170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1296 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1296  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 
305 aa  626  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.925134 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4687  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  43.9 
 
 
300 aa  247  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1926  Arginase/agmatinase/formimino glutamase  36.18 
 
 
295 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3987  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.24 
 
 
395 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3606  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.06 
 
 
389 aa  172  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0938214 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0221  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  36.36 
 
 
330 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00735889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8299  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.62 
 
 
309 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5245  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.37 
 
 
307 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341043  normal  0.463568 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2768  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  36.03 
 
 
298 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0213  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  36.81 
 
 
362 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2669  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.61 
 
 
301 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0909707  normal  0.34784 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  30.03 
 
 
302 aa  119  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  28.9 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  31.2 
 
 
306 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  29.86 
 
 
299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  30.1 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  30.45 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  28.67 
 
 
301 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  29.69 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  29.86 
 
 
299 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  30.67 
 
 
307 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  27.55 
 
 
297 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  27.55 
 
 
297 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  27.55 
 
 
297 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  27.55 
 
 
297 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  29.26 
 
 
297 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  29.26 
 
 
297 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  27.21 
 
 
297 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  27.49 
 
 
297 aa  102  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  27.55 
 
 
297 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  27.55 
 
 
297 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.16 
 
 
309 aa  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  27.54 
 
 
301 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  28.27 
 
 
302 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  28.27 
 
 
302 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0654  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.61 
 
 
310 aa  99.8  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  29.69 
 
 
351 aa  98.6  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  31.88 
 
 
298 aa  98.2  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  28.04 
 
 
297 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  27.15 
 
 
315 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  29.96 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  30.94 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  30.49 
 
 
306 aa  93.2  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  27.52 
 
 
309 aa  92.4  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  29.22 
 
 
302 aa  91.3  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  28.1 
 
 
306 aa  87  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  27.16 
 
 
324 aa  87  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  24.75 
 
 
322 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  24.76 
 
 
302 aa  85.9  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  28.08 
 
 
303 aa  85.9  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  26.2 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  24.75 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  27.74 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  28.44 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  24.91 
 
 
304 aa  82.4  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  24.8 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  23.89 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  25.4 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  24.49 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  25.61 
 
 
311 aa  79  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  24.23 
 
 
398 aa  79  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  24.91 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  24.68 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  26.73 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  26.72 
 
 
325 aa  77  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  26.04 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  26.91 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  26.91 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  24.48 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  24.55 
 
 
315 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  23.86 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  25.97 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  22.6 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  26.56 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  23.86 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.64 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  27.46 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  25.63 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  24.4 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  25.11 
 
 
328 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  23.48 
 
 
316 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2309  formimidoylglutamase  25.24 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3402  formimidoylglutamase  26.42 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.786826  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  24.1 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3682  formimidoylglutamase  26.42 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  23.68 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  23.86 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.07 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3677  formimidoylglutamase  26.42 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.707468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3439  formimidoylglutamase  26.42 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3351  formimidoylglutamase  26.42 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  22.04 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3709  formimidoylglutamase  26.42 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545495  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  26.18 
 
 
308 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3659  formimidoylglutamase  26.42 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  26.9 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5626  Arginase/agmatinase/formimino glutamase  26.32 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  decreased coverage  0.00341242 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  24.75 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3757  formimidoylglutamase  26.58 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  23.16 
 
 
311 aa  67  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.27579 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>