157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2768 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2768  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 		 298 aa  585  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5245  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  80.47 
 
 		 307 aa  480  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341043  normal  0.463568 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4687  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.76 
 
 		 300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3606  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  40.69 
 
 		 389 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0938214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1296  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.47 
 
 		 305 aa  169  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.925134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3987  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  39.79 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1926  Arginase/agmatinase/formimino glutamase  37.79 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0654  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  38.46 
 
 		 310 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0221  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  39.79 
 
 		 330 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735889 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0213  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  39.46 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8299  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.56 
 
 		 309 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  31.91 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  31.32 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  28 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  28 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2669  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.15 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0909707  normal  0.34784 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  30.2 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  30.72 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  28.57 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  27.72 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  28.52 
 
 		 300 aa  99.4  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  32.2 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  27.43 
 
 		 310 aa  96.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  28.21 
 
 		 306 aa  97.1  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  26.79 
 
 		 297 aa  96.3  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  26.79 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.66 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  26.79 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  27.85 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  26.79 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  26.79 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  26.43 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  31.6 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  26.43 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  29.97 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  26.88 
 
 		 297 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  26.88 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  26.79 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  30.85 
 
 		 308 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  29.62 
 
 		 306 aa  92.4  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  27.76 
 
 		 306 aa  92.4  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  28.86 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  30.85 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  26.85 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  24.75 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  29.24 
 
 		 299 aa  89.7  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  26.58 
 
 		 304 aa  89.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  30.1 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.77 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  26.22 
 
 		 305 aa  88.2  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  27.8 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  30.1 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  25.81 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  27.06 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  27.46 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  25.81 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  29.09 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  27.97 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  29.01 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  30.19 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  26.74 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  28.21 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  29.66 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  28.76 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  25.41 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  25.27 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  27.76 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  26.95 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  28.28 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  28.12 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  26.33 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  30.26 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  28.21 
 
 		 301 aa  75.5  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  26.91 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  27.36 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  25.65 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  28.03 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  27.74 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.57 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  24.33 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  24.33 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  28.87 
 
 		 325 aa  68.9  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  27.65 
 
 		 327 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.23 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  22.19 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  23.21 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  28.03 
 
 		 341 aa  67  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  27.27 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2513  putative agmatinase  31.43 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  23.02 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  25.62 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  25.61 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  26.75 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  25.71 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  26.38 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  26.48 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4425  Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase arginase family-like protein  30.46 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2852  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.48 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  26.41 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  25 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>