302 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  41.56 
 
 
302 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  45.98 
 
 
308 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  45.98 
 
 
308 aa  245  8e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  46.43 
 
 
309 aa  243  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  45.69 
 
 
331 aa  242  6e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  46.28 
 
 
310 aa  242  7e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  44.27 
 
 
307 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  45.57 
 
 
310 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  47.88 
 
 
322 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  44.15 
 
 
307 aa  238  8e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  48.87 
 
 
309 aa  238  8e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  43.19 
 
 
305 aa  238  9e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  45.02 
 
 
306 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  45.92 
 
 
351 aa  235  5.0000000000000005e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  45.02 
 
 
306 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  45.57 
 
 
327 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  44.22 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  44.7 
 
 
302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  46.53 
 
 
328 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  43.14 
 
 
321 aa  233  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  43.67 
 
 
311 aa  233  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  43.38 
 
 
304 aa  232  7.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  44.59 
 
 
308 aa  231  8.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  44.44 
 
 
325 aa  231  9e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  43.37 
 
 
326 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  46.58 
 
 
309 aa  229  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  43.52 
 
 
306 aa  229  5e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  43.14 
 
 
307 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  45.39 
 
 
328 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  43.71 
 
 
309 aa  228  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  41.35 
 
 
306 aa  227  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  45.13 
 
 
309 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  41.03 
 
 
306 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  46.05 
 
 
318 aa  225  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  44.37 
 
 
341 aa  222  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  45.07 
 
 
282 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  40.57 
 
 
306 aa  215  9e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  44.67 
 
 
308 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  40.53 
 
 
301 aa  209  7e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  44.19 
 
 
308 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  43.87 
 
 
308 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  44.44 
 
 
308 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2047  arginase  41.64 
 
 
306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.657503  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  45.42 
 
 
324 aa  198  7.999999999999999e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  35.76 
 
 
398 aa  191  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  38.23 
 
 
309 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  32.98 
 
 
317 aa  161  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.57 
 
 
316 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  34.36 
 
 
306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.03 
 
 
315 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  29.56 
 
 
314 aa  149  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  37.39 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  34.9 
 
 
309 aa  142  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  36.03 
 
 
309 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  39.11 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.69 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.65 
 
 
319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1296  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.2 
 
 
305 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.925134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3988  agmatinase  31.99 
 
 
331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0861741 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3869  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.39 
 
 
321 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1082  agmatinase  30.38 
 
 
396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193569  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4346  Agmatinase  34.36 
 
 
478 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  34.34 
 
 
345 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>